RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.6■■■□□ 2.81
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.02■■■□□ 2.24
C9orf3-210ENST00000462125 ABCC9O60706 1549 aa28.74■■■□□ 2.19
C9orf3-210ENST00000462125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.5■■□□□ 1.99
C9orf3-210ENST00000462125 NACADO15069 1562 aa27.43■■□□□ 1.98
C9orf3-210ENST00000462125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.38■■□□□ 1.97
C9orf3-210ENST00000462125 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.22■■□□□ 1.95
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.21■■□□□ 1.95
C9orf3-210ENST00000462125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
C9orf3-210ENST00000462125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.97■■□□□ 1.91
C9orf3-210ENST00000462125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
C9orf3-210ENST00000462125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.8■■□□□ 1.88
C9orf3-210ENST00000462125 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.71■■□□□ 1.87
C9orf3-210ENST00000462125 SCRIBQ14160 1630 aa26.43■■□□□ 1.82
C9orf3-210ENST00000462125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.41■■□□□ 1.82
C9orf3-210ENST00000462125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
C9orf3-210ENST00000462125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf3-210ENST00000462125 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf3-210ENST00000462125 NCAPD3P42695 1498 aa25.39■■□□□ 1.65
C9orf3-210ENST00000462125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.31■■□□□ 1.64
C9orf3-210ENST00000462125 SMARCA4P51532 1647 aa25.3■■□□□ 1.64
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.28■■□□□ 1.64
C9orf3-210ENST00000462125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
C9orf3-210ENST00000462125 SMARCA2P51531 1590 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-210ENST00000462125 HMGXB3Q12766 1538 aa25.14■■□□□ 1.62
C9orf3-210ENST00000462125 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-210ENST00000462125 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-210ENST00000462125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
C9orf3-210ENST00000462125 NESP48681 1621 aa24.79■■□□□ 1.56
C9orf3-210ENST00000462125 WIZO95785 1651 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-210ENST00000462125 ERCC6Q03468 1493 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf3-210ENST00000462125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
C9orf3-210ENST00000462125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
C9orf3-210ENST00000462125 CUX2O14529 1486 aa24.66■■□□□ 1.54
C9orf3-210ENST00000462125 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf3-210ENST00000462125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.57■■□□□ 1.52
C9orf3-210ENST00000462125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
C9orf3-210ENST00000462125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
C9orf3-210ENST00000462125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.4■■□□□ 1.5
C9orf3-210ENST00000462125 CFTRP13569 1480 aa24.38■■□□□ 1.49
C9orf3-210ENST00000462125 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.29■■□□□ 1.48
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf3-210ENST00000462125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.27■■□□□ 1.48
C9orf3-210ENST00000462125 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.25■■□□□ 1.47
C9orf3-210ENST00000462125 WDR62O43379 1518 aa24.21■■□□□ 1.47
C9orf3-210ENST00000462125 TRIM41Q8WV44 630 aa24.06■■□□□ 1.44
C9orf3-210ENST00000462125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
C9orf3-210ENST00000462125 PRDM2Q13029 1718 aa24.01■■□□□ 1.43
C9orf3-210ENST00000462125 ABCC8Q09428 1581 aa23.87■■□□□ 1.41
C9orf3-210ENST00000462125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
C9orf3-210ENST00000462125 TOPBP1Q92547 1522 aa23.85■■□□□ 1.41
C9orf3-210ENST00000462125 IFT140Q96RY7 1462 aa23.79■■□□□ 1.4
C9orf3-210ENST00000462125 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.77■■□□□ 1.4
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
C9orf3-210ENST00000462125 OSCARQ8IYS5 282 aa23.67■■□□□ 1.38
C9orf3-210ENST00000462125 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
C9orf3-210ENST00000462125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
C9orf3-210ENST00000462125 SOGA1O94964 1423 aa23.58■■□□□ 1.36
C9orf3-210ENST00000462125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.366e-7■■■□□ 16.8
C9orf3-210ENST00000462125 CUX1P39880 1505 aa23.55■■□□□ 1.36
C9orf3-210ENST00000462125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.54■■□□□ 1.36
C9orf3-210ENST00000462125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf3-210ENST00000462125 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf3-210ENST00000462125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf3-210ENST00000462125 WDR97A6NE52 1622 aa23.39■■□□□ 1.33
C9orf3-210ENST00000462125 FBLN2P98095 1184 aa23.32■■□□□ 1.32
C9orf3-210ENST00000462125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
C9orf3-210ENST00000462125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.3■■□□□ 1.32
C9orf3-210ENST00000462125 GRIN2BQ13224 1484 aa23.3■■□□□ 1.32
C9orf3-210ENST00000462125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.28■■□□□ 1.32
C9orf3-210ENST00000462125 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 TOP2BQ02880 1626 aa23.26■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 CHD1O14646 1710 aa23.25■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 SYNJ1O43426 1573 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-210ENST00000462125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-210ENST00000462125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-210ENST00000462125 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGEF11O15085 1522 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf3-210ENST00000462125 SYNJ2O15056 1496 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf3-210ENST00000462125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.18■■□□□ 1.3
C9orf3-210ENST00000462125 PBRM1Q86U86 1689 aa23.11■■□□□ 1.29
C9orf3-210ENST00000462125 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.08■■□□□ 1.28
C9orf3-210ENST00000462125 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf3-210ENST00000462125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23■■□□□ 1.27
C9orf3-210ENST00000462125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf3-210ENST00000462125 GRIN2AQ12879 1464 aa22.98■■□□□ 1.27
C9orf3-210ENST00000462125 ARAP1Q96P48 1450 aa22.98■■□□□ 1.27
C9orf3-210ENST00000462125 ADAMTS12P58397 1594 aa22.97■■□□□ 1.27
C9orf3-210ENST00000462125 NUP160Q12769 1436 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-210ENST00000462125 IGF1RP08069 1367 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf3-210ENST00000462125 KIF27Q86VH2 1401 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf3-210ENST00000462125 CEP170Q5SW79 1584 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf3-210ENST00000462125 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
C9orf3-210ENST00000462125 JPH4Q96JJ6 628 aa22.76■■□□□ 1.23
C9orf3-210ENST00000462125 SHROOM2Q13796 1616 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf3-210ENST00000462125 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.72■■□□□ 1.23
C9orf3-210ENST00000462125 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.69■■□□□ 1.22
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