RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.11□□□□□ -0.47
RABGEF1-206ENST00000461017 IGF1RP08069 1367 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-206ENST00000461017 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP160Q12769 1436 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ARAP1Q96P48 1450 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGEF1-206ENST00000461017 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF27Q86VH2 1401 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-206ENST00000461017 CUL7Q14999 1698 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SHROOM2Q13796 1616 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-206ENST00000461017 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-206ENST00000461017 JPH4Q96JJ6 628 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-206ENST00000461017 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-206ENST00000461017 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-206ENST00000461017 PRXQ9BXM0 1461 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-206ENST00000461017 IQGAP2Q13576 1575 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-206ENST00000461017 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-206ENST00000461017 DISP1Q96F81 1524 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-206ENST00000461017 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-206ENST00000461017 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-206ENST00000461017 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0556O60303 1618 aa11.77□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRGP23470 1445 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 EEA1Q15075 1411 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.75□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.73□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF21BO75037 1637 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 P3H3Q8IVL6 736 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 UACAQ9BZF9 1416 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SAMD9Q5K651 1589 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPKBP1O60336 1514 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC2Q92887 1545 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA8O94911 1581 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPOAP1O95153 1857 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA3Q08378 1498 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DIP2BQ9P265 1576 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ASXL2Q76L83 1435 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ARID3CA6NKF2 412 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP10BO94823 1461 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 GLI2P10070 1586 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.52□□□□□ -0.56
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNH8Q96L42 1107 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-206ENST00000461017 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGEF1-206ENST00000461017 KDM6BO15054 1643 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CD109Q6YHK3 1445 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CLIP1P30622 1438 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 FMN1Q68DA7 1419 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 HECW1Q76N89 1606 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-206ENST00000461017 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF14Q15058 1648 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP162Q5TB80 1403 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-206ENST00000461017 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGEF1-206ENST00000461017 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-206ENST00000461017 RAPGEF3O95398 923 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGEF1-206ENST00000461017 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms