RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.26■□□□□ 0.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 SMARCA2P51531 1590 aa13.27□□□□□ -0.29
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RABGEF1-206ENST00000461017 ERCC6Q03468 1493 aa12.96□□□□□ -0.34
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RABGEF1-206ENST00000461017 CUX2O14529 1486 aa12.84□□□□□ -0.35
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RABGEF1-206ENST00000461017 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.79□□□□□ -0.36
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RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC8Q09428 1581 aa12.51□□□□□ -0.41
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RABGEF1-206ENST00000461017 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT140Q96RY7 1462 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.48□□□□□ -0.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.45□□□□□ -0.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 SOGA1O94964 1423 aa12.43□□□□□ -0.42
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR97A6NE52 1622 aa12.4□□□□□ -0.42
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNJ1O43426 1573 aa12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
RABGEF1-206ENST00000461017 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.38□□□□□ -0.43
RABGEF1-206ENST00000461017 TOP2BQ02880 1626 aa12.36□□□□□ -0.43
RABGEF1-206ENST00000461017 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.35□□□□□ -0.43
RABGEF1-206ENST00000461017 CHD1O14646 1710 aa12.34□□□□□ -0.43
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RABGEF1-206ENST00000461017 PBRM1Q86U86 1689 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-206ENST00000461017 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.27□□□□□ -0.44
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIN2BQ13224 1484 aa12.26□□□□□ -0.45
RABGEF1-206ENST00000461017 FBLN2P98095 1184 aa12.24□□□□□ -0.45
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-206ENST00000461017 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.2□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.2□□□□□ -0.46
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RABGEF1-206ENST00000461017 POTEDQ86YR6 584 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 SYNJ2O15056 1496 aa12.18□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS12P58397 1594 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF11O15085 1522 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.16□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM41Q8WV44 630 aa12.15□□□□□ -0.46
RABGEF1-206ENST00000461017 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.14□□□□□ -0.47
RABGEF1-206ENST00000461017 GRIN2AQ12879 1464 aa12.12□□□□□ -0.47
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP170Q5SW79 1584 aa12.11□□□□□ -0.47
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