RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 JPH4Q96JJ6 628 aa40.74■■■■■ 4.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.62■■■■■ 4.09
SH3BP5-208ENST00000459627 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
SH3BP5-208ENST00000459627 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.5■■■■■ 4.07
SH3BP5-208ENST00000459627 IQGAP2Q13576 1575 aa40.37■■■■■ 4.05
SH3BP5-208ENST00000459627 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
SH3BP5-208ENST00000459627 PRXQ9BXM0 1461 aa40.26■■■■■ 4.04
SH3BP5-208ENST00000459627 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.2■■■■■ 4.03
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
SH3BP5-208ENST00000459627 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.19■■■■■ 4.02
SH3BP5-208ENST00000459627 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.18■■■■■ 4.02
SH3BP5-208ENST00000459627 DISP1Q96F81 1524 aa40.16■■■■■ 4.02
SH3BP5-208ENST00000459627 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.15■■■■■ 4.02
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPRGP23470 1445 aa40.15■■■■■ 4.02
SH3BP5-208ENST00000459627 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.15■■■■■ 4.02
SH3BP5-208ENST00000459627 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.12■■■■■ 4.01
SH3BP5-208ENST00000459627 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.11■■■■■ 4.01
SH3BP5-208ENST00000459627 EEA1Q15075 1411 aa40.02■■■■■ 4
SH3BP5-208ENST00000459627 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
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SH3BP5-208ENST00000459627 ABCC2Q92887 1545 aa39.81■■■■□ 3.96
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SH3BP5-208ENST00000459627 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.78■■■■□ 3.96
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SH3BP5-208ENST00000459627 DIP2BQ9P265 1576 aa39.72■■■■□ 3.95
SH3BP5-208ENST00000459627 ASXL2Q76L83 1435 aa39.65■■■■□ 3.94
SH3BP5-208ENST00000459627 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.62■■■■□ 3.93
SH3BP5-208ENST00000459627 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
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SH3BP5-208ENST00000459627 ABCA8O94911 1581 aa39.59■■■■□ 3.93
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SH3BP5-208ENST00000459627 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
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SH3BP5-208ENST00000459627 KCNH8Q96L42 1107 aa39.3■■■■□ 3.88
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP10BO94823 1461 aa39.3■■■■□ 3.88
SH3BP5-208ENST00000459627 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.29■■■■□ 3.88
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SH3BP5-208ENST00000459627 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.22■■■■□ 3.87
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.17■■■■□ 3.86
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SH3BP5-208ENST00000459627 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.98■■■■□ 3.83
SH3BP5-208ENST00000459627 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.98■■■■□ 3.83
SH3BP5-208ENST00000459627 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
SH3BP5-208ENST00000459627 FMN1Q68DA7 1419 aa38.95■■■■□ 3.83
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.91■■■■□ 3.82
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SH3BP5-208ENST00000459627 HECW1Q76N89 1606 aa38.85■■■■□ 3.81
SH3BP5-208ENST00000459627 CLIP1P30622 1438 aa38.81■■■■□ 3.8
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.75■■■■□ 3.79
SH3BP5-208ENST00000459627 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SH3BP5-208ENST00000459627 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.7■■■■□ 3.79
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SH3BP5-208ENST00000459627 CEP162Q5TB80 1403 aa38.56■■■■□ 3.76
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SH3BP5-208ENST00000459627 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.54■■■■□ 3.76
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SH3BP5-208ENST00000459627 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.43■■■■□ 3.74
SH3BP5-208ENST00000459627 PLCH2O75038 1416 aa38.42■■■■□ 3.74
SH3BP5-208ENST00000459627 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.39■■■■□ 3.74
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.38■■■■□ 3.74
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRL1O94910 1474 aa38.38■■■■□ 3.73
SH3BP5-208ENST00000459627 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.35■■■■□ 3.73
SH3BP5-208ENST00000459627 RICTORQ6R327 1708 aa38.3■■■■□ 3.72
SH3BP5-208ENST00000459627 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.28■■■■□ 3.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.28■■■■□ 3.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.27■■■■□ 3.72
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