RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.62■■■■■ 6.98
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.18■■■■■ 5.94
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCC9O60706 1549 aa51.63■■■■■ 5.86
SH3BP5-208ENST00000459627 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.35■■■■■ 5.49
SH3BP5-208ENST00000459627 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.32■■■■■ 5.49
SH3BP5-208ENST00000459627 NACADO15069 1562 aa49.14■■■■■ 5.46
SH3BP5-208ENST00000459627 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.4
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.63■■■■■ 5.37
SH3BP5-208ENST00000459627 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.34■■■■■ 5.33
SH3BP5-208ENST00000459627 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.32■■■■■ 5.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.26■■■■■ 5.32
SH3BP5-208ENST00000459627 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.94■■■■■ 5.26
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.8■■■■■ 5.24
SH3BP5-208ENST00000459627 SCRIBQ14160 1630 aa47.8■■■■■ 5.24
SH3BP5-208ENST00000459627 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.13■■■■■ 5.13
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
SH3BP5-208ENST00000459627 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.61■■■■■ 5.05
SH3BP5-208ENST00000459627 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.34■■■■■ 5.01
SH3BP5-208ENST00000459627 SMARCA4P51532 1647 aa45.59■■■■■ 4.89
SH3BP5-208ENST00000459627 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.42■■■■■ 4.86
SH3BP5-208ENST00000459627 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
SH3BP5-208ENST00000459627 NCAPD3P42695 1498 aa45.37■■■■■ 4.85
SH3BP5-208ENST00000459627 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.28■■■■■ 4.84
SH3BP5-208ENST00000459627 SMARCA2P51531 1590 aa45.27■■■■■ 4.84
SH3BP5-208ENST00000459627 HMGXB3Q12766 1538 aa45.1■■■■■ 4.81
SH3BP5-208ENST00000459627 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
SH3BP5-208ENST00000459627 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.03■■■■■ 4.8
SH3BP5-208ENST00000459627 WIZO95785 1651 aa44.79■■■■■ 4.76
SH3BP5-208ENST00000459627 NESP48681 1621 aa44.6■■■■■ 4.73
SH3BP5-208ENST00000459627 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
SH3BP5-208ENST00000459627 ERCC6Q03468 1493 aa44.44■■■■■ 4.7
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.22■■■■■ 4.67
SH3BP5-208ENST00000459627 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
SH3BP5-208ENST00000459627 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.08■■■■■ 4.65
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44■■■■■ 4.63
SH3BP5-208ENST00000459627 CUX2O14529 1486 aa43.98■■■■■ 4.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.95■■■■■ 4.63
SH3BP5-208ENST00000459627 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.76■■■■■ 4.6
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.73■■■■■ 4.59
SH3BP5-208ENST00000459627 CFTRP13569 1480 aa43.73■■■■■ 4.59
SH3BP5-208ENST00000459627 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.62■■■■■ 4.57
SH3BP5-208ENST00000459627 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.57■■■■■ 4.57
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.57■■■■■ 4.56
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR62O43379 1518 aa43.42■■■■■ 4.54
SH3BP5-208ENST00000459627 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM2Q13029 1718 aa43.34■■■■■ 4.53
SH3BP5-208ENST00000459627 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
SH3BP5-208ENST00000459627 TOPBP1Q92547 1522 aa42.88■■■■■ 4.46
SH3BP5-208ENST00000459627 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.77■■■■■ 4.44
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCC8Q09428 1581 aa42.7■■■■■ 4.43
SH3BP5-208ENST00000459627 IFT140Q96RY7 1462 aa42.64■■■■■ 4.42
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
SH3BP5-208ENST00000459627 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
SH3BP5-208ENST00000459627 CUX1P39880 1505 aa42.47■■■■■ 4.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
SH3BP5-208ENST00000459627 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.42■■■■■ 4.38
SH3BP5-208ENST00000459627 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.37■■■■■ 4.37
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
SH3BP5-208ENST00000459627 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.34■■■■■ 4.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SOGA1O94964 1423 aa42.32■■■■■ 4.37
SH3BP5-208ENST00000459627 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
SH3BP5-208ENST00000459627 OSCARQ8IYS5 282 aa42.18■■■■■ 4.34
SH3BP5-208ENST00000459627 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.32
SH3BP5-208ENST00000459627 SYNJ1O43426 1573 aa42.01■■■■■ 4.32
SH3BP5-208ENST00000459627 WDR97A6NE52 1622 aa41.99■■■■■ 4.31
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM41Q8WV44 630 aa41.98■■■■■ 4.31
SH3BP5-208ENST00000459627 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.95■■■■■ 4.31
SH3BP5-208ENST00000459627 FBLN2P98095 1184 aa41.94■■■■■ 4.3
SH3BP5-208ENST00000459627 TOP2BQ02880 1626 aa41.94■■■■■ 4.3
SH3BP5-208ENST00000459627 CHD1O14646 1710 aa41.93■■■■■ 4.3
SH3BP5-208ENST00000459627 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.9■■■■■ 4.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.86■■■■■ 4.29
SH3BP5-208ENST00000459627 GRIN2BQ13224 1484 aa41.82■■■■■ 4.29
SH3BP5-208ENST00000459627 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.81■■■■■ 4.28
SH3BP5-208ENST00000459627 PBRM1Q86U86 1689 aa41.77■■■■■ 4.28
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.76■■■■■ 4.28
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
SH3BP5-208ENST00000459627 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
SH3BP5-208ENST00000459627 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
SH3BP5-208ENST00000459627 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
SH3BP5-208ENST00000459627 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
SH3BP5-208ENST00000459627 SYNJ2O15056 1496 aa41.58■■■■■ 4.25
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF11O15085 1522 aa41.52■■■■■ 4.24
SH3BP5-208ENST00000459627 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.4■■■■■ 4.22
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS12P58397 1594 aa41.4■■■■■ 4.22
SH3BP5-208ENST00000459627 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.33■■■■■ 4.21
SH3BP5-208ENST00000459627 GRIN2AQ12879 1464 aa41.3■■■■■ 4.2
SH3BP5-208ENST00000459627 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.28■■■■■ 4.2
SH3BP5-208ENST00000459627 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.24■■■■■ 4.19
SH3BP5-208ENST00000459627 ARAP1Q96P48 1450 aa41.2■■■■■ 4.19
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP170Q5SW79 1584 aa41.17■■■■■ 4.18
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF27Q86VH2 1401 aa41.13■■■■■ 4.17
SH3BP5-208ENST00000459627 NUP160Q12769 1436 aa41.1■■■■■ 4.17
SH3BP5-208ENST00000459627 IGF1RP08069 1367 aa41.07■■■■■ 4.16
SH3BP5-208ENST00000459627 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.96■■■■■ 4.15
SH3BP5-208ENST00000459627 CUL7Q14999 1698 aa40.88■■■■■ 4.14
SH3BP5-208ENST00000459627 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.87■■■■■ 4.13
SH3BP5-208ENST00000459627 SHROOM2Q13796 1616 aa40.82■■■■■ 4.13
SH3BP5-208ENST00000459627 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.82■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms