RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
PPP1CB-208ENST00000455580 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.25■■■■■ 4.19
PPP1CB-208ENST00000455580 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.24■■■■■ 4.19
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.19■■■■■ 4.18
PPP1CB-208ENST00000455580 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.91■■■■■ 4.14
PPP1CB-208ENST00000455580 IQGAP2Q13576 1575 aa40.79■■■■■ 4.12
PPP1CB-208ENST00000455580 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.76■■■■■ 4.12
PPP1CB-208ENST00000455580 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.12
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRGP23470 1445 aa40.74■■■■■ 4.11
PPP1CB-208ENST00000455580 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.71■■■■■ 4.11
PPP1CB-208ENST00000455580 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.68■■■■■ 4.1
PPP1CB-208ENST00000455580 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
PPP1CB-208ENST00000455580 PRXQ9BXM0 1461 aa40.62■■■■■ 4.09
PPP1CB-208ENST00000455580 DISP1Q96F81 1524 aa40.62■■■■■ 4.09
PPP1CB-208ENST00000455580 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.59■■■■■ 4.09
PPP1CB-208ENST00000455580 MAPKBP1O60336 1514 aa40.57■■■■■ 4.08
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.51■■■■■ 4.07
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.51■■■■■ 4.07
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.5■■■■■ 4.07
PPP1CB-208ENST00000455580 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.49■■■■■ 4.07
PPP1CB-208ENST00000455580 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.43■■■■■ 4.06
PPP1CB-208ENST00000455580 UACAQ9BZF9 1416 aa40.42■■■■■ 4.06
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA0556O60303 1618 aa40.42■■■■■ 4.06
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC2Q92887 1545 aa40.42■■■■■ 4.06
PPP1CB-208ENST00000455580 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.41■■■■■ 4.06
PPP1CB-208ENST00000455580 DIP2BQ9P265 1576 aa40.35■■■■■ 4.05
PPP1CB-208ENST00000455580 EEA1Q15075 1411 aa40.34■■■■■ 4.05
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA3Q08378 1498 aa40.32■■■■■ 4.04
PPP1CB-208ENST00000455580 ASXL2Q76L83 1435 aa40.24■■■■■ 4.03
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP1CB-208ENST00000455580 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP1CB-208ENST00000455580 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.18■■■■■ 4.02
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
PPP1CB-208ENST00000455580 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
PPP1CB-208ENST00000455580 P3H3Q8IVL6 736 aa40.06■■■■■ 4
PPP1CB-208ENST00000455580 GLI2P10070 1586 aa40.06■■■■■ 4
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCA8O94911 1581 aa40.05■■■■■ 4
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPOAP1O95153 1857 aa40.01■■■■■ 4
PPP1CB-208ENST00000455580 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
PPP1CB-208ENST00000455580 SAMD9Q5K651 1589 aa39.94■■■■□ 3.98
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF21BO75037 1637 aa39.92■■■■□ 3.98
PPP1CB-208ENST00000455580 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.9■■■■□ 3.98
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM6BO15054 1643 aa39.87■■■■□ 3.97
PPP1CB-208ENST00000455580 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
PPP1CB-208ENST00000455580 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.8■■■■□ 3.96
PPP1CB-208ENST00000455580 KCNH8Q96L42 1107 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP10BO94823 1461 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP1CB-208ENST00000455580 ARID3CA6NKF2 412 aa39.76■■■■□ 3.96
PPP1CB-208ENST00000455580 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
PPP1CB-208ENST00000455580 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.72■■■■□ 3.95
PPP1CB-208ENST00000455580 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
PPP1CB-208ENST00000455580 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP1CB-208ENST00000455580 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.7■■■■□ 3.95
PPP1CB-208ENST00000455580 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.69■■■■□ 3.94
PPP1CB-208ENST00000455580 CD109Q6YHK3 1445 aa39.65■■■■□ 3.94
PPP1CB-208ENST00000455580 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.65■■■■□ 3.94
PPP1CB-208ENST00000455580 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
PPP1CB-208ENST00000455580 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.58■■■■□ 3.93
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
PPP1CB-208ENST00000455580 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.58■■■■□ 3.93
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
PPP1CB-208ENST00000455580 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.41■■■■□ 3.9
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.4■■■■□ 3.9
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.39■■■■□ 3.9
PPP1CB-208ENST00000455580 FMN1Q68DA7 1419 aa39.34■■■■□ 3.89
PPP1CB-208ENST00000455580 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.28■■■■□ 3.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.26■■■■□ 3.88
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
PPP1CB-208ENST00000455580 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
PPP1CB-208ENST00000455580 NEO1Q92859 1461 aa39.18■■■■□ 3.86
PPP1CB-208ENST00000455580 HECW1Q76N89 1606 aa39.14■■■■□ 3.86
PPP1CB-208ENST00000455580 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.851e-15■■□□□ 13.7
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRL1O94910 1474 aa39.1■■■■□ 3.85
PPP1CB-208ENST00000455580 RAPGEF3O95398 923 aa39.09■■■■□ 3.85
PPP1CB-208ENST00000455580 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
PPP1CB-208ENST00000455580 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.01■■■■□ 3.84
PPP1CB-208ENST00000455580 AKNAQ7Z591 1439 aa39■■■■□ 3.83
PPP1CB-208ENST00000455580 FANCAO15360 1455 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP1CB-208ENST00000455580 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP1CB-208ENST00000455580 CLIP1P30622 1438 aa38.96■■■■□ 3.83
PPP1CB-208ENST00000455580 PLCH2O75038 1416 aa38.94■■■■□ 3.82
PPP1CB-208ENST00000455580 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
PPP1CB-208ENST00000455580 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
PPP1CB-208ENST00000455580 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP1CB-208ENST00000455580 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.9■■■■□ 3.82
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.89■■■■□ 3.82
PPP1CB-208ENST00000455580 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.84■■■■□ 3.81
PPP1CB-208ENST00000455580 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.82■■■■□ 3.8
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF14Q15058 1648 aa38.81■■■■□ 3.8
PPP1CB-208ENST00000455580 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.79■■■■□ 3.8
PPP1CB-208ENST00000455580 RICTORQ6R327 1708 aa38.78■■■■□ 3.8
PPP1CB-208ENST00000455580 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.74■■■■□ 3.79
PPP1CB-208ENST00000455580 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.68■■■■□ 3.78
PPP1CB-208ENST00000455580 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.66■■■■□ 3.78
PPP1CB-208ENST00000455580 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms