RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.3■■■■■ 7.08
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.88■■■■■ 6.06
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC9O60706 1549 aa52.44■■■■■ 5.98
PPP1CB-208ENST00000455580 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.13■■■■■ 5.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NACADO15069 1562 aa49.94■■■■■ 5.59
PPP1CB-208ENST00000455580 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.89■■■■■ 5.58
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.47■■■■■ 5.51
PPP1CB-208ENST00000455580 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
PPP1CB-208ENST00000455580 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.02■■■■■ 5.44
PPP1CB-208ENST00000455580 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.97■■■■■ 5.43
PPP1CB-208ENST00000455580 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.92■■■■■ 5.42
PPP1CB-208ENST00000455580 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.82■■■■■ 5.41
PPP1CB-208ENST00000455580 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.66■■■■■ 5.38
PPP1CB-208ENST00000455580 SCRIBQ14160 1630 aa48.23■■■■■ 5.31
PPP1CB-208ENST00000455580 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.07■■■■■ 5.29
PPP1CB-208ENST00000455580 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
PPP1CB-208ENST00000455580 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.38■■■■■ 5.17
PPP1CB-208ENST00000455580 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.2■■■■■ 5.15
PPP1CB-208ENST00000455580 NCAPD3P42695 1498 aa46.15■■■■■ 4.98
PPP1CB-208ENST00000455580 SMARCA4P51532 1647 aa46.09■■■■■ 4.97
PPP1CB-208ENST00000455580 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.07■■■■■ 4.97
PPP1CB-208ENST00000455580 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
PPP1CB-208ENST00000455580 SMARCA2P51531 1590 aa45.92■■■■■ 4.94
PPP1CB-208ENST00000455580 HMGXB3Q12766 1538 aa45.78■■■■■ 4.92
PPP1CB-208ENST00000455580 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.69■■■■■ 4.9
PPP1CB-208ENST00000455580 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.67■■■■■ 4.9
PPP1CB-208ENST00000455580 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
PPP1CB-208ENST00000455580 ERCC6Q03468 1493 aa45.22■■■■■ 4.83
PPP1CB-208ENST00000455580 NESP48681 1621 aa45.2■■■■■ 4.83
PPP1CB-208ENST00000455580 WIZO95785 1651 aa45.12■■■■■ 4.81
PPP1CB-208ENST00000455580 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
PPP1CB-208ENST00000455580 CUX2O14529 1486 aa44.98■■■■■ 4.79
PPP1CB-208ENST00000455580 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.95■■■■■ 4.79
PPP1CB-208ENST00000455580 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.79■■■■■ 4.76
PPP1CB-208ENST00000455580 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.74■■■■■ 4.75
PPP1CB-208ENST00000455580 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
PPP1CB-208ENST00000455580 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.55■■■■■ 4.72
PPP1CB-208ENST00000455580 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.44■■■■■ 4.7
PPP1CB-208ENST00000455580 CFTRP13569 1480 aa44.36■■■■■ 4.69
PPP1CB-208ENST00000455580 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.27■■■■■ 4.68
PPP1CB-208ENST00000455580 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.22■■■■■ 4.67
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.2■■■■■ 4.67
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.16■■■■■ 4.66
PPP1CB-208ENST00000455580 WDR62O43379 1518 aa44.13■■■■■ 4.65
PPP1CB-208ENST00000455580 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
PPP1CB-208ENST00000455580 PRDM2Q13029 1718 aa43.81■■■■■ 4.6
PPP1CB-208ENST00000455580 TOPBP1Q92547 1522 aa43.44■■■■■ 4.54
PPP1CB-208ENST00000455580 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC8Q09428 1581 aa43.41■■■■■ 4.54
PPP1CB-208ENST00000455580 IFT140Q96RY7 1462 aa43.32■■■■■ 4.53
PPP1CB-208ENST00000455580 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.3■■■■■ 4.52
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
PPP1CB-208ENST00000455580 OSCARQ8IYS5 282 aa43.11■■■■■ 4.49
PPP1CB-208ENST00000455580 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
PPP1CB-208ENST00000455580 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
PPP1CB-208ENST00000455580 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
PPP1CB-208ENST00000455580 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.463e-8■■■■□ 22.1
PPP1CB-208ENST00000455580 SOGA1O94964 1423 aa42.89■■■■■ 4.46
PPP1CB-208ENST00000455580 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.88■■■■■ 4.46
PPP1CB-208ENST00000455580 CUX1P39880 1505 aa42.88■■■■■ 4.46
PPP1CB-208ENST00000455580 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.83■■■■■ 4.45
PPP1CB-208ENST00000455580 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM41Q8WV44 630 aa42.65■■■■■ 4.42
PPP1CB-208ENST00000455580 WDR97A6NE52 1622 aa42.58■■■■■ 4.41
PPP1CB-208ENST00000455580 FBLN2P98095 1184 aa42.53■■■■■ 4.4
PPP1CB-208ENST00000455580 CHD1O14646 1710 aa42.47■■■■■ 4.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.43■■■■■ 4.38
PPP1CB-208ENST00000455580 GRIN2BQ13224 1484 aa42.43■■■■■ 4.38
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.41■■■■■ 4.38
PPP1CB-208ENST00000455580 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
PPP1CB-208ENST00000455580 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.36■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 TOP2BQ02880 1626 aa42.33■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF11O15085 1522 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP1CB-208ENST00000455580 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP1CB-208ENST00000455580 SYNJ1O43426 1573 aa42.28■■■■■ 4.36
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.23■■■■■ 4.35
PPP1CB-208ENST00000455580 SYNJ2O15056 1496 aa42.22■■■■■ 4.35
PPP1CB-208ENST00000455580 PBRM1Q86U86 1689 aa42.19■■■■■ 4.34
PPP1CB-208ENST00000455580 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.06■■■■■ 4.32
PPP1CB-208ENST00000455580 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.05■■■■■ 4.32
PPP1CB-208ENST00000455580 ARAP1Q96P48 1450 aa41.93■■■■■ 4.3
PPP1CB-208ENST00000455580 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.87■■■■■ 4.29
PPP1CB-208ENST00000455580 GRIN2AQ12879 1464 aa41.86■■■■■ 4.29
PPP1CB-208ENST00000455580 ADAMTS12P58397 1594 aa41.86■■■■■ 4.29
PPP1CB-208ENST00000455580 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.86■■■■■ 4.29
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP160Q12769 1436 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP170Q5SW79 1584 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF27Q86VH2 1401 aa41.56■■■■■ 4.24
PPP1CB-208ENST00000455580 IGF1RP08069 1367 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP1CB-208ENST00000455580 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.45■■■■■ 4.23
PPP1CB-208ENST00000455580 SHROOM2Q13796 1616 aa41.43■■■■■ 4.22
PPP1CB-208ENST00000455580 JPH4Q96JJ6 628 aa41.39■■■■■ 4.22
PPP1CB-208ENST00000455580 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
PPP1CB-208ENST00000455580 CUL7Q14999 1698 aa41.31■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms