RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452779.2

CSAG1-204, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-204ENST00000452779 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.24■■□□□ 1.31
CSAG1-204ENST00000452779 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.22■■□□□ 1.31
CSAG1-204ENST00000452779 JPH4Q96JJ6 628 aa23.21■■□□□ 1.31
CSAG1-204ENST00000452779 EEA1Q15075 1411 aa23.18■■□□□ 1.3
CSAG1-204ENST00000452779 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CSAG1-204ENST00000452779 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.15■■□□□ 1.3
CSAG1-204ENST00000452779 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.14■■□□□ 1.3
CSAG1-204ENST00000452779 PRXQ9BXM0 1461 aa23.11■■□□□ 1.29
CSAG1-204ENST00000452779 IQGAP2Q13576 1575 aa23.1■■□□□ 1.29
CSAG1-204ENST00000452779 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CSAG1-204ENST00000452779 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.08■■□□□ 1.29
CSAG1-204ENST00000452779 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG1-204ENST00000452779 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.95■■□□□ 1.26
CSAG1-204ENST00000452779 KIF21BO75037 1637 aa22.93■■□□□ 1.26
CSAG1-204ENST00000452779 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.9■■□□□ 1.26
CSAG1-204ENST00000452779 PTPRGP23470 1445 aa22.9■■□□□ 1.26
CSAG1-204ENST00000452779 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CSAG1-204ENST00000452779 DISP1Q96F81 1524 aa22.89■■□□□ 1.26
CSAG1-204ENST00000452779 GOLGA3Q08378 1498 aa22.88■■□□□ 1.25
CSAG1-204ENST00000452779 KIAA0556O60303 1618 aa22.86■■□□□ 1.25
CSAG1-204ENST00000452779 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
CSAG1-204ENST00000452779 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
CSAG1-204ENST00000452779 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.79■■□□□ 1.24
CSAG1-204ENST00000452779 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CSAG1-204ENST00000452779 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.79■■□□□ 1.24
CSAG1-204ENST00000452779 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CSAG1-204ENST00000452779 UACAQ9BZF9 1416 aa22.74■■□□□ 1.23
CSAG1-204ENST00000452779 P3H3Q8IVL6 736 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG1-204ENST00000452779 SAMD9Q5K651 1589 aa22.71■■□□□ 1.23
CSAG1-204ENST00000452779 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG1-204ENST00000452779 ABCC2Q92887 1545 aa22.68■■□□□ 1.22
CSAG1-204ENST00000452779 MAPKBP1O60336 1514 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG1-204ENST00000452779 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG1-204ENST00000452779 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG1-204ENST00000452779 ABCA8O94911 1581 aa22.6■■□□□ 1.21
CSAG1-204ENST00000452779 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.59■■□□□ 1.21
CSAG1-204ENST00000452779 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.58■■□□□ 1.21
CSAG1-204ENST00000452779 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CSAG1-204ENST00000452779 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.57■■□□□ 1.2
CSAG1-204ENST00000452779 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG1-204ENST00000452779 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG1-204ENST00000452779 ASXL2Q76L83 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG1-204ENST00000452779 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG1-204ENST00000452779 DIP2BQ9P265 1576 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG1-204ENST00000452779 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
CSAG1-204ENST00000452779 ARID3CA6NKF2 412 aa22.45■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 FMN1Q68DA7 1419 aa22.44■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 TSPOAP1O95153 1857 aa22.43■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.42■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 ATP10BO94823 1461 aa22.41■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 GLI2P10070 1586 aa22.4■■□□□ 1.18
CSAG1-204ENST00000452779 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CSAG1-204ENST00000452779 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CSAG1-204ENST00000452779 CLIP1P30622 1438 aa22.38■■□□□ 1.17
CSAG1-204ENST00000452779 KCNH8Q96L42 1107 aa22.37■■□□□ 1.17
CSAG1-204ENST00000452779 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CSAG1-204ENST00000452779 HECW1Q76N89 1606 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG1-204ENST00000452779 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG1-204ENST00000452779 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.31■■□□□ 1.16
CSAG1-204ENST00000452779 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG1-204ENST00000452779 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.29■■□□□ 1.16
CSAG1-204ENST00000452779 CEP162Q5TB80 1403 aa22.26■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.24■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 CD109Q6YHK3 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.23■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 KDM6BO15054 1643 aa22.2■■□□□ 1.15
CSAG1-204ENST00000452779 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG1-204ENST00000452779 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.2■■□□□ 1.14
CSAG1-204ENST00000452779 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.19■■□□□ 1.14
CSAG1-204ENST00000452779 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.18■■□□□ 1.14
CSAG1-204ENST00000452779 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.17■■□□□ 1.14
CSAG1-204ENST00000452779 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CSAG1-204ENST00000452779 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CSAG1-204ENST00000452779 KIF14Q15058 1648 aa22.07■■□□□ 1.12
CSAG1-204ENST00000452779 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.05■■□□□ 1.12
CSAG1-204ENST00000452779 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.05■■□□□ 1.12
CSAG1-204ENST00000452779 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.03■■□□□ 1.12
CSAG1-204ENST00000452779 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.02■■□□□ 1.12
CSAG1-204ENST00000452779 NEO1Q92859 1461 aa22.02■■□□□ 1.12
CSAG1-204ENST00000452779 VPS8Q8N3P4 1428 aa22■■□□□ 1.11
CSAG1-204ENST00000452779 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CSAG1-204ENST00000452779 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.98■■□□□ 1.11
CSAG1-204ENST00000452779 FANCAO15360 1455 aa21.97■■□□□ 1.11
CSAG1-204ENST00000452779 PLCH2O75038 1416 aa21.97■■□□□ 1.11
CSAG1-204ENST00000452779 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.96■■□□□ 1.11
CSAG1-204ENST00000452779 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.93■■□□□ 1.1
CSAG1-204ENST00000452779 AKNAQ7Z591 1439 aa21.93■■□□□ 1.1
CSAG1-204ENST00000452779 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.9■■□□□ 1.1
CSAG1-204ENST00000452779 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.89■■□□□ 1.1
CSAG1-204ENST00000452779 TIAM1Q13009 1591 aa21.89■■□□□ 1.09
CSAG1-204ENST00000452779 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.89■■□□□ 1.09
CSAG1-204ENST00000452779 PREX2Q70Z35 1606 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAG1-204ENST00000452779 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.88■■□□□ 1.09
CSAG1-204ENST00000452779 RAPGEF3O95398 923 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms