RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448310.1

CBX4-202, Transcript of chromobox 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CBX4, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-202ENST00000448310 IGF1RP08069 1367 aa49.42■■■■■ 5.5
CBX4-202ENST00000448310 CUL7Q14999 1698 aa49.37■■■■■ 5.49
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CBX4-202ENST00000448310 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.1■■■■■ 5.45
CBX4-202ENST00000448310 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.1■■■■■ 5.45
CBX4-202ENST00000448310 ADCY10Q96PN6 1610 aa49■■■■■ 5.43
CBX4-202ENST00000448310 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.91■■■■■ 5.42
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CBX4-202ENST00000448310 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.8■■■■■ 5.4
CBX4-202ENST00000448310 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.77■■■■■ 5.4
CBX4-202ENST00000448310 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.77■■■■■ 5.4
CBX4-202ENST00000448310 PTPRGP23470 1445 aa48.75■■■■■ 5.4
CBX4-202ENST00000448310 DIP2BQ9P265 1576 aa48.73■■■■■ 5.39
CBX4-202ENST00000448310 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.72■■■■■ 5.39
CBX4-202ENST00000448310 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.67■■■■■ 5.38
CBX4-202ENST00000448310 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.66■■■■■ 5.38
CBX4-202ENST00000448310 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
CBX4-202ENST00000448310 DISP1Q96F81 1524 aa48.57■■■■■ 5.37
CBX4-202ENST00000448310 ABCC2Q92887 1545 aa48.49■■■■■ 5.35
CBX4-202ENST00000448310 TSPOAP1O95153 1857 aa48.49■■■■■ 5.35
CBX4-202ENST00000448310 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.48■■■■■ 5.35
CBX4-202ENST00000448310 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.39■■■■■ 5.34
CBX4-202ENST00000448310 UACAQ9BZF9 1416 aa48.39■■■■■ 5.34
CBX4-202ENST00000448310 KIAA0556O60303 1618 aa48.38■■■■■ 5.34
CBX4-202ENST00000448310 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.37■■■■■ 5.33
CBX4-202ENST00000448310 ASXL2Q76L83 1435 aa48.32■■■■■ 5.33
CBX4-202ENST00000448310 KDM6BO15054 1643 aa48.29■■■■■ 5.32
CBX4-202ENST00000448310 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.26■■■■■ 5.32
CBX4-202ENST00000448310 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.19■■■■■ 5.31
CBX4-202ENST00000448310 PRXQ9BXM0 1461 aa48.19■■■■■ 5.31
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CBX4-202ENST00000448310 GLI2P10070 1586 aa48.17■■■■■ 5.3
CBX4-202ENST00000448310 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
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CBX4-202ENST00000448310 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.04■■■■■ 5.28
CBX4-202ENST00000448310 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.96■■■■■ 5.27
CBX4-202ENST00000448310 ABCA8O94911 1581 aa47.92■■■■■ 5.26
CBX4-202ENST00000448310 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.86■■■■■ 5.25
CBX4-202ENST00000448310 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.84■■■■■ 5.25
CBX4-202ENST00000448310 P3H3Q8IVL6 736 aa47.75■■■■■ 5.23
CBX4-202ENST00000448310 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.23
CBX4-202ENST00000448310 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.74■■■■■ 5.23
CBX4-202ENST00000448310 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.74■■■■■ 5.23
CBX4-202ENST00000448310 KCNH8Q96L42 1107 aa47.65■■■■■ 5.22
CBX4-202ENST00000448310 SAMD9Q5K651 1589 aa47.63■■■■■ 5.22
CBX4-202ENST00000448310 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.61■■■■■ 5.21
CBX4-202ENST00000448310 ARID3CA6NKF2 412 aa47.61■■■■■ 5.21
CBX4-202ENST00000448310 EEA1Q15075 1411 aa47.61■■■■■ 5.21
CBX4-202ENST00000448310 CD109Q6YHK3 1445 aa47.56■■■■■ 5.2
CBX4-202ENST00000448310 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
CBX4-202ENST00000448310 ATP10BO94823 1461 aa47.51■■■■■ 5.2
CBX4-202ENST00000448310 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.51■■■■■ 5.2
CBX4-202ENST00000448310 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.47■■■■■ 5.19
CBX4-202ENST00000448310 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.45■■■■■ 5.19
CBX4-202ENST00000448310 ADGRL1O94910 1474 aa47.4■■■■■ 5.18
CBX4-202ENST00000448310 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.33■■■■■ 5.17
CBX4-202ENST00000448310 KIF21BO75037 1637 aa47.32■■■■■ 5.17
CBX4-202ENST00000448310 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.26■■■■■ 5.16
CBX4-202ENST00000448310 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
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CBX4-202ENST00000448310 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
CBX4-202ENST00000448310 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.13■■■■■ 5.14
CBX4-202ENST00000448310 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.13■■■■■ 5.14
CBX4-202ENST00000448310 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.1■■■■■ 5.13
CBX4-202ENST00000448310 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.07■■■■■ 5.13
CBX4-202ENST00000448310 PHLDB1Q86UU1 1377 aa46.97■■■■■ 5.11
CBX4-202ENST00000448310 NEO1Q92859 1461 aa46.95■■■■■ 5.11
CBX4-202ENST00000448310 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
CBX4-202ENST00000448310 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.93■■■■■ 5.1
CBX4-202ENST00000448310 RAPGEF3O95398 923 aa46.9■■■■■ 5.1
CBX4-202ENST00000448310 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
CBX4-202ENST00000448310 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.83■■■■■ 5.09
CBX4-202ENST00000448310 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.81■■■■■ 5.082e-7■■■□□ 18.4
CBX4-202ENST00000448310 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.78■■■■■ 5.08
CBX4-202ENST00000448310 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.77■■■■■ 5.08
CBX4-202ENST00000448310 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.74■■■■■ 5.07
CBX4-202ENST00000448310 FANCAO15360 1455 aa46.7■■■■■ 5.07
CBX4-202ENST00000448310 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 FMN1Q68DA7 1419 aa46.69■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 HECW1Q76N89 1606 aa46.68■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 AKNAQ7Z591 1439 aa46.68■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.68■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 RICTORQ6R327 1708 aa46.67■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
CBX4-202ENST00000448310 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.6■■■■■ 5.05
CBX4-202ENST00000448310 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.55■■■■■ 5.04
CBX4-202ENST00000448310 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.53■■■■■ 5.04
CBX4-202ENST00000448310 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
CBX4-202ENST00000448310 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.49■■■■■ 5.03
CBX4-202ENST00000448310 PLCH2O75038 1416 aa46.46■■■■■ 5.03
CBX4-202ENST00000448310 PTPRMP28827 1452 aa46.46■■■■■ 5.03
CBX4-202ENST00000448310 KIF14Q15058 1648 aa46.45■■■■■ 5.03
CBX4-202ENST00000448310 MYO5CQ9NQX4 1742 aa46.45■■■■■ 5.03
CBX4-202ENST00000448310 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.44■■■■■ 5.02
CBX4-202ENST00000448310 MADDQ8WXG6 1647 aa46.43■■■■■ 5.02
CBX4-202ENST00000448310 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
CBX4-202ENST00000448310 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.37■■■■■ 5.01
CBX4-202ENST00000448310 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.37■■■■■ 5.01
CBX4-202ENST00000448310 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
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