RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446281.5

LMCD1-AS1-204, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 932 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NUP160Q12769 1436 aa31.32■■■□□ 2.6
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LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CEP162Q5TB80 1403 aa31.22■■■□□ 2.59
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 IQGAP2Q13576 1575 aa31.19■■■□□ 2.58
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LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.07■■■□□ 2.56
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LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.72■■■□□ 2.35
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.71■■■□□ 2.35
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.69■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PLCH2O75038 1416 aa29.66■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PREX2Q70Z35 1606 aa29.66■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GLI2P10070 1586 aa29.65■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.65■■■□□ 2.34
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.63■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DIP2BQ9P265 1576 aa29.62■■■□□ 2.33
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