RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
SRP19-202ENST00000445150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
SRP19-202ENST00000445150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.12■■■□□ 2.25
SRP19-202ENST00000445150 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
SRP19-202ENST00000445150 SHROOM2Q13796 1616 aa29.02■■■□□ 2.24
SRP19-202ENST00000445150 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SRP19-202ENST00000445150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.99■■■□□ 2.23
SRP19-202ENST00000445150 IQGAP2Q13576 1575 aa28.96■■■□□ 2.23
SRP19-202ENST00000445150 ARAP1Q96P48 1450 aa28.93■■■□□ 2.22
SRP19-202ENST00000445150 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.91■■■□□ 2.22
SRP19-202ENST00000445150 KIF21BO75037 1637 aa28.89■■■□□ 2.22
SRP19-202ENST00000445150 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.84■■■□□ 2.21
SRP19-202ENST00000445150 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.84■■■□□ 2.21
SRP19-202ENST00000445150 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.82■■■□□ 2.2
SRP19-202ENST00000445150 GOLGA3Q08378 1498 aa28.78■■■□□ 2.2
SRP19-202ENST00000445150 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SRP19-202ENST00000445150 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.75■■■□□ 2.19
SRP19-202ENST00000445150 PTPRGP23470 1445 aa28.72■■■□□ 2.19
SRP19-202ENST00000445150 DISP1Q96F81 1524 aa28.7■■■□□ 2.19
SRP19-202ENST00000445150 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.67■■■□□ 2.18
SRP19-202ENST00000445150 KIAA0556O60303 1618 aa28.65■■■□□ 2.18
SRP19-202ENST00000445150 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SRP19-202ENST00000445150 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
SRP19-202ENST00000445150 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SRP19-202ENST00000445150 P3H3Q8IVL6 736 aa28.53■■■□□ 2.16
SRP19-202ENST00000445150 UACAQ9BZF9 1416 aa28.52■■■□□ 2.16
SRP19-202ENST00000445150 SAMD9Q5K651 1589 aa28.5■■■□□ 2.15
SRP19-202ENST00000445150 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.5■■■□□ 2.15
SRP19-202ENST00000445150 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.47■■■□□ 2.15
SRP19-202ENST00000445150 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.42■■■□□ 2.14
SRP19-202ENST00000445150 ABCC2Q92887 1545 aa28.41■■■□□ 2.14
SRP19-202ENST00000445150 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SRP19-202ENST00000445150 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.36■■■□□ 2.13
SRP19-202ENST00000445150 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.35■■■□□ 2.13
SRP19-202ENST00000445150 ABCA8O94911 1581 aa28.33■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.32■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 MAPKBP1O60336 1514 aa28.3■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.3■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 FMN1Q68DA7 1419 aa28.3■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 CLIP1P30622 1438 aa28.27■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.27■■■□□ 2.12
SRP19-202ENST00000445150 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.22■■■□□ 2.11
SRP19-202ENST00000445150 ASXL2Q76L83 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.16■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 CEP162Q5TB80 1403 aa28.16■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.15■■■□□ 2.1
SRP19-202ENST00000445150 ATP10BO94823 1461 aa28.14■■■□□ 2.09
SRP19-202ENST00000445150 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SRP19-202ENST00000445150 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SRP19-202ENST00000445150 ARID3CA6NKF2 412 aa28.1■■■□□ 2.09
SRP19-202ENST00000445150 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.08■■■□□ 2.09
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.06■■■□□ 2.08
SRP19-202ENST00000445150 HECW1Q76N89 1606 aa28.06■■■□□ 2.08
SRP19-202ENST00000445150 DIP2BQ9P265 1576 aa28.05■■■□□ 2.08
SRP19-202ENST00000445150 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
SRP19-202ENST00000445150 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.03■■■□□ 2.08
SRP19-202ENST00000445150 KCNH8Q96L42 1107 aa28.01■■■□□ 2.07
SRP19-202ENST00000445150 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
SRP19-202ENST00000445150 GLI2P10070 1586 aa28■■■□□ 2.07
SRP19-202ENST00000445150 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.98■■■□□ 2.07
SRP19-202ENST00000445150 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.96■■■□□ 2.07
SRP19-202ENST00000445150 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.94■■■□□ 2.06
SRP19-202ENST00000445150 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
SRP19-202ENST00000445150 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SRP19-202ENST00000445150 CD109Q6YHK3 1445 aa27.84■■■□□ 2.05
SRP19-202ENST00000445150 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.84■■■□□ 2.05
SRP19-202ENST00000445150 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.82■■■□□ 2.04
SRP19-202ENST00000445150 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.81■■■□□ 2.04
SRP19-202ENST00000445150 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.81■■■□□ 2.04
SRP19-202ENST00000445150 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
SRP19-202ENST00000445150 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.76■■■□□ 2.03
SRP19-202ENST00000445150 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.76■■■□□ 2.03
SRP19-202ENST00000445150 TSPOAP1O95153 1857 aa27.75■■■□□ 2.03
SRP19-202ENST00000445150 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.72■■■□□ 2.03
SRP19-202ENST00000445150 APLP2Q06481 763 aa27.71■■■□□ 2.03
SRP19-202ENST00000445150 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.71■■■□□ 2.03
SRP19-202ENST00000445150 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.69■■■□□ 2.02
SRP19-202ENST00000445150 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
SRP19-202ENST00000445150 KIF14Q15058 1648 aa27.68■■■□□ 2.02
SRP19-202ENST00000445150 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SRP19-202ENST00000445150 NEO1Q92859 1461 aa27.61■■■□□ 2.01
SRP19-202ENST00000445150 MAP3K1Q13233 1512 aa27.61■■■□□ 2.01
SRP19-202ENST00000445150 PLCH2O75038 1416 aa27.6■■■□□ 2.01
SRP19-202ENST00000445150 KDM6BO15054 1643 aa27.59■■■□□ 2.01
SRP19-202ENST00000445150 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.58■■■□□ 2.01
SRP19-202ENST00000445150 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.57■■■□□ 2
SRP19-202ENST00000445150 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.57■■■□□ 2
SRP19-202ENST00000445150 TIAM1Q13009 1591 aa27.56■■■□□ 2
SRP19-202ENST00000445150 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.55■■■□□ 2
SRP19-202ENST00000445150 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.55■■■□□ 2
SRP19-202ENST00000445150 FANCAO15360 1455 aa27.54■■■□□ 2
SRP19-202ENST00000445150 AKNAQ7Z591 1439 aa27.5■■□□□ 1.99
SRP19-202ENST00000445150 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.5■■□□□ 1.99
SRP19-202ENST00000445150 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.49■■□□□ 1.99
SRP19-202ENST00000445150 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.49■■□□□ 1.99
SRP19-202ENST00000445150 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.46■■□□□ 1.99
SRP19-202ENST00000445150 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms