RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf49-201ENST00000439424 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
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C17orf49-201ENST00000439424 IQGAP2Q13576 1575 aa40.91■■■■■ 4.14
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C17orf49-201ENST00000439424 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.51■■■■■ 4.08
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C17orf49-201ENST00000439424 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.45■■■■■ 4.07
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C17orf49-201ENST00000439424 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
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C17orf49-201ENST00000439424 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.86■■■■□ 3.97
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C17orf49-201ENST00000439424 HECW1Q76N89 1606 aa39.4■■■■□ 3.9
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C17orf49-201ENST00000439424 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.37■■■■□ 3.89
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C17orf49-201ENST00000439424 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.19■■■■□ 3.86
C17orf49-201ENST00000439424 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.17■■■■□ 3.86
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C17orf49-201ENST00000439424 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.81■■■■□ 3.8
C17orf49-201ENST00000439424 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.8■■■■□ 3.8
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C17orf49-201ENST00000439424 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.78■■■■□ 3.8
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C17orf49-201ENST00000439424 PREX2Q70Z35 1606 aa38.75■■■■□ 3.79
C17orf49-201ENST00000439424 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
C17orf49-201ENST00000439424 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.73■■■■□ 3.79
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