RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435126.6

TMOD2-202, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD2, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-202ENST00000435126 SYNJ2O15056 1496 aa17.67■□□□□ 0.42
TMOD2-202ENST00000435126 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.63■□□□□ 0.41
TMOD2-202ENST00000435126 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.61■□□□□ 0.41
TMOD2-202ENST00000435126 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
TMOD2-202ENST00000435126 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.56■□□□□ 0.4
TMOD2-202ENST00000435126 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.54■□□□□ 0.4
TMOD2-202ENST00000435126 ADAMTS12P58397 1594 aa17.51■□□□□ 0.39
TMOD2-202ENST00000435126 GRIN2AQ12879 1464 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD2-202ENST00000435126 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
TMOD2-202ENST00000435126 CEP170Q5SW79 1584 aa17.49■□□□□ 0.39
TMOD2-202ENST00000435126 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.46■□□□□ 0.39
TMOD2-202ENST00000435126 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.46■□□□□ 0.39
TMOD2-202ENST00000435126 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.44■□□□□ 0.38
TMOD2-202ENST00000435126 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.43■□□□□ 0.38
TMOD2-202ENST00000435126 TOP2BQ02880 1626 aa17.42■□□□□ 0.38
TMOD2-202ENST00000435126 NUP160Q12769 1436 aa17.41■□□□□ 0.38
TMOD2-202ENST00000435126 SHROOM2Q13796 1616 aa17.4■□□□□ 0.38
TMOD2-202ENST00000435126 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD2-202ENST00000435126 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.34■□□□□ 0.37
TMOD2-202ENST00000435126 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.34■□□□□ 0.37
TMOD2-202ENST00000435126 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
TMOD2-202ENST00000435126 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.27■□□□□ 0.35
TMOD2-202ENST00000435126 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
TMOD2-202ENST00000435126 JPH4Q96JJ6 628 aa17.21■□□□□ 0.35
TMOD2-202ENST00000435126 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.17■□□□□ 0.34
TMOD2-202ENST00000435126 DIP2BQ9P265 1576 aa17.14■□□□□ 0.34
TMOD2-202ENST00000435126 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.14■□□□□ 0.33
TMOD2-202ENST00000435126 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.13■□□□□ 0.33
TMOD2-202ENST00000435126 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
TMOD2-202ENST00000435126 MAPKBP1O60336 1514 aa17.12■□□□□ 0.33
TMOD2-202ENST00000435126 TSPOAP1O95153 1857 aa17.12■□□□□ 0.33
TMOD2-202ENST00000435126 CUL7Q14999 1698 aa17.1■□□□□ 0.33
TMOD2-202ENST00000435126 KDM6BO15054 1643 aa17.08■□□□□ 0.32
TMOD2-202ENST00000435126 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.07■□□□□ 0.32
TMOD2-202ENST00000435126 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
TMOD2-202ENST00000435126 DSG3P32926 999 aa17.05■□□□□ 0.32
TMOD2-202ENST00000435126 KIF27Q86VH2 1401 aa17.04■□□□□ 0.32
TMOD2-202ENST00000435126 IGF1RP08069 1367 aa17.03■□□□□ 0.32
TMOD2-202ENST00000435126 PTPRGP23470 1445 aa16.96■□□□□ 0.31
TMOD2-202ENST00000435126 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.94■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 IQGAP2Q13576 1575 aa16.93■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.93■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.92■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.91■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 ABCC2Q92887 1545 aa16.91■□□□□ 0.3
TMOD2-202ENST00000435126 ASXL2Q76L83 1435 aa16.89■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 CAPN15O75808 1086 aa16.88■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 GLI2P10070 1586 aa16.86■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.86■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 DISP1Q96F81 1524 aa16.85■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 UACAQ9BZF9 1416 aa16.84■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.83■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
TMOD2-202ENST00000435126 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 KIAA0556O60303 1618 aa16.81■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.81■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 ADGRL1O94910 1474 aa16.8■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.78■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.77■□□□□ 0.28
TMOD2-202ENST00000435126 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.77■□□□□ 0.27
TMOD2-202ENST00000435126 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TMOD2-202ENST00000435126 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.76■□□□□ 0.27
TMOD2-202ENST00000435126 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.73■□□□□ 0.27
TMOD2-202ENST00000435126 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.69■□□□□ 0.26
TMOD2-202ENST00000435126 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TMOD2-202ENST00000435126 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TMOD2-202ENST00000435126 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.66■□□□□ 0.26
TMOD2-202ENST00000435126 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.65■□□□□ 0.26
TMOD2-202ENST00000435126 ABCA8O94911 1581 aa16.64■□□□□ 0.25
TMOD2-202ENST00000435126 GOLGA3Q08378 1498 aa16.62■□□□□ 0.25
TMOD2-202ENST00000435126 KCNH8Q96L42 1107 aa16.61■□□□□ 0.25
TMOD2-202ENST00000435126 CD109Q6YHK3 1445 aa16.61■□□□□ 0.25
TMOD2-202ENST00000435126 KIF21BO75037 1637 aa16.6■□□□□ 0.25
TMOD2-202ENST00000435126 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.58■□□□□ 0.24
TMOD2-202ENST00000435126 ARID3CA6NKF2 412 aa16.57■□□□□ 0.24
TMOD2-202ENST00000435126 PRXQ9BXM0 1461 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD2-202ENST00000435126 P3H3Q8IVL6 736 aa16.53■□□□□ 0.24
TMOD2-202ENST00000435126 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
TMOD2-202ENST00000435126 ATP10BO94823 1461 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD2-202ENST00000435126 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.47■□□□□ 0.23
TMOD2-202ENST00000435126 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.45■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.45■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 SAMD9Q5K651 1589 aa16.44■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.44■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.41■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.4■□□□□ 0.22
TMOD2-202ENST00000435126 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 RAPGEF3O95398 923 aa16.38■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 MADDQ8WXG6 1647 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 PTPRMP28827 1452 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.37■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 ABCB7O75027 752 aa16.35■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TMOD2-202ENST00000435126 NEO1Q92859 1461 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms