RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.3■■■■■ 4.2
CERS1-201ENST00000429504 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CERS1-201ENST00000429504 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.26■■■■■ 4.2
CERS1-201ENST00000429504 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.24■■■■■ 4.19
CERS1-201ENST00000429504 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.22■■■■■ 4.19
CERS1-201ENST00000429504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
CERS1-201ENST00000429504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CERS1-201ENST00000429504 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.16■■■■■ 4.18
CERS1-201ENST00000429504 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.16■■■■■ 4.18
CERS1-201ENST00000429504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
CERS1-201ENST00000429504 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.13■■■■■ 4.17
CERS1-201ENST00000429504 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.08■■■■■ 4.17
CERS1-201ENST00000429504 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
CERS1-201ENST00000429504 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
CERS1-201ENST00000429504 SAMD9Q5K651 1589 aa41.04■■■■■ 4.16
CERS1-201ENST00000429504 P3H3Q8IVL6 736 aa41.03■■■■■ 4.16
CERS1-201ENST00000429504 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
CERS1-201ENST00000429504 FMN1Q68DA7 1419 aa41■■■■■ 4.15
CERS1-201ENST00000429504 PBRM1Q86U86 1689 aa40.98■■■■■ 4.15
CERS1-201ENST00000429504 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.97■■■■■ 4.15
CERS1-201ENST00000429504 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.93■■■■■ 4.14
CERS1-201ENST00000429504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.91■■■■■ 4.14
CERS1-201ENST00000429504 ERCC6Q03468 1493 aa40.83■■■■■ 4.13
CERS1-201ENST00000429504 ADAMTS12P58397 1594 aa40.79■■■■■ 4.12
CERS1-201ENST00000429504 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
CERS1-201ENST00000429504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
CERS1-201ENST00000429504 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.73■■■■■ 4.11
CERS1-201ENST00000429504 ITGAEP38570 1179 aa40.73■■■■■ 4.11
CERS1-201ENST00000429504 WDR62O43379 1518 aa40.73■■■■■ 4.11
CERS1-201ENST00000429504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.11
CERS1-201ENST00000429504 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.71■■■■■ 4.11
CERS1-201ENST00000429504 GRIN2BQ13224 1484 aa40.7■■■■■ 4.11
CERS1-201ENST00000429504 IFT140Q96RY7 1462 aa40.67■■■■■ 4.1
CERS1-201ENST00000429504 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.66■■■■■ 4.1
CERS1-201ENST00000429504 IQGAP2Q13576 1575 aa40.64■■■■■ 4.1
CERS1-201ENST00000429504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
CERS1-201ENST00000429504 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.56■■■■■ 4.08
CERS1-201ENST00000429504 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.54■■■■■ 4.08
CERS1-201ENST00000429504 MAPKBP1O60336 1514 aa40.53■■■■■ 4.08
CERS1-201ENST00000429504 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.51■■■■■ 4.08
CERS1-201ENST00000429504 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
CERS1-201ENST00000429504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
CERS1-201ENST00000429504 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.48■■■■■ 4.07
CERS1-201ENST00000429504 HECW1Q76N89 1606 aa40.46■■■■■ 4.07
CERS1-201ENST00000429504 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.43■■■■■ 4.06
CERS1-201ENST00000429504 NCOA2Q15596 1464 aa40.43■■■■■ 4.06
CERS1-201ENST00000429504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CERS1-201ENST00000429504 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.38■■■■■ 4.05
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF11O15085 1522 aa40.36■■■■■ 4.05
CERS1-201ENST00000429504 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.31■■■■■ 4.04
CERS1-201ENST00000429504 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CERS1-201ENST00000429504 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
CERS1-201ENST00000429504 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.29■■■■■ 4.04
CERS1-201ENST00000429504 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
CERS1-201ENST00000429504 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CERS1-201ENST00000429504 GRIN2AQ12879 1464 aa40.24■■■■■ 4.03
CERS1-201ENST00000429504 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.23■■■■■ 4.03
CERS1-201ENST00000429504 KIAA0556O60303 1618 aa40.21■■■■■ 4.03
CERS1-201ENST00000429504 HFM1A2PYH4 1435 aa40.21■■■■■ 4.03
CERS1-201ENST00000429504 MIER1Q8N108 512 aa40.19■■■■■ 4.02
CERS1-201ENST00000429504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CERS1-201ENST00000429504 NEUROD1Q13562 356 aa40.19■■■■■ 4.02
CERS1-201ENST00000429504 PTPRKQ15262 1439 aa40.16■■■■■ 4.02
CERS1-201ENST00000429504 DISP1Q96F81 1524 aa40.15■■■■■ 4.02
CERS1-201ENST00000429504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
CERS1-201ENST00000429504 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CERS1-201ENST00000429504 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.07■■■■■ 4
CERS1-201ENST00000429504 SYNJ2O15056 1496 aa40.04■■■■■ 4
CERS1-201ENST00000429504 NAIPQ13075 1403 aa40.03■■■■■ 4
CERS1-201ENST00000429504 UACAQ9BZF9 1416 aa40.02■■■■■ 4
CERS1-201ENST00000429504 MIA2Q96PC5 1412 aa40.01■■■■■ 4
CERS1-201ENST00000429504 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40■■■■□ 3.99
CERS1-201ENST00000429504 CEP170Q5SW79 1584 aa39.98■■■■□ 3.99
CERS1-201ENST00000429504 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.96■■■■□ 3.99
CERS1-201ENST00000429504 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.96■■■■□ 3.99
CERS1-201ENST00000429504 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
CERS1-201ENST00000429504 AKNAQ7Z591 1439 aa39.92■■■■□ 3.98
CERS1-201ENST00000429504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CERS1-201ENST00000429504 NUP160Q12769 1436 aa39.85■■■■□ 3.97
CERS1-201ENST00000429504 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
CERS1-201ENST00000429504 ARID3CA6NKF2 412 aa39.74■■■■□ 3.95
CERS1-201ENST00000429504 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
CERS1-201ENST00000429504 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
CERS1-201ENST00000429504 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.72■■■■□ 3.95
CERS1-201ENST00000429504 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.69■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 TONSLQ96HA7 1378 aa39.66■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.65■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.64■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.64■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 FBLN2P98095 1184 aa39.64■■■■□ 3.94
CERS1-201ENST00000429504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.63■■■■□ 3.93
CERS1-201ENST00000429504 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.62■■■■□ 3.93
CERS1-201ENST00000429504 KDM6BO15054 1643 aa39.62■■■■□ 3.93
CERS1-201ENST00000429504 DAPK1P53355 1430 aa39.62■■■■□ 3.93
CERS1-201ENST00000429504 ROCK1Q13464 1354 aa39.62■■■■□ 3.93
CERS1-201ENST00000429504 JPH4Q96JJ6 628 aa39.61■■■■□ 3.93
CERS1-201ENST00000429504 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
CERS1-201ENST00000429504 ABCC5O15440 1437 aa39.53■■■■□ 3.92
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