RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428771.6

HES4-202, Transcript of hes family bHLH transcription factor 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HES4, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES4-202ENST00000428771 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
HES4-202ENST00000428771 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.41■■■■■ 4.38
HES4-202ENST00000428771 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.41■■■■■ 4.38
HES4-202ENST00000428771 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.39■■■■■ 4.38
HES4-202ENST00000428771 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.11■■■■■ 4.33
HES4-202ENST00000428771 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.05■■■■■ 4.32
HES4-202ENST00000428771 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.04■■■■■ 4.32
HES4-202ENST00000428771 IQGAP2Q13576 1575 aa42.01■■■■■ 4.32
HES4-202ENST00000428771 PTPRGP23470 1445 aa41.9■■■■■ 4.3
HES4-202ENST00000428771 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.88■■■■■ 4.29
HES4-202ENST00000428771 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.77■■■■■ 4.28
HES4-202ENST00000428771 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.77■■■■■ 4.28
HES4-202ENST00000428771 PRXQ9BXM0 1461 aa41.75■■■■■ 4.27
HES4-202ENST00000428771 MAPKBP1O60336 1514 aa41.74■■■■■ 4.27
HES4-202ENST00000428771 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.69■■■■■ 4.26
HES4-202ENST00000428771 DISP1Q96F81 1524 aa41.69■■■■■ 4.26
HES4-202ENST00000428771 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.67■■■■■ 4.26
HES4-202ENST00000428771 EEA1Q15075 1411 aa41.67■■■■■ 4.26
HES4-202ENST00000428771 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
HES4-202ENST00000428771 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.63■■■■■ 4.26
HES4-202ENST00000428771 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.63■■■■■ 4.25
HES4-202ENST00000428771 GOLGA3Q08378 1498 aa41.61■■■■■ 4.25
HES4-202ENST00000428771 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.6■■■■■ 4.25
HES4-202ENST00000428771 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.6■■■■■ 4.25
HES4-202ENST00000428771 UACAQ9BZF9 1416 aa41.59■■■■■ 4.25
HES4-202ENST00000428771 KIAA0556O60303 1618 aa41.57■■■■■ 4.25
HES4-202ENST00000428771 ABCC2Q92887 1545 aa41.56■■■■■ 4.24
HES4-202ENST00000428771 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
HES4-202ENST00000428771 DIP2BQ9P265 1576 aa41.46■■■■■ 4.23
HES4-202ENST00000428771 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.42■■■■■ 4.22
HES4-202ENST00000428771 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.36■■■■■ 4.21
HES4-202ENST00000428771 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
HES4-202ENST00000428771 ASXL2Q76L83 1435 aa41.34■■■■■ 4.21
HES4-202ENST00000428771 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.25■■■■■ 4.19
HES4-202ENST00000428771 GLI2P10070 1586 aa41.23■■■■■ 4.19
HES4-202ENST00000428771 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
HES4-202ENST00000428771 ABCA8O94911 1581 aa41.16■■■■■ 4.18
HES4-202ENST00000428771 TSPOAP1O95153 1857 aa41.15■■■■■ 4.18
HES4-202ENST00000428771 KIF21BO75037 1637 aa41.14■■■■■ 4.18
HES4-202ENST00000428771 SAMD9Q5K651 1589 aa41.09■■■■■ 4.17
HES4-202ENST00000428771 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
HES4-202ENST00000428771 P3H3Q8IVL6 736 aa41.08■■■■■ 4.17
HES4-202ENST00000428771 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.05■■■■■ 4.16
HES4-202ENST00000428771 KDM6BO15054 1643 aa41.03■■■■■ 4.16
HES4-202ENST00000428771 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.96■■■■■ 4.15
HES4-202ENST00000428771 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.94■■■■■ 4.14
HES4-202ENST00000428771 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.9■■■■■ 4.14
HES4-202ENST00000428771 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
HES4-202ENST00000428771 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
HES4-202ENST00000428771 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
HES4-202ENST00000428771 KCNH8Q96L42 1107 aa40.86■■■■■ 4.13
HES4-202ENST00000428771 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.85■■■■■ 4.13
HES4-202ENST00000428771 ATP10BO94823 1461 aa40.84■■■■■ 4.13
HES4-202ENST00000428771 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.81■■■■■ 4.12
HES4-202ENST00000428771 CD109Q6YHK3 1445 aa40.78■■■■■ 4.12
HES4-202ENST00000428771 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.77■■■■■ 4.12
HES4-202ENST00000428771 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
HES4-202ENST00000428771 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
HES4-202ENST00000428771 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.73■■■■■ 4.11
HES4-202ENST00000428771 ARID3CA6NKF2 412 aa40.71■■■■■ 4.11
HES4-202ENST00000428771 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
HES4-202ENST00000428771 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.63■■■■■ 4.09
HES4-202ENST00000428771 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.62■■■■■ 4.09
HES4-202ENST00000428771 FMN1Q68DA7 1419 aa40.59■■■■■ 4.09
HES4-202ENST00000428771 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.57■■■■■ 4.08
HES4-202ENST00000428771 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.54■■■■■ 4.08
HES4-202ENST00000428771 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
HES4-202ENST00000428771 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.47■■■■■ 4.07
HES4-202ENST00000428771 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.41■■■■■ 4.06
HES4-202ENST00000428771 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
HES4-202ENST00000428771 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
HES4-202ENST00000428771 HECW1Q76N89 1606 aa40.37■■■■■ 4.05
HES4-202ENST00000428771 NEO1Q92859 1461 aa40.37■■■■■ 4.05
HES4-202ENST00000428771 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.31■■■■■ 4.04
HES4-202ENST00000428771 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
HES4-202ENST00000428771 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.037e-8■■□□□ 13.8
HES4-202ENST00000428771 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.19■■■■■ 4.02
HES4-202ENST00000428771 ADGRL1O94910 1474 aa40.13■■■■■ 4.02
HES4-202ENST00000428771 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.12■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 FANCAO15360 1455 aa40.12■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 CLIP1P30622 1438 aa40.11■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 AKNAQ7Z591 1439 aa40.09■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.09■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 RAPGEF3O95398 923 aa40.08■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.07■■■■■ 4.01
HES4-202ENST00000428771 PLCH2O75038 1416 aa40.06■■■■■ 4
HES4-202ENST00000428771 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
HES4-202ENST00000428771 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
HES4-202ENST00000428771 KIF14Q15058 1648 aa40.01■■■■■ 4
HES4-202ENST00000428771 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40■■■■□ 3.99
HES4-202ENST00000428771 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.99■■■■□ 3.99
HES4-202ENST00000428771 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.96■■■■□ 3.99
HES4-202ENST00000428771 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
HES4-202ENST00000428771 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.94■■■■□ 3.98
HES4-202ENST00000428771 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.9■■■■□ 3.98
HES4-202ENST00000428771 RICTORQ6R327 1708 aa39.9■■■■□ 3.98
HES4-202ENST00000428771 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.86■■■■□ 3.97
HES4-202ENST00000428771 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.84■■■■□ 3.97
HES4-202ENST00000428771 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.81■■■■□ 3.96
HES4-202ENST00000428771 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms