RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426248.7

PKP4-205, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PKP4, Length 4,134 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-205ENST00000426248 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.21■■□□□ 1.31
PKP4-205ENST00000426248 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.2■■□□□ 1.31
PKP4-205ENST00000426248 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.2■■□□□ 1.3
PKP4-205ENST00000426248 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PKP4-205ENST00000426248 MIER1Q8N108 512 aa23.14■■□□□ 1.3
PKP4-205ENST00000426248 BCANQ96GW7 911 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP4-205ENST00000426248 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP4-205ENST00000426248 PRXQ9BXM0 1461 aa23.09■■□□□ 1.29
PKP4-205ENST00000426248 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP4-205ENST00000426248 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PKP4-205ENST00000426248 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.07■■□□□ 1.28
PKP4-205ENST00000426248 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PKP4-205ENST00000426248 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP4-205ENST00000426248 KIF21BO75037 1637 aa23.02■■□□□ 1.28
PKP4-205ENST00000426248 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23■■□□□ 1.27
PKP4-205ENST00000426248 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.97■■□□□ 1.27
PKP4-205ENST00000426248 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP4-205ENST00000426248 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 IFT140Q96RY7 1462 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 GRIN2BQ13224 1484 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP4-205ENST00000426248 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP4-205ENST00000426248 JPH4Q96JJ6 628 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP4-205ENST00000426248 PRDM2Q13029 1718 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP4-205ENST00000426248 ARAP1Q96P48 1450 aa22.84■■□□□ 1.25
PKP4-205ENST00000426248 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.83■■□□□ 1.25
PKP4-205ENST00000426248 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.81■■□□□ 1.24
PKP4-205ENST00000426248 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.8■■□□□ 1.24
PKP4-205ENST00000426248 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.77■■□□□ 1.24
PKP4-205ENST00000426248 FMN1Q68DA7 1419 aa22.75■■□□□ 1.23
PKP4-205ENST00000426248 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PKP4-205ENST00000426248 KCNH8Q96L42 1107 aa22.74■■□□□ 1.23
PKP4-205ENST00000426248 TRIM52Q96A61 297 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP4-205ENST00000426248 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP4-205ENST00000426248 NEFLP07196 543 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP4-205ENST00000426248 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.7■■□□□ 1.22
PKP4-205ENST00000426248 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 WDR62O43379 1518 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 FKBP8Q14318 412 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 CUL7Q14999 1698 aa22.61■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.59■■□□□ 1.21
PKP4-205ENST00000426248 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PKP4-205ENST00000426248 GRIN2AQ12879 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
PKP4-205ENST00000426248 SYNJ2O15056 1496 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP4-205ENST00000426248 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 PTPRGP23470 1445 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 OSCARQ8IYS5 282 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.49■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.47■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.46■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 IQGAP2Q13576 1575 aa22.45■■□□□ 1.19
PKP4-205ENST00000426248 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.44■■□□□ 1.18
PKP4-205ENST00000426248 TSPY4P0CV99 314 aa22.42■■□□□ 1.18
PKP4-205ENST00000426248 TSPY10P0CW01 314 aa22.42■■□□□ 1.18
PKP4-205ENST00000426248 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.41■■□□□ 1.18
PKP4-205ENST00000426248 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.41■■□□□ 1.18
PKP4-205ENST00000426248 ADAMTS12P58397 1594 aa22.38■■□□□ 1.17
PKP4-205ENST00000426248 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PKP4-205ENST00000426248 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.36■■□□□ 1.17
PKP4-205ENST00000426248 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PKP4-205ENST00000426248 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PKP4-205ENST00000426248 PBRM1Q86U86 1689 aa22.33■■□□□ 1.17
PKP4-205ENST00000426248 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.166e-10■■□□□ 12.1
PKP4-205ENST00000426248 NBR1Q14596 966 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 TIAM1Q13009 1591 aa22.28■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PKP4-205ENST00000426248 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 WDR97A6NE52 1622 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.153e-6■■■□□ 19.2
PKP4-205ENST00000426248 NCOA2Q15596 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP4-205ENST00000426248 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP4-205ENST00000426248 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP4-205ENST00000426248 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP4-205ENST00000426248 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP4-205ENST00000426248 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP4-205ENST00000426248 NUP160Q12769 1436 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP4-205ENST00000426248 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP4-205ENST00000426248 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PKP4-205ENST00000426248 HECW1Q76N89 1606 aa22.12■■□□□ 1.13
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