RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAPKBP1O60336 1514 aa30.04■■■□□ 2.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOP2BQ02880 1626 aa30.04■■■□□ 2.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.03■■■□□ 2.4
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.97■■■□□ 2.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIP2BQ9P265 1576 aa29.97■■■□□ 2.39
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM6BO15054 1643 aa29.93■■■□□ 2.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.9■■■□□ 2.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.86■■■□□ 2.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.73■■■□□ 2.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPOAP1O95153 1857 aa29.72■■■□□ 2.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPRGP23470 1445 aa29.62■■■□□ 2.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRL1O94910 1474 aa29.55■■■□□ 2.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC2Q92887 1545 aa29.55■■■□□ 2.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.55■■■□□ 2.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGF1RP08069 1367 aa29.54■■■□□ 2.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLI2P10070 1586 aa29.52■■■□□ 2.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUL7Q14999 1698 aa29.52■■■□□ 2.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASXL2Q76L83 1435 aa29.51■■■□□ 2.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.5■■■□□ 2.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.5■■■□□ 2.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF27Q86VH2 1401 aa29.49■■■□□ 2.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.42■■■□□ 2.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.38■■■□□ 2.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.36■■■□□ 2.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UACAQ9BZF9 1416 aa29.36■■■□□ 2.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.35■■■□□ 2.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQGAP2Q13576 1575 aa29.3■■■□□ 2.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.3■■■□□ 2.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.28■■■□□ 2.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DISP1Q96F81 1524 aa29.21■■■□□ 2.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.1■■■□□ 2.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.1■■■□□ 2.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO41Q8TF61 875 aa29.07■■■□□ 2.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.04■■■□□ 2.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0556O60303 1618 aa29.03■■■□□ 2.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD109Q6YHK3 1445 aa29.03■■■□□ 2.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.99■■■□□ 2.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.97■■■□□ 2.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNH8Q96L42 1107 aa28.92■■■□□ 2.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF21BO75037 1637 aa28.87■■■□□ 2.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGA3Q08378 1498 aa28.85■■■□□ 2.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.84■■■□□ 2.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA8O94911 1581 aa28.82■■■□□ 2.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPRMP28827 1452 aa28.78■■■□□ 2.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.76■■■□□ 2.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.72■■■□□ 2.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.72■■■□□ 2.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAPGEF3O95398 923 aa28.6■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.6■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP10BO94823 1461 aa28.59■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEO1Q92859 1461 aa28.59■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.59■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.58■■■□□ 2.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARID3CA6NKF2 412 aa28.55■■■□□ 2.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MADDQ8WXG6 1647 aa28.54■■■□□ 2.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRXQ9BXM0 1461 aa28.48■■■□□ 2.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.46■■■□□ 2.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P3H3Q8IVL6 736 aa28.44■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.41■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA2P54652 639 aa28.39■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.39■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CERKQ8TCT0 537 aa28.39■■■□□ 2.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.36■■■□□ 2.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FANCAO15360 1455 aa28.34■■■□□ 2.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.33■■■□□ 2.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKNAQ7Z591 1439 aa28.33■■■□□ 2.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAMD9Q5K651 1589 aa28.29■■■□□ 2.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RICTORQ6R327 1708 aa28.29■■■□□ 2.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.28■■■□□ 2.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.27■■■□□ 2.12
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.26■■■□□ 2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.24■■■□□ 2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.23■■■□□ 2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.23■■■□□ 2.11
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.2■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOCS7O14512 581 aa28.18■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.18■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.16■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLECQ14165 292 aa28.16■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.14■■■□□ 2.1
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.13■■■□□ 2.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ILDR2Q71H61 639 aa28.12■■■□□ 2.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.12■■■□□ 2.09
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