RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421939.5

CDK9-202, Transcript of cyclin dependent kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene CDK9, Length 702 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9-202ENST00000421939 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.71■■■■■ 4.75
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CDK9-202ENST00000421939 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.67■■■■■ 4.74
CDK9-202ENST00000421939 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.65■■■■■ 4.74
CDK9-202ENST00000421939 IQGAP2Q13576 1575 aa44.47■■■■■ 4.71
CDK9-202ENST00000421939 PRXQ9BXM0 1461 aa44.45■■■■■ 4.71
CDK9-202ENST00000421939 EEA1Q15075 1411 aa44.37■■■■■ 4.69
CDK9-202ENST00000421939 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.36■■■■■ 4.69
CDK9-202ENST00000421939 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.28■■■■■ 4.68
CDK9-202ENST00000421939 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.26■■■■■ 4.68
CDK9-202ENST00000421939 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.24■■■■■ 4.67
CDK9-202ENST00000421939 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.21■■■■■ 4.67
CDK9-202ENST00000421939 DISP1Q96F81 1524 aa44.15■■■■■ 4.66
CDK9-202ENST00000421939 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
CDK9-202ENST00000421939 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.11■■■■■ 4.65
CDK9-202ENST00000421939 PTPRGP23470 1445 aa44.09■■■■■ 4.65
CDK9-202ENST00000421939 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
CDK9-202ENST00000421939 KIAA0556O60303 1618 aa44.05■■■■■ 4.64
CDK9-202ENST00000421939 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.05■■■■■ 4.64
CDK9-202ENST00000421939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
CDK9-202ENST00000421939 KIF21BO75037 1637 aa43.95■■■■■ 4.63
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CDK9-202ENST00000421939 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.61
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CDK9-202ENST00000421939 UACAQ9BZF9 1416 aa43.81■■■■■ 4.6
CDK9-202ENST00000421939 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.8■■■■■ 4.6
CDK9-202ENST00000421939 ABCC2Q92887 1545 aa43.77■■■■■ 4.6
CDK9-202ENST00000421939 SAMD9Q5K651 1589 aa43.69■■■■■ 4.58
CDK9-202ENST00000421939 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.64■■■■■ 4.58
CDK9-202ENST00000421939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.62■■■■■ 4.57
CDK9-202ENST00000421939 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.61■■■■■ 4.57
CDK9-202ENST00000421939 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.58■■■■■ 4.57
CDK9-202ENST00000421939 ABCA8O94911 1581 aa43.58■■■■■ 4.57
CDK9-202ENST00000421939 DIP2BQ9P265 1576 aa43.58■■■■■ 4.57
CDK9-202ENST00000421939 P3H3Q8IVL6 736 aa43.56■■■■■ 4.56
CDK9-202ENST00000421939 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.53■■■■■ 4.56
CDK9-202ENST00000421939 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
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CDK9-202ENST00000421939 ASXL2Q76L83 1435 aa43.49■■■■■ 4.55
CDK9-202ENST00000421939 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
CDK9-202ENST00000421939 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.49■■■■■ 4.55
CDK9-202ENST00000421939 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.47■■■■■ 4.55
CDK9-202ENST00000421939 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.4■■■■■ 4.54
CDK9-202ENST00000421939 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.31■■■■■ 4.52
CDK9-202ENST00000421939 GLI2P10070 1586 aa43.28■■■■■ 4.52
CDK9-202ENST00000421939 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.26■■■■■ 4.52
CDK9-202ENST00000421939 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
CDK9-202ENST00000421939 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.19■■■■■ 4.5
CDK9-202ENST00000421939 ATP10BO94823 1461 aa43.18■■■■■ 4.5
CDK9-202ENST00000421939 TSPOAP1O95153 1857 aa43.17■■■■■ 4.5
CDK9-202ENST00000421939 ARID3CA6NKF2 412 aa43.15■■■■■ 4.5
CDK9-202ENST00000421939 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
CDK9-202ENST00000421939 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.08■■■■■ 4.49
CDK9-202ENST00000421939 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
CDK9-202ENST00000421939 FMN1Q68DA7 1419 aa43.03■■■■■ 4.48
CDK9-202ENST00000421939 KCNH8Q96L42 1107 aa42.96■■■■■ 4.47
CDK9-202ENST00000421939 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
CDK9-202ENST00000421939 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
CDK9-202ENST00000421939 KDM6BO15054 1643 aa42.93■■■■■ 4.46
CDK9-202ENST00000421939 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.92■■■■■ 4.46
CDK9-202ENST00000421939 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.89■■■■■ 4.46
CDK9-202ENST00000421939 HECW1Q76N89 1606 aa42.88■■■■■ 4.45
CDK9-202ENST00000421939 CLIP1P30622 1438 aa42.86■■■■■ 4.45
CDK9-202ENST00000421939 CD109Q6YHK3 1445 aa42.86■■■■■ 4.45
CDK9-202ENST00000421939 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CDK9-202ENST00000421939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.8■■■■■ 4.44
CDK9-202ENST00000421939 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.79■■■■■ 4.44
CDK9-202ENST00000421939 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.74■■■■■ 4.43
CDK9-202ENST00000421939 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
CDK9-202ENST00000421939 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
CDK9-202ENST00000421939 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.67■■■■■ 4.42
CDK9-202ENST00000421939 CEP162Q5TB80 1403 aa42.63■■■■■ 4.41
CDK9-202ENST00000421939 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
CDK9-202ENST00000421939 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.62■■■■■ 4.41
CDK9-202ENST00000421939 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.59■■■■■ 4.41
CDK9-202ENST00000421939 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.55■■■■■ 4.4
CDK9-202ENST00000421939 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.47e-9■■■□□ 17.9
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CDK9-202ENST00000421939 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.52■■■■■ 4.4
CDK9-202ENST00000421939 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.52■■■■■ 4.4
CDK9-202ENST00000421939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
CDK9-202ENST00000421939 NEO1Q92859 1461 aa42.46■■■■■ 4.39
CDK9-202ENST00000421939 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.44■■■■■ 4.38
CDK9-202ENST00000421939 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.43■■■■■ 4.38
CDK9-202ENST00000421939 KIF14Q15058 1648 aa42.42■■■■■ 4.38
CDK9-202ENST00000421939 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
CDK9-202ENST00000421939 FANCAO15360 1455 aa42.33■■■■■ 4.37
CDK9-202ENST00000421939 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.28■■■■■ 4.36
CDK9-202ENST00000421939 PLCH2O75038 1416 aa42.27■■■■■ 4.36
CDK9-202ENST00000421939 AKNAQ7Z591 1439 aa42.24■■■■■ 4.35
CDK9-202ENST00000421939 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.18■■■■■ 4.34
CDK9-202ENST00000421939 RAPGEF3O95398 923 aa42.16■■■■■ 4.34
CDK9-202ENST00000421939 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
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CDK9-202ENST00000421939 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.1■■■■■ 4.33
CDK9-202ENST00000421939 ADGRL1O94910 1474 aa42.1■■■■■ 4.33
CDK9-202ENST00000421939 RICTORQ6R327 1708 aa42.09■■■■■ 4.33
CDK9-202ENST00000421939 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.09■■■■■ 4.33
CDK9-202ENST00000421939 PREX2Q70Z35 1606 aa42.08■■■■■ 4.33
CDK9-202ENST00000421939 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.06■■■■■ 4.32
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