RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.84■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.84■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IQGAP2Q13576 1575 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EEA1Q15075 1411 aa20.72■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.71■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.71■□□□□ 0.91
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRXQ9BXM0 1461 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTPRGP23470 1445 aa20.62■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.62■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.59■□□□□ 0.89
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DISP1Q96F81 1524 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GOLGA3Q08378 1498 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIAA0556O60303 1618 aa20.52■□□□□ 0.88
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.51■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF21BO75037 1637 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UACAQ9BZF9 1416 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.44■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 P3H3Q8IVL6 736 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAPKBP1O60336 1514 aa20.42■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC2Q92887 1545 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.35■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.34■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.33■□□□□ 0.85
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAMD9Q5K651 1589 aa20.32■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ASXL2Q76L83 1435 aa20.31■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.31■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DIP2BQ9P265 1576 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA8O94911 1581 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.27■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.24■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARID3CA6NKF2 412 aa20.22■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSPOAP1O95153 1857 aa20.21■□□□□ 0.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.2■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.18■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GLI2P10070 1586 aa20.17■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNH8Q96L42 1107 aa20.17■□□□□ 0.82
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP10BO94823 1461 aa20.14■□□□□ 0.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FMN1Q68DA7 1419 aa20.11■□□□□ 0.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.11■□□□□ 0.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDM6BO15054 1643 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD109Q6YHK3 1445 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HECW1Q76N89 1606 aa20.01■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLIP1P30622 1438 aa20.01■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.97■□□□□ 0.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.94■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.9■□□□□ 0.78
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.89■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP162Q5TB80 1403 aa19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.83■□□□□ 0.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NEO1Q92859 1461 aa19.82■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.81■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF14Q15058 1648 aa19.8■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.79■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.78■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FANCAO15360 1455 aa19.77■□□□□ 0.76
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AKNAQ7Z591 1439 aa19.75■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLCH2O75038 1416 aa19.74■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAPGEF3O95398 923 aa19.73■□□□□ 0.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.7■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.68■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADGRL1O94910 1474 aa19.67■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.65■□□□□ 0.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms