RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.06■■■□□ 2.4
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.78■■□□□ 1.88
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC9O60706 1549 aa26.34■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.35■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NACADO15069 1562 aa25.23■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYO15BQ96JP2 1530 aa25■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.85■■□□□ 1.57
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.66■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCRIBQ14160 1630 aa24.45■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.44■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.21■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.8■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.68■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMARCA4P51532 1647 aa23.35■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMARCA2P51531 1590 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCAPD3P42695 1498 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.15■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HMGXB3Q12766 1538 aa23.13■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.09■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WIZO95785 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERCC6Q03468 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NESP48681 1621 aa22.72■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.61■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.58■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CUX2O14529 1486 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFTRP13569 1480 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRDM2Q13029 1718 aa22.26■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR62O43379 1518 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-203ENST00000419253 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC8Q09428 1581 aa22.01■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.96■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TOPBP1Q92547 1522 aa21.96■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.93■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFT140Q96RY7 1462 aa21.88■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CUX1P39880 1505 aa21.73■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOGA1O94964 1423 aa21.72■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.68■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OSCARQ8IYS5 282 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WDR97A6NE52 1622 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TOP2BQ02880 1626 aa21.54■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBLN2P98095 1184 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYNJ1O43426 1573 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRIN2BQ13224 1484 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.45■■□□□ 1.03
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHD1O14646 1710 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PBRM1Q86U86 1689 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYNJ2O15056 1496 aa21.32■■□□□ 1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM41Q8WV44 630 aa21.27■■□□□ 1
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.24■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAMTS12P58397 1594 aa21.2■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF27Q86VH2 1401 aa21.2■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGEF11O15085 1522 aa21.19■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRIN2AQ12879 1464 aa21.17■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.14■□□□□ 0.98
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.09■□□□□ 0.97
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGF1RP08069 1367 aa21.07■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUP160Q12769 1436 aa21.04■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEP170Q5SW79 1584 aa21.04■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CUL7Q14999 1698 aa21.04■□□□□ 0.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARAP1Q96P48 1450 aa21■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.98■□□□□ 0.95
TTC28-AS1-203ENST00000419253 JPH4Q96JJ6 628 aa20.92■□□□□ 0.94
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SHROOM2Q13796 1616 aa20.89■□□□□ 0.93
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms