RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.24■■■□□ 2.43
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.22■■■□□ 2.43
SEMA3B-201ENST00000416295 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SEMA3B-201ENST00000416295 EEA1Q15075 1411 aa30.19■■■□□ 2.42
SEMA3B-201ENST00000416295 JPH4Q96JJ6 628 aa30.17■■■□□ 2.42
SEMA3B-201ENST00000416295 PRXQ9BXM0 1461 aa30.13■■■□□ 2.41
SEMA3B-201ENST00000416295 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
SEMA3B-201ENST00000416295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.11■■■□□ 2.41
SEMA3B-201ENST00000416295 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.1■■■□□ 2.41
SEMA3B-201ENST00000416295 IQGAP2Q13576 1575 aa30.04■■■□□ 2.4
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SEMA3B-201ENST00000416295 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.92■■■□□ 2.38
SEMA3B-201ENST00000416295 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.91■■■□□ 2.38
SEMA3B-201ENST00000416295 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.89■■■□□ 2.38
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF21BO75037 1637 aa29.83■■■□□ 2.37
SEMA3B-201ENST00000416295 DISP1Q96F81 1524 aa29.81■■■□□ 2.36
SEMA3B-201ENST00000416295 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.8■■■□□ 2.36
SEMA3B-201ENST00000416295 PTPRGP23470 1445 aa29.78■■■□□ 2.36
SEMA3B-201ENST00000416295 GOLGA3Q08378 1498 aa29.75■■■□□ 2.35
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA0556O60303 1618 aa29.74■■■□□ 2.35
SEMA3B-201ENST00000416295 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SEMA3B-201ENST00000416295 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
SEMA3B-201ENST00000416295 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.64■■■□□ 2.34
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SEMA3B-201ENST00000416295 UACAQ9BZF9 1416 aa29.57■■■□□ 2.32
SEMA3B-201ENST00000416295 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.56■■■□□ 2.32
SEMA3B-201ENST00000416295 SAMD9Q5K651 1589 aa29.56■■■□□ 2.32
SEMA3B-201ENST00000416295 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.55■■■□□ 2.32
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.55■■■□□ 2.32
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SEMA3B-201ENST00000416295 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.5■■■□□ 2.31
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SEMA3B-201ENST00000416295 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.46■■■□□ 2.31
SEMA3B-201ENST00000416295 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.45■■■□□ 2.31
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.44■■■□□ 2.3
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCA8O94911 1581 aa29.42■■■□□ 2.3
SEMA3B-201ENST00000416295 DIP2BQ9P265 1576 aa29.42■■■□□ 2.3
SEMA3B-201ENST00000416295 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.4■■■□□ 2.3
SEMA3B-201ENST00000416295 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.37■■■□□ 2.29
SEMA3B-201ENST00000416295 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ASXL2Q76L83 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.28■■■□□ 2.28
SEMA3B-201ENST00000416295 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.27■■■□□ 2.28
SEMA3B-201ENST00000416295 FMN1Q68DA7 1419 aa29.2■■■□□ 2.26
SEMA3B-201ENST00000416295 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.18■■■□□ 2.26
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP10BO94823 1461 aa29.17■■■□□ 2.26
SEMA3B-201ENST00000416295 GLI2P10070 1586 aa29.17■■■□□ 2.26
SEMA3B-201ENST00000416295 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
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SEMA3B-201ENST00000416295 TSPOAP1O95153 1857 aa29.16■■■□□ 2.26
SEMA3B-201ENST00000416295 ARID3CA6NKF2 412 aa29.14■■■□□ 2.26
SEMA3B-201ENST00000416295 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
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SEMA3B-201ENST00000416295 KDM6BO15054 1643 aa29.12■■■□□ 2.25
SEMA3B-201ENST00000416295 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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SEMA3B-201ENST00000416295 HECW1Q76N89 1606 aa29.04■■■□□ 2.24
SEMA3B-201ENST00000416295 KCNH8Q96L42 1107 aa29■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 CEP162Q5TB80 1403 aa29■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.99■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.99■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.96■■■□□ 2.23
SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.95■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.94■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.92■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CD109Q6YHK3 1445 aa28.9■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.9■■■□□ 2.22
SEMA3B-201ENST00000416295 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.87■■■□□ 2.21
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.86■■■□□ 2.21
SEMA3B-201ENST00000416295 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.85■■■□□ 2.21
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.79■■■□□ 2.2
SEMA3B-201ENST00000416295 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SEMA3B-201ENST00000416295 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SEMA3B-201ENST00000416295 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF14Q15058 1648 aa28.69■■■□□ 2.18
SEMA3B-201ENST00000416295 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.68■■■□□ 2.18
SEMA3B-201ENST00000416295 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.67■■■□□ 2.18
SEMA3B-201ENST00000416295 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.67■■■□□ 2.18
SEMA3B-201ENST00000416295 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.66■■■□□ 2.18
SEMA3B-201ENST00000416295 NEO1Q92859 1461 aa28.66■■■□□ 2.18
SEMA3B-201ENST00000416295 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.6■■■□□ 2.17
SEMA3B-201ENST00000416295 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.59■■■□□ 2.17
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SEMA3B-201ENST00000416295 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.55■■■□□ 2.16
SEMA3B-201ENST00000416295 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.55■■■□□ 2.16
SEMA3B-201ENST00000416295 AKNAQ7Z591 1439 aa28.52■■■□□ 2.16
SEMA3B-201ENST00000416295 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.49■■■□□ 2.15
SEMA3B-201ENST00000416295 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.49■■■□□ 2.15
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SEMA3B-201ENST00000416295 TIAM1Q13009 1591 aa28.46■■■□□ 2.15
SEMA3B-201ENST00000416295 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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