RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
SH3BP4-204ENST00000416021 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.5■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 SHROOM2Q13796 1616 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.48■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.47■■■■□ 3.27
SH3BP4-204ENST00000416021 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.39■■■■□ 3.26
SH3BP4-204ENST00000416021 PRXQ9BXM0 1461 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
SH3BP4-204ENST00000416021 EEA1Q15075 1411 aa35.23■■■■□ 3.23
SH3BP4-204ENST00000416021 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SH3BP4-204ENST00000416021 IQGAP2Q13576 1575 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.16■■■■□ 3.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPRGP23470 1445 aa35.11■■■■□ 3.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.09■■■■□ 3.21
SH3BP4-204ENST00000416021 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.04■■■■□ 3.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DISP1Q96F81 1524 aa35.03■■■■□ 3.2
SH3BP4-204ENST00000416021 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.9■■■■□ 3.18
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA3Q08378 1498 aa34.87■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.85■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0556O60303 1618 aa34.84■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.84■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 UACAQ9BZF9 1416 aa34.82■■■■□ 3.17
SH3BP4-204ENST00000416021 P3H3Q8IVL6 736 aa34.82■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF21BO75037 1637 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC2Q92887 1545 aa34.71■■■■□ 3.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.69■■■■□ 3.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPKBP1O60336 1514 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.64■■■■□ 3.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.61■■■■□ 3.13
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.57■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD9Q5K651 1589 aa34.55■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ASXL2Q76L83 1435 aa34.55■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA8O94911 1581 aa34.52■■■■□ 3.12
SH3BP4-204ENST00000416021 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.48■■■■□ 3.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ARID3CA6NKF2 412 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BP4-204ENST00000416021 DIP2BQ9P265 1576 aa34.43■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.43■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.4■■■■□ 3.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP10BO94823 1461 aa34.34■■■■□ 3.09
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH8Q96L42 1107 aa34.34■■■■□ 3.09
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.3■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.3■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 GLI2P10070 1586 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
SH3BP4-204ENST00000416021 FMN1Q68DA7 1419 aa34.19■■■■□ 3.06
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.15■■■■□ 3.06
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPOAP1O95153 1857 aa34.12■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.1■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CD109Q6YHK3 1445 aa34.09■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIP1P30622 1438 aa34.08■■■■□ 3.05
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.04■■■■□ 3.04
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX14Q8IWB6 1497 aa34■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.95■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM6BO15054 1643 aa33.93■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 HECW1Q76N89 1606 aa33.91■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.9■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.9■■■■□ 3.02
SH3BP4-204ENST00000416021 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP162Q5TB80 1403 aa33.87■■■■□ 3.01
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.84■■■■□ 3.01
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.76■■■■□ 3
SH3BP4-204ENST00000416021 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.75■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.74■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.72■■■□□ 2.99
SH3BP4-204ENST00000416021 NEO1Q92859 1461 aa33.68■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.67■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.65■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 RAPGEF3O95398 923 aa33.64■■■□□ 2.98
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCH2O75038 1416 aa33.63■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.62■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCAO15360 1455 aa33.6■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 AKNAQ7Z591 1439 aa33.6■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.59■■■□□ 2.97
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF14Q15058 1648 aa33.54■■■□□ 2.96
SH3BP4-204ENST00000416021 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
SH3BP4-204ENST00000416021 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.47■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.46■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.46■■■□□ 2.95
SH3BP4-204ENST00000416021 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.44■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.43■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRL1O94910 1474 aa33.4■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.39■■■□□ 2.94
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.37■■■□□ 2.93
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