RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 CHD1O14646 1710 aa22.97■■□□□ 1.27
SF3B1-204ENST00000414963 CEP170Q5SW79 1584 aa22.96■■□□□ 1.27
SF3B1-204ENST00000414963 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.93■■□□□ 1.26
SF3B1-204ENST00000414963 CEP162Q5TB80 1403 aa22.89■■□□□ 1.25
SF3B1-204ENST00000414963 IQGAP2Q13576 1575 aa22.89■■□□□ 1.25
SF3B1-204ENST00000414963 OSCARQ8IYS5 282 aa22.86■■□□□ 1.25
SF3B1-204ENST00000414963 CLIP1P30622 1438 aa22.84■■□□□ 1.25
SF3B1-204ENST00000414963 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.82■■□□□ 1.24
SF3B1-204ENST00000414963 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.82■■□□□ 1.24
SF3B1-204ENST00000414963 JPH4Q96JJ6 628 aa22.82■■□□□ 1.24
SF3B1-204ENST00000414963 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
SF3B1-204ENST00000414963 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.77■■□□□ 1.24
SF3B1-204ENST00000414963 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SF3B1-204ENST00000414963 SAMD9Q5K651 1589 aa22.74■■□□□ 1.23
SF3B1-204ENST00000414963 SHROOM2Q13796 1616 aa22.74■■□□□ 1.23
SF3B1-204ENST00000414963 DISP1Q96F81 1524 aa22.72■■□□□ 1.23
SF3B1-204ENST00000414963 ARAP1Q96P48 1450 aa22.68■■□□□ 1.22
SF3B1-204ENST00000414963 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
SF3B1-204ENST00000414963 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SF3B1-204ENST00000414963 KIAA0556O60303 1618 aa22.64■■□□□ 1.22
SF3B1-204ENST00000414963 P3H3Q8IVL6 736 aa22.64■■□□□ 1.21
SF3B1-204ENST00000414963 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.62■■□□□ 1.21
SF3B1-204ENST00000414963 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.58■■□□□ 1.21
SF3B1-204ENST00000414963 FMN1Q68DA7 1419 aa22.57■■□□□ 1.2
SF3B1-204ENST00000414963 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.54■■□□□ 1.2
SF3B1-204ENST00000414963 PTPRGP23470 1445 aa22.51■■□□□ 1.19
SF3B1-204ENST00000414963 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.48■■□□□ 1.19
SF3B1-204ENST00000414963 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
SF3B1-204ENST00000414963 ARHGEF11O15085 1522 aa22.42■■□□□ 1.18
SF3B1-204ENST00000414963 ABCA8O94911 1581 aa22.4■■□□□ 1.18
SF3B1-204ENST00000414963 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SF3B1-204ENST00000414963 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
SF3B1-204ENST00000414963 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.39■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 UACAQ9BZF9 1416 aa22.38■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.36■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 MAP3K1Q13233 1512 aa22.35■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.34■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 HECW1Q76N89 1606 aa22.33■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
SF3B1-204ENST00000414963 APLP2Q06481 763 aa22.32■■□□□ 1.16
SF3B1-204ENST00000414963 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SF3B1-204ENST00000414963 ABCC2Q92887 1545 aa22.3■■□□□ 1.16
SF3B1-204ENST00000414963 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.29■■□□□ 1.16
SF3B1-204ENST00000414963 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SF3B1-204ENST00000414963 TIAM1Q13009 1591 aa22.25■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 ATP10BO94823 1461 aa22.24■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.23■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.22■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.21■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.21■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.2■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.2■■□□□ 1.15
SF3B1-204ENST00000414963 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SF3B1-204ENST00000414963 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SF3B1-204ENST00000414963 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.18■■□□□ 1.14
SF3B1-204ENST00000414963 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SF3B1-204ENST00000414963 ARID3CA6NKF2 412 aa22.17■■□□□ 1.14
SF3B1-204ENST00000414963 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.12■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.11■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.11■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.09■■□□□ 1.13
SF3B1-204ENST00000414963 ASXL2Q76L83 1435 aa22■■□□□ 1.11
SF3B1-204ENST00000414963 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.99■■□□□ 1.11
SF3B1-204ENST00000414963 NCOA2Q15596 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
SF3B1-204ENST00000414963 MAPKBP1O60336 1514 aa21.98■■□□□ 1.11
SF3B1-204ENST00000414963 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SF3B1-204ENST00000414963 KIF14Q15058 1648 aa21.93■■□□□ 1.1
SF3B1-204ENST00000414963 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.93■■□□□ 1.1
SF3B1-204ENST00000414963 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.93■■□□□ 1.1
SF3B1-204ENST00000414963 KCNH8Q96L42 1107 aa21.91■■□□□ 1.1
SF3B1-204ENST00000414963 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.88■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.87■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 MIA2Q96PC5 1412 aa21.84■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.83■■□□□ 1.09
SF3B1-204ENST00000414963 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.81■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.81■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 GLI2P10070 1586 aa21.8■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 PLCH2O75038 1416 aa21.8■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.77■■□□□ 1.08
SF3B1-204ENST00000414963 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.76■■□□□ 1.07
SF3B1-204ENST00000414963 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SF3B1-204ENST00000414963 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.75■■□□□ 1.07
SF3B1-204ENST00000414963 PREX2Q70Z35 1606 aa21.74■■□□□ 1.07
SF3B1-204ENST00000414963 DIP2BQ9P265 1576 aa21.74■■□□□ 1.07
SF3B1-204ENST00000414963 CD109Q6YHK3 1445 aa21.72■■□□□ 1.07
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