RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.89■■□□□ 1.9
NEFHP1-201ENST00000412845 MAP3K1Q13233 1512 aa26.88■■□□□ 1.89
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.87■■□□□ 1.89
NEFHP1-201ENST00000412845 BCANQ96GW7 911 aa26.87■■□□□ 1.89
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
NEFHP1-201ENST00000412845 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.79■■□□□ 1.88
NEFHP1-201ENST00000412845 FKBP8Q14318 412 aa26.78■■□□□ 1.88
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NEFHP1-201ENST00000412845 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NEFHP1-201ENST00000412845 PRDM2Q13029 1718 aa26.75■■□□□ 1.87
NEFHP1-201ENST00000412845 P3H3Q8IVL6 736 aa26.74■■□□□ 1.87
NEFHP1-201ENST00000412845 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.72■■□□□ 1.87
NEFHP1-201ENST00000412845 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
NEFHP1-201ENST00000412845 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.71■■□□□ 1.87
NEFHP1-201ENST00000412845 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.69■■□□□ 1.86
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
NEFHP1-201ENST00000412845 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.67■■□□□ 1.86
NEFHP1-201ENST00000412845 TRIM52Q96A61 297 aa26.64■■□□□ 1.85
NEFHP1-201ENST00000412845 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.62■■□□□ 1.85
NEFHP1-201ENST00000412845 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.6■■□□□ 1.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CCER2I3L3R5 266 aa26.57■■□□□ 1.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.57■■□□□ 1.84
NEFHP1-201ENST00000412845 ANP32CO43423 234 aa26.56■■□□□ 1.84
NEFHP1-201ENST00000412845 NEFLP07196 543 aa26.53■■□□□ 1.84
NEFHP1-201ENST00000412845 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.5■■□□□ 1.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.46■■□□□ 1.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TONSLQ96HA7 1378 aa26.46■■□□□ 1.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.44■■□□□ 1.82
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.43■■□□□ 1.82
NEFHP1-201ENST00000412845 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.42■■□□□ 1.82
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPRKQ15262 1439 aa26.41■■□□□ 1.82
NEFHP1-201ENST00000412845 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.4■■□□□ 1.82
NEFHP1-201ENST00000412845 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
NEFHP1-201ENST00000412845 UACAQ9BZF9 1416 aa26.35■■□□□ 1.81
NEFHP1-201ENST00000412845 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.35■■□□□ 1.81
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.34■■□□□ 1.81
NEFHP1-201ENST00000412845 HFM1A2PYH4 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
NEFHP1-201ENST00000412845 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.33■■□□□ 1.81
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.32■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.31■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.31■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.29■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 FMN1Q68DA7 1419 aa26.28■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 NAIPQ13075 1403 aa26.28■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.28■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.27■■□□□ 1.8
NEFHP1-201ENST00000412845 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.26■■□□□ 1.79
NEFHP1-201ENST00000412845 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
NEFHP1-201ENST00000412845 CUL7Q14999 1698 aa26.25■■□□□ 1.79
NEFHP1-201ENST00000412845 TOPBP1Q92547 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
NEFHP1-201ENST00000412845 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NEFHP1-201ENST00000412845 NCOA2Q15596 1464 aa26.22■■□□□ 1.79
NEFHP1-201ENST00000412845 MSH5O43196 834 aa26.2■■□□□ 1.78
NEFHP1-201ENST00000412845 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.2■■□□□ 1.78
NEFHP1-201ENST00000412845 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.17■■□□□ 1.78
NEFHP1-201ENST00000412845 BCL11AQ9H165 835 aa26.16■■□□□ 1.78
NEFHP1-201ENST00000412845 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NEFHP1-201ENST00000412845 SAMD9Q5K651 1589 aa26.13■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 GRIN2BQ13224 1484 aa26.13■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.13■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 NESP48681 1621 aa26.12■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.09■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC184Q52MB2 194 aa26.09■■□□□ 1.77
NEFHP1-201ENST00000412845 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.06■■□□□ 1.76
NEFHP1-201ENST00000412845 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.05■■□□□ 1.76
NEFHP1-201ENST00000412845 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.05■■□□□ 1.76
NEFHP1-201ENST00000412845 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
NEFHP1-201ENST00000412845 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
NEFHP1-201ENST00000412845 KDM6BO15054 1643 aa26.03■■□□□ 1.76
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF11O15085 1522 aa26.01■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 FANCIQ9NVI1 1328 aa26■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 HECW1Q76N89 1606 aa26■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.99■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.96■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXD1Q16676 465 aa25.96■■□□□ 1.75
NEFHP1-201ENST00000412845 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.95■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.93■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.93■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.93■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.92■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC7Q96M83 1385 aa25.9■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 NCOA1Q15788 1441 aa25.89■■□□□ 1.74
NEFHP1-201ENST00000412845 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.88■■□□□ 1.73
NEFHP1-201ENST00000412845 MRS2Q9HD23 443 aa25.87■■□□□ 1.73
NEFHP1-201ENST00000412845 AKNAQ7Z591 1439 aa25.86■■□□□ 1.73
NEFHP1-201ENST00000412845 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.85■■□□□ 1.73
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.85■■□□□ 1.73
NEFHP1-201ENST00000412845 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.85■■□□□ 1.73
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