RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
LIMS1-204ENST00000409441 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.72■■□□□ 1.07
LIMS1-204ENST00000409441 GOLGA3Q08378 1498 aa21.71■■□□□ 1.07
LIMS1-204ENST00000409441 CEP170Q5SW79 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
LIMS1-204ENST00000409441 FOXD1Q16676 465 aa21.68■■□□□ 1.06
LIMS1-204ENST00000409441 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.65■■□□□ 1.06
LIMS1-204ENST00000409441 JPH4Q96JJ6 628 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-204ENST00000409441 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-204ENST00000409441 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-204ENST00000409441 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.56■■□□□ 1.04
LIMS1-204ENST00000409441 IQGAP2Q13576 1575 aa21.54■■□□□ 1.04
LIMS1-204ENST00000409441 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.52■■□□□ 1.04
LIMS1-204ENST00000409441 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-204ENST00000409441 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-204ENST00000409441 SHROOM2Q13796 1616 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-204ENST00000409441 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-204ENST00000409441 P3H3Q8IVL6 736 aa21.43■■□□□ 1.02
LIMS1-204ENST00000409441 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.42■■□□□ 1.02
LIMS1-204ENST00000409441 DISP1Q96F81 1524 aa21.4■■□□□ 1.02
LIMS1-204ENST00000409441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.39■■□□□ 1.02
LIMS1-204ENST00000409441 ARHGEF11O15085 1522 aa21.38■■□□□ 1.01
LIMS1-204ENST00000409441 CLIP1P30622 1438 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-204ENST00000409441 CEP162Q5TB80 1403 aa21.36■■□□□ 1.01
LIMS1-204ENST00000409441 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
LIMS1-204ENST00000409441 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 KIAA0556O60303 1618 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 SAMD9Q5K651 1589 aa21.32■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.31■■□□□ 1
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LIMS1-204ENST00000409441 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 PTPRGP23470 1445 aa21.31■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.29■■□□□ 1
LIMS1-204ENST00000409441 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.29■■□□□ 1
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LIMS1-204ENST00000409441 FMN1Q68DA7 1419 aa21.17■□□□□ 0.98
LIMS1-204ENST00000409441 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-204ENST00000409441 UACAQ9BZF9 1416 aa21.15■□□□□ 0.98
LIMS1-204ENST00000409441 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
LIMS1-204ENST00000409441 ABCA8O94911 1581 aa21.08■□□□□ 0.97
LIMS1-204ENST00000409441 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.07■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 ARID3CA6NKF2 412 aa21.07■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.07■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.05■□□□□ 0.96
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LIMS1-204ENST00000409441 ABCC2Q92887 1545 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 POTEDQ86YR6 584 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-204ENST00000409441 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
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LIMS1-204ENST00000409441 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
LIMS1-204ENST00000409441 ATP10BO94823 1461 aa20.98■□□□□ 0.95
LIMS1-204ENST00000409441 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.98■□□□□ 0.95
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LIMS1-204ENST00000409441 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.97■□□□□ 0.95
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LIMS1-204ENST00000409441 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
LIMS1-204ENST00000409441 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-204ENST00000409441 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
LIMS1-204ENST00000409441 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-204ENST00000409441 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-204ENST00000409441 ASXL2Q76L83 1435 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-204ENST00000409441 KCNH8Q96L42 1107 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-204ENST00000409441 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 MAPKBP1O60336 1514 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 MAP3K1Q13233 1512 aa20.81■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 TIAM1Q13009 1591 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.79■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.78■□□□□ 0.92
LIMS1-204ENST00000409441 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
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LIMS1-204ENST00000409441 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.73■□□□□ 0.91
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LIMS1-204ENST00000409441 HRCP23327 699 aa20.71■□□□□ 0.91
LIMS1-204ENST00000409441 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.7■□□□□ 0.9
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LIMS1-204ENST00000409441 MSH5O43196 834 aa20.63■□□□□ 0.89
LIMS1-204ENST00000409441 DIP2BQ9P265 1576 aa20.62■□□□□ 0.89
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LIMS1-204ENST00000409441 CD109Q6YHK3 1445 aa20.6■□□□□ 0.89
LIMS1-204ENST00000409441 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.59■□□□□ 0.89
LIMS1-204ENST00000409441 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
LIMS1-204ENST00000409441 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.57■□□□□ 0.88
LIMS1-204ENST00000409441 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.56■□□□□ 0.88
LIMS1-204ENST00000409441 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-204ENST00000409441 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LIMS1-204ENST00000409441 PLCH2O75038 1416 aa20.54■□□□□ 0.88
LIMS1-204ENST00000409441 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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