RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.88■■■■□ 3.17
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HOXD12-201ENST00000404162 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
HOXD12-201ENST00000404162 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.76■■■■□ 3.16
HOXD12-201ENST00000404162 MAPKBP1O60336 1514 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD12-201ENST00000404162 DIP2BQ9P265 1576 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXD12-201ENST00000404162 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.7■■■■□ 3.14
HOXD12-201ENST00000404162 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXD12-201ENST00000404162 KDM6BO15054 1643 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXD12-201ENST00000404162 TSPOAP1O95153 1857 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.52■■■■□ 3.12
HOXD12-201ENST00000404162 IGF1RP08069 1367 aa34.43■■■■□ 3.1
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HOXD12-201ENST00000404162 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXD12-201ENST00000404162 CUL7Q14999 1698 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXD12-201ENST00000404162 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
HOXD12-201ENST00000404162 KIF27Q86VH2 1401 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXD12-201ENST00000404162 ABCC2Q92887 1545 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 ASXL2Q76L83 1435 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXD12-201ENST00000404162 GLI2P10070 1586 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRL1O94910 1474 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXD12-201ENST00000404162 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.1■■■■□ 3.05
HOXD12-201ENST00000404162 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
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HOXD12-201ENST00000404162 UACAQ9BZF9 1416 aa34.06■■■■□ 3.04
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HOXD12-201ENST00000404162 DISP1Q96F81 1524 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.99■■■■□ 3.03
HOXD12-201ENST00000404162 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXD12-201ENST00000404162 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
HOXD12-201ENST00000404162 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXD12-201ENST00000404162 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA0556O60303 1618 aa33.79■■■■□ 3
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HOXD12-201ENST00000404162 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXD12-201ENST00000404162 CD109Q6YHK3 1445 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXD12-201ENST00000404162 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH8Q96L42 1107 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.61■■■□□ 2.97
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA8O94911 1581 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXD12-201ENST00000404162 KIF21BO75037 1637 aa33.53■■■□□ 2.96
HOXD12-201ENST00000404162 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA3Q08378 1498 aa33.47■■■□□ 2.95
HOXD12-201ENST00000404162 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO41Q8TF61 875 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD12-201ENST00000404162 ARID3CA6NKF2 412 aa33.35■■■□□ 2.93
HOXD12-201ENST00000404162 ATP10BO94823 1461 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRMP28827 1452 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.29■■■□□ 2.92
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HOXD12-201ENST00000404162 RAPGEF3O95398 923 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXD12-201ENST00000404162 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.21■■■□□ 2.91
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HOXD12-201ENST00000404162 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.14■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 NEO1Q92859 1461 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 MADDQ8WXG6 1647 aa33.1■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.09■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
HOXD12-201ENST00000404162 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.05■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.03■■■□□ 2.88
HOXD12-201ENST00000404162 SAMD9Q5K651 1589 aa33■■■□□ 2.87
HOXD12-201ENST00000404162 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
HOXD12-201ENST00000404162 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.92■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 HSPA2P54652 639 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 RICTORQ6R327 1708 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD12-201ENST00000404162 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.88■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 AKNAQ7Z591 1439 aa32.86■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.84■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 FANCAO15360 1455 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.77■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD12-201ENST00000404162 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 CERKQ8TCT0 537 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 MLECQ14165 292 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.7■■■□□ 2.83
HOXD12-201ENST00000404162 HECW1Q76N89 1606 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD12-201ENST00000404162 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD12-201ENST00000404162 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD12-201ENST00000404162 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.6■■■□□ 2.81
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