RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.88■■■■■ 5.58
PKDCC-202ENST00000401498 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.88■■■■■ 5.58
PKDCC-202ENST00000401498 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.88■■■■■ 5.58
PKDCC-202ENST00000401498 SHROOM2Q13796 1616 aa49.85■■■■■ 5.57
PKDCC-202ENST00000401498 JPH4Q96JJ6 628 aa49.79■■■■■ 5.56
PKDCC-202ENST00000401498 KIF21BO75037 1637 aa49.77■■■■■ 5.56
PKDCC-202ENST00000401498 IQGAP2Q13576 1575 aa49.71■■■■■ 5.55
PKDCC-202ENST00000401498 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.7■■■■■ 5.55
PKDCC-202ENST00000401498 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.67■■■■■ 5.54
PKDCC-202ENST00000401498 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
PKDCC-202ENST00000401498 ARAP1Q96P48 1450 aa49.56■■■■■ 5.52
PKDCC-202ENST00000401498 EHMT2Q96KQ7 1210 aa49.51■■■■■ 5.52
PKDCC-202ENST00000401498 GOLGA3Q08378 1498 aa49.49■■■■■ 5.51
PKDCC-202ENST00000401498 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.45■■■■■ 5.51
PKDCC-202ENST00000401498 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.44■■■■■ 5.5
PKDCC-202ENST00000401498 DISP1Q96F81 1524 aa49.35■■■■■ 5.49
PKDCC-202ENST00000401498 UBTFP17480 764 aaKnown RBP49.35■■■■■ 5.49
PKDCC-202ENST00000401498 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.33■■■■■ 5.49
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA0556O60303 1618 aa49.24■■■■■ 5.47
PKDCC-202ENST00000401498 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.16■■■■■ 5.46
PKDCC-202ENST00000401498 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP49.11■■■■■ 5.45
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRGP23470 1445 aa49.09■■■■■ 5.45
PKDCC-202ENST00000401498 SAMD9Q5K651 1589 aa49.08■■■■■ 5.45
PKDCC-202ENST00000401498 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
PKDCC-202ENST00000401498 P3H3Q8IVL6 736 aa48.99■■■■■ 5.43
PKDCC-202ENST00000401498 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa48.92■■■■■ 5.42
PKDCC-202ENST00000401498 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.91■■■■■ 5.42
PKDCC-202ENST00000401498 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.84■■■■■ 5.41
PKDCC-202ENST00000401498 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.81■■■■■ 5.4
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa48.79■■■■■ 5.4
PKDCC-202ENST00000401498 UACAQ9BZF9 1416 aa48.79■■■■■ 5.4
PKDCC-202ENST00000401498 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.72■■■■■ 5.39
PKDCC-202ENST00000401498 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.71■■■■■ 5.39
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC2Q92887 1545 aa48.69■■■■■ 5.39
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA8O94911 1581 aa48.67■■■■■ 5.38
PKDCC-202ENST00000401498 CLIP1P30622 1438 aa48.63■■■■■ 5.38
PKDCC-202ENST00000401498 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.56■■■■■ 5.36
PKDCC-202ENST00000401498 CEP162Q5TB80 1403 aa48.54■■■■■ 5.36
PKDCC-202ENST00000401498 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.5■■■■■ 5.35
PKDCC-202ENST00000401498 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.49■■■■■ 5.35
PKDCC-202ENST00000401498 FMN1Q68DA7 1419 aa48.46■■■■■ 5.35
PKDCC-202ENST00000401498 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
PKDCC-202ENST00000401498 MAPKBP1O60336 1514 aa48.41■■■■■ 5.34
PKDCC-202ENST00000401498 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
PKDCC-202ENST00000401498 ARID3CA6NKF2 412 aa48.3■■■■■ 5.32
PKDCC-202ENST00000401498 ATP10BO94823 1461 aa48.29■■■■■ 5.32
PKDCC-202ENST00000401498 ASXL2Q76L83 1435 aa48.25■■■■■ 5.32
PKDCC-202ENST00000401498 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
PKDCC-202ENST00000401498 HECW1Q76N89 1606 aa48.18■■■■■ 5.3
PKDCC-202ENST00000401498 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
PKDCC-202ENST00000401498 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa48.15■■■■■ 5.3
PKDCC-202ENST00000401498 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.13■■■■■ 5.3
PKDCC-202ENST00000401498 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.11■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP48.09■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 DIP2BQ9P265 1576 aa48.08■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.07■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
PKDCC-202ENST00000401498 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa48.06■■■■■ 5.28
PKDCC-202ENST00000401498 FYCO1Q9BQS8 1478 aa48.05■■■■■ 5.28
PKDCC-202ENST00000401498 FAM69CQ0P6D2 419 aa48■■■■■ 5.28
PKDCC-202ENST00000401498 VPS8Q8N3P4 1428 aa47.92■■■■■ 5.26
PKDCC-202ENST00000401498 KCNH8Q96L42 1107 aa47.9■■■■■ 5.26
PKDCC-202ENST00000401498 GLI2P10070 1586 aa47.89■■■■■ 5.26
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.88■■■■■ 5.26
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.88■■■■■ 5.26
PKDCC-202ENST00000401498 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.77■■■■■ 5.24
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.72■■■■■ 5.23
PKDCC-202ENST00000401498 TSPOAP1O95153 1857 aa47.7■■■■■ 5.23
PKDCC-202ENST00000401498 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.65■■■■■ 5.22
PKDCC-202ENST00000401498 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
PKDCC-202ENST00000401498 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.65■■■■■ 5.22
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.64■■■■■ 5.22
PKDCC-202ENST00000401498 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
PKDCC-202ENST00000401498 CD109Q6YHK3 1445 aa47.58■■■■■ 5.21
PKDCC-202ENST00000401498 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.56■■■■■ 5.2
PKDCC-202ENST00000401498 KIF14Q15058 1648 aa47.54■■■■■ 5.2
PKDCC-202ENST00000401498 TIAM1Q13009 1591 aa47.52■■■■■ 5.2
PKDCC-202ENST00000401498 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.5■■■■■ 5.2
PKDCC-202ENST00000401498 MTUS2Q5JR59 1369 aa47.45■■■■■ 5.19
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K1Q13233 1512 aa47.44■■■■■ 5.18
PKDCC-202ENST00000401498 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.39■■■■■ 5.18
PKDCC-202ENST00000401498 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa47.38■■■■■ 5.17
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa47.31■■■■■ 5.16
PKDCC-202ENST00000401498 APLP2Q06481 763 aa47.31■■■■■ 5.16
PKDCC-202ENST00000401498 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP47.29■■■■■ 5.16
PKDCC-202ENST00000401498 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.28■■■■■ 5.16
PKDCC-202ENST00000401498 PLCH2O75038 1416 aa47.27■■■■■ 5.16
PKDCC-202ENST00000401498 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.17■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.17■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 NEO1Q92859 1461 aa47.17■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 FANCAO15360 1455 aa47.16■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.16■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 KDM6BO15054 1643 aa47.16■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 PREX2Q70Z35 1606 aa47.14■■■■■ 5.14
PKDCC-202ENST00000401498 NCOA2Q15596 1464 aa47.12■■■■■ 5.13
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