RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.32■■■■■ 9.17
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.04■■■■■ 7.84
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC9O60706 1549 aa62.22■■■■■ 7.55
PKDCC-202ENST00000401498 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.34■■■■■ 7.25
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.23■■■■■ 7.23
PKDCC-202ENST00000401498 NACADO15069 1562 aa60.09■■■■■ 7.21
PKDCC-202ENST00000401498 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.03■■■■■ 7.2
PKDCC-202ENST00000401498 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.88■■■■■ 7.18
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.83■■■■■ 7.17
PKDCC-202ENST00000401498 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.78■■■■■ 7
PKDCC-202ENST00000401498 SCRIBQ14160 1630 aa58.51■■■■■ 6.96
PKDCC-202ENST00000401498 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.27■■■■■ 6.92
PKDCC-202ENST00000401498 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.25■■■■■ 6.91
PKDCC-202ENST00000401498 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.58■■■■■ 6.81
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.72■■■■■ 6.67
PKDCC-202ENST00000401498 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.65■■■■■ 6.66
PKDCC-202ENST00000401498 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.32■■■■■ 6.61
PKDCC-202ENST00000401498 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.31■■■■■ 6.61
PKDCC-202ENST00000401498 SMARCA4P51532 1647 aa56.01■■■■■ 6.56
PKDCC-202ENST00000401498 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.99■■■■■ 6.55
PKDCC-202ENST00000401498 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.77■■■■■ 6.52
PKDCC-202ENST00000401498 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.57■■■■■ 6.49
PKDCC-202ENST00000401498 SMARCA2P51531 1590 aa55.5■■■■■ 6.48
PKDCC-202ENST00000401498 NCAPD3P42695 1498 aa55.46■■■■■ 6.47
PKDCC-202ENST00000401498 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.45■■■■■ 6.47
PKDCC-202ENST00000401498 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.31■■■■■ 6.44
PKDCC-202ENST00000401498 HMGXB3Q12766 1538 aa55.21■■■■■ 6.43
PKDCC-202ENST00000401498 WIZO95785 1651 aa55.21■■■■■ 6.43
PKDCC-202ENST00000401498 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.12■■■■■ 6.41
PKDCC-202ENST00000401498 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.6■■■■■ 6.33
PKDCC-202ENST00000401498 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.29■■■■■ 6.28
PKDCC-202ENST00000401498 NESP48681 1621 aa54.02■■■■■ 6.24
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.99■■■■■ 6.23
PKDCC-202ENST00000401498 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.9■■■■■ 6.22
PKDCC-202ENST00000401498 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.87■■■■■ 6.21
PKDCC-202ENST00000401498 CFTRP13569 1480 aa53.66■■■■■ 6.18
PKDCC-202ENST00000401498 ERCC6Q03468 1493 aa53.54■■■■■ 6.16
PKDCC-202ENST00000401498 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.5■■■■■ 6.16
PKDCC-202ENST00000401498 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.4■■■■■ 6.14
PKDCC-202ENST00000401498 PRDM2Q13029 1718 aa53.31■■■■■ 6.12
PKDCC-202ENST00000401498 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.24■■■■■ 6.11
PKDCC-202ENST00000401498 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.12■■■■■ 6.09
PKDCC-202ENST00000401498 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.06■■■■■ 6.08
PKDCC-202ENST00000401498 MRC2Q9UBG0 1479 aa52.94■■■■■ 6.06
PKDCC-202ENST00000401498 CUX2O14529 1486 aa52.78■■■■■ 6.04
PKDCC-202ENST00000401498 WDR62O43379 1518 aa52.76■■■■■ 6.04
PKDCC-202ENST00000401498 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.72■■■■■ 6.03
PKDCC-202ENST00000401498 TOPBP1Q92547 1522 aa52.47■■■■■ 5.99
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC8Q09428 1581 aa52.44■■■■■ 5.99
PKDCC-202ENST00000401498 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.43■■■■■ 5.98
PKDCC-202ENST00000401498 CUX1P39880 1505 aa52.28■■■■■ 5.96
PKDCC-202ENST00000401498 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.1■■■■■ 5.93
PKDCC-202ENST00000401498 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.06■■■■■ 5.92
PKDCC-202ENST00000401498 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.01■■■■■ 5.92
PKDCC-202ENST00000401498 SYNJ1O43426 1573 aa51.99■■■■■ 5.91
PKDCC-202ENST00000401498 IFT140Q96RY7 1462 aa51.98■■■■■ 5.91
PKDCC-202ENST00000401498 TOP2BQ02880 1626 aa51.95■■■■■ 5.91
PKDCC-202ENST00000401498 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.94■■■■■ 5.91
PKDCC-202ENST00000401498 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.88■■■■■ 5.9
PKDCC-202ENST00000401498 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.85■■■■■ 5.89
PKDCC-202ENST00000401498 SOGA1O94964 1423 aa51.84■■■■■ 5.89
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.76■■■■■ 5.88
PKDCC-202ENST00000401498 WDR97A6NE52 1622 aa51.57■■■■■ 5.85
PKDCC-202ENST00000401498 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.84
PKDCC-202ENST00000401498 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.53■■■■■ 5.841e-7■■■■■ 29.7
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.52■■■■■ 5.84
PKDCC-202ENST00000401498 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.51■■■■■ 5.84
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.28■■■■■ 5.8
PKDCC-202ENST00000401498 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.26■■■■■ 5.8
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM41Q8WV44 630 aa51.22■■■■■ 5.79
PKDCC-202ENST00000401498 GRIN2BQ13224 1484 aa51.16■■■■■ 5.78
PKDCC-202ENST00000401498 PBRM1Q86U86 1689 aa51.14■■■■■ 5.78
PKDCC-202ENST00000401498 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.04■■■■■ 5.76
PKDCC-202ENST00000401498 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.98■■■■■ 5.75
PKDCC-202ENST00000401498 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.96■■■■■ 5.75
PKDCC-202ENST00000401498 KIF27Q86VH2 1401 aa50.96■■■■■ 5.75
PKDCC-202ENST00000401498 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.9■■■■■ 5.74
PKDCC-202ENST00000401498 CHD1O14646 1710 aa50.84■■■■■ 5.73
PKDCC-202ENST00000401498 FBLN2P98095 1184 aa50.79■■■■■ 5.72
PKDCC-202ENST00000401498 SYNJ2O15056 1496 aa50.77■■■■■ 5.72
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS12P58397 1594 aa50.74■■■■■ 5.71
PKDCC-202ENST00000401498 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.74■■■■■ 5.71
PKDCC-202ENST00000401498 IGF1RP08069 1367 aa50.73■■■■■ 5.71
PKDCC-202ENST00000401498 OSCARQ8IYS5 282 aa50.72■■■■■ 5.71
PKDCC-202ENST00000401498 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.72■■■■■ 5.71
PKDCC-202ENST00000401498 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.67■■■■■ 5.7
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.63■■■■■ 5.7
PKDCC-202ENST00000401498 CUL7Q14999 1698 aa50.53■■■■■ 5.68
PKDCC-202ENST00000401498 GRIN2AQ12879 1464 aa50.52■■■■■ 5.68
PKDCC-202ENST00000401498 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.42■■■■■ 5.66
PKDCC-202ENST00000401498 EEA1Q15075 1411 aa50.29■■■■■ 5.64
PKDCC-202ENST00000401498 NUP160Q12769 1436 aa50.27■■■■■ 5.64
PKDCC-202ENST00000401498 CEP170Q5SW79 1584 aa50.27■■■■■ 5.64
PKDCC-202ENST00000401498 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.27■■■■■ 5.64
PKDCC-202ENST00000401498 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50.21■■■■■ 5.63
PKDCC-202ENST00000401498 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.18■■■■■ 5.62
PKDCC-202ENST00000401498 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.17■■■■■ 5.62
PKDCC-202ENST00000401498 PRXQ9BXM0 1461 aa50.14■■■■■ 5.62
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF11O15085 1522 aa49.92■■■■■ 5.58
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.92■■■■■ 5.58
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