RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395873.7

ZNF248-204, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF248, Length 698 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-204ENST00000395873 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
ZNF248-204ENST00000395873 JPH4Q96JJ6 628 aa37.75■■■■□ 3.63
ZNF248-204ENST00000395873 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.73■■■■□ 3.63
ZNF248-204ENST00000395873 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.72■■■■□ 3.63
ZNF248-204ENST00000395873 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.5■■■■□ 3.59
ZNF248-204ENST00000395873 IQGAP2Q13576 1575 aa37.5■■■■□ 3.59
ZNF248-204ENST00000395873 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.4■■■■□ 3.58
ZNF248-204ENST00000395873 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.32■■■■□ 3.57
ZNF248-204ENST00000395873 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.31■■■■□ 3.56
ZNF248-204ENST00000395873 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.3■■■■□ 3.56
ZNF248-204ENST00000395873 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.25■■■■□ 3.55
ZNF248-204ENST00000395873 PTPRGP23470 1445 aa37.25■■■■□ 3.55
ZNF248-204ENST00000395873 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.23■■■■□ 3.55
ZNF248-204ENST00000395873 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.23■■■■□ 3.55
ZNF248-204ENST00000395873 MAPKBP1O60336 1514 aa37.22■■■■□ 3.55
ZNF248-204ENST00000395873 PRXQ9BXM0 1461 aa37.19■■■■□ 3.54
ZNF248-204ENST00000395873 DISP1Q96F81 1524 aa37.15■■■■□ 3.54
ZNF248-204ENST00000395873 KIAA0556O60303 1618 aa37.13■■■■□ 3.53
ZNF248-204ENST00000395873 EEA1Q15075 1411 aa37.1■■■■□ 3.53
ZNF248-204ENST00000395873 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.07■■■■□ 3.52
ZNF248-204ENST00000395873 GOLGA3Q08378 1498 aa37.06■■■■□ 3.52
ZNF248-204ENST00000395873 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
ZNF248-204ENST00000395873 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.03■■■■□ 3.52
ZNF248-204ENST00000395873 ABCC2Q92887 1545 aa37.03■■■■□ 3.52
ZNF248-204ENST00000395873 DIP2BQ9P265 1576 aa37.02■■■■□ 3.52
ZNF248-204ENST00000395873 UACAQ9BZF9 1416 aa37.01■■■■□ 3.51
ZNF248-204ENST00000395873 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37■■■■□ 3.51
ZNF248-204ENST00000395873 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.95■■■■□ 3.51
ZNF248-204ENST00000395873 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.86■■■■□ 3.49
ZNF248-204ENST00000395873 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.84■■■■□ 3.49
ZNF248-204ENST00000395873 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
ZNF248-204ENST00000395873 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
ZNF248-204ENST00000395873 ASXL2Q76L83 1435 aa36.8■■■■□ 3.48
ZNF248-204ENST00000395873 TSPOAP1O95153 1857 aa36.79■■■■□ 3.48
ZNF248-204ENST00000395873 GLI2P10070 1586 aa36.74■■■■□ 3.47
ZNF248-204ENST00000395873 KIF21BO75037 1637 aa36.74■■■■□ 3.47
ZNF248-204ENST00000395873 ABCA8O94911 1581 aa36.72■■■■□ 3.47
ZNF248-204ENST00000395873 SAMD9Q5K651 1589 aa36.7■■■■□ 3.47
ZNF248-204ENST00000395873 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.67■■■■□ 3.46
ZNF248-204ENST00000395873 KDM6BO15054 1643 aa36.62■■■■□ 3.45
ZNF248-204ENST00000395873 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
ZNF248-204ENST00000395873 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.58■■■■□ 3.45
ZNF248-204ENST00000395873 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.56■■■■□ 3.44
ZNF248-204ENST00000395873 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
ZNF248-204ENST00000395873 P3H3Q8IVL6 736 aa36.52■■■■□ 3.44
ZNF248-204ENST00000395873 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.49■■■■□ 3.43
ZNF248-204ENST00000395873 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.48■■■■□ 3.43
ZNF248-204ENST00000395873 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.47■■■■□ 3.43
ZNF248-204ENST00000395873 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.45■■■■□ 3.42
ZNF248-204ENST00000395873 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
ZNF248-204ENST00000395873 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.35■■■■□ 3.41
ZNF248-204ENST00000395873 ATP10BO94823 1461 aa36.35■■■■□ 3.41
ZNF248-204ENST00000395873 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
ZNF248-204ENST00000395873 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
ZNF248-204ENST00000395873 KCNH8Q96L42 1107 aa36.29■■■■□ 3.4
ZNF248-204ENST00000395873 CD109Q6YHK3 1445 aa36.27■■■■□ 3.4
ZNF248-204ENST00000395873 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.27■■■■□ 3.4
ZNF248-204ENST00000395873 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
ZNF248-204ENST00000395873 ARID3CA6NKF2 412 aa36.24■■■■□ 3.39
ZNF248-204ENST00000395873 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ZNF248-204ENST00000395873 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
ZNF248-204ENST00000395873 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.19■■■■□ 3.38
ZNF248-204ENST00000395873 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.18■■■■□ 3.38
ZNF248-204ENST00000395873 FMN1Q68DA7 1419 aa36.13■■■■□ 3.37
ZNF248-204ENST00000395873 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
ZNF248-204ENST00000395873 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.08■■■■□ 3.37
ZNF248-204ENST00000395873 HECW1Q76N89 1606 aa36.06■■■■□ 3.36
ZNF248-204ENST00000395873 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.05■■■■□ 3.36
ZNF248-204ENST00000395873 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.02■■■■□ 3.36
ZNF248-204ENST00000395873 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.97■■■■□ 3.35
ZNF248-204ENST00000395873 NEO1Q92859 1461 aa35.94■■■■□ 3.34
ZNF248-204ENST00000395873 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
ZNF248-204ENST00000395873 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.9■■■■□ 3.34
ZNF248-204ENST00000395873 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
ZNF248-204ENST00000395873 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.86■■■■□ 3.33
ZNF248-204ENST00000395873 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
ZNF248-204ENST00000395873 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.81■■■■□ 3.32
ZNF248-204ENST00000395873 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.8■■■■□ 3.32
ZNF248-204ENST00000395873 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.78■■■■□ 3.32
ZNF248-204ENST00000395873 ADGRL1O94910 1474 aa35.78■■■■□ 3.32
ZNF248-204ENST00000395873 KIF14Q15058 1648 aa35.74■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.74■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 FANCAO15360 1455 aa35.73■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.73■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 CLIP1P30622 1438 aa35.73■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.73■■■■□ 3.31
ZNF248-204ENST00000395873 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
ZNF248-204ENST00000395873 AKNAQ7Z591 1439 aa35.67■■■■□ 3.3
ZNF248-204ENST00000395873 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.67■■■■□ 3.3
ZNF248-204ENST00000395873 RICTORQ6R327 1708 aa35.66■■■■□ 3.3
ZNF248-204ENST00000395873 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.66■■■■□ 3.3
ZNF248-204ENST00000395873 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
ZNF248-204ENST00000395873 PLCH2O75038 1416 aa35.63■■■■□ 3.29
ZNF248-204ENST00000395873 RAPGEF3O95398 923 aa35.62■■■■□ 3.29
ZNF248-204ENST00000395873 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.52■■■■□ 3.28
ZNF248-204ENST00000395873 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.52■■■■□ 3.28
ZNF248-204ENST00000395873 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.51■■■■□ 3.28
ZNF248-204ENST00000395873 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.48■■■■□ 3.27
ZNF248-204ENST00000395873 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.47■■■■□ 3.27
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