RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393985.7

CXorf40A-202, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-202ENST00000393985 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.27■■■□□ 2.44
CXorf40A-202ENST00000393985 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.24■■■□□ 2.43
CXorf40A-202ENST00000393985 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.2■■■□□ 2.43
CXorf40A-202ENST00000393985 IQGAP2Q13576 1575 aa30.2■■■□□ 2.42
CXorf40A-202ENST00000393985 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.18■■■□□ 2.42
CXorf40A-202ENST00000393985 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.17■■■□□ 2.42
CXorf40A-202ENST00000393985 PRXQ9BXM0 1461 aa30.16■■■□□ 2.42
CXorf40A-202ENST00000393985 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CXorf40A-202ENST00000393985 JPH4Q96JJ6 628 aa30.13■■■□□ 2.41
CXorf40A-202ENST00000393985 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.09■■■□□ 2.41
CXorf40A-202ENST00000393985 KIF21BO75037 1637 aa30■■■□□ 2.39
CXorf40A-202ENST00000393985 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.99■■■□□ 2.39
CXorf40A-202ENST00000393985 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CXorf40A-202ENST00000393985 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.96■■■□□ 2.39
CXorf40A-202ENST00000393985 KIAA0556O60303 1618 aa29.89■■■□□ 2.38
CXorf40A-202ENST00000393985 DISP1Q96F81 1524 aa29.86■■■□□ 2.37
CXorf40A-202ENST00000393985 GOLGA3Q08378 1498 aa29.85■■■□□ 2.37
CXorf40A-202ENST00000393985 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.83■■■□□ 2.37
CXorf40A-202ENST00000393985 PTPRGP23470 1445 aa29.79■■■□□ 2.36
CXorf40A-202ENST00000393985 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.76■■■□□ 2.35
CXorf40A-202ENST00000393985 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CXorf40A-202ENST00000393985 SAMD9Q5K651 1589 aa29.69■■■□□ 2.34
CXorf40A-202ENST00000393985 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 ABCC2Q92887 1545 aa29.62■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 UACAQ9BZF9 1416 aa29.61■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.61■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.61■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 MAPKBP1O60336 1514 aa29.59■■■□□ 2.33
CXorf40A-202ENST00000393985 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.57■■■□□ 2.32
CXorf40A-202ENST00000393985 ABCA8O94911 1581 aa29.51■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.5■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.48■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 P3H3Q8IVL6 736 aa29.47■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.45■■■□□ 2.31
CXorf40A-202ENST00000393985 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.44■■■□□ 2.3
CXorf40A-202ENST00000393985 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.43■■■□□ 2.3
CXorf40A-202ENST00000393985 DIP2BQ9P265 1576 aa29.41■■■□□ 2.3
CXorf40A-202ENST00000393985 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.38■■■□□ 2.29
CXorf40A-202ENST00000393985 ASXL2Q76L83 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
CXorf40A-202ENST00000393985 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.34■■■□□ 2.29
CXorf40A-202ENST00000393985 FMN1Q68DA7 1419 aa29.28■■■□□ 2.28
CXorf40A-202ENST00000393985 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.25■■■□□ 2.27
CXorf40A-202ENST00000393985 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.25■■■□□ 2.27
CXorf40A-202ENST00000393985 GLI2P10070 1586 aa29.23■■■□□ 2.27
CXorf40A-202ENST00000393985 HECW1Q76N89 1606 aa29.23■■■□□ 2.27
CXorf40A-202ENST00000393985 TSPOAP1O95153 1857 aa29.22■■■□□ 2.27
CXorf40A-202ENST00000393985 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CXorf40A-202ENST00000393985 CLIP1P30622 1438 aa29.2■■■□□ 2.26
CXorf40A-202ENST00000393985 ATP10BO94823 1461 aa29.19■■■□□ 2.26
CXorf40A-202ENST00000393985 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CXorf40A-202ENST00000393985 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.14■■■□□ 2.26
CXorf40A-202ENST00000393985 ARID3CA6NKF2 412 aa29.14■■■□□ 2.26
CXorf40A-202ENST00000393985 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.12■■■□□ 2.25
CXorf40A-202ENST00000393985 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CXorf40A-202ENST00000393985 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CXorf40A-202ENST00000393985 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CXorf40A-202ENST00000393985 CEP162Q5TB80 1403 aa29.07■■■□□ 2.24
CXorf40A-202ENST00000393985 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CXorf40A-202ENST00000393985 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CXorf40A-202ENST00000393985 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.03■■■□□ 2.24
CXorf40A-202ENST00000393985 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CXorf40A-202ENST00000393985 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.01■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.01■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.01■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 KCNH8Q96L42 1107 aa29■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.98■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 KDM6BO15054 1643 aa28.98■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.96■■■□□ 2.23
CXorf40A-202ENST00000393985 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.95■■■□□ 2.22
CXorf40A-202ENST00000393985 CD109Q6YHK3 1445 aa28.94■■■□□ 2.22
CXorf40A-202ENST00000393985 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CXorf40A-202ENST00000393985 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.9■■■□□ 2.22
CXorf40A-202ENST00000393985 KIF14Q15058 1648 aa28.87■■■□□ 2.21
CXorf40A-202ENST00000393985 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.83■■■□□ 2.21
CXorf40A-202ENST00000393985 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
CXorf40A-202ENST00000393985 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.8■■■□□ 2.2
CXorf40A-202ENST00000393985 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CXorf40A-202ENST00000393985 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.8■■■□□ 2.2
CXorf40A-202ENST00000393985 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.74■■■□□ 2.19
CXorf40A-202ENST00000393985 NEO1Q92859 1461 aa28.72■■■□□ 2.19
CXorf40A-202ENST00000393985 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.7■■■□□ 2.18
CXorf40A-202ENST00000393985 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.66■■■□□ 2.18
CXorf40A-202ENST00000393985 FANCAO15360 1455 aa28.66■■■□□ 2.18
CXorf40A-202ENST00000393985 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.64■■■□□ 2.18
CXorf40A-202ENST00000393985 PREX2Q70Z35 1606 aa28.62■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 TIAM1Q13009 1591 aa28.62■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.62■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 PLCH2O75038 1416 aa28.6■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.59■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.58■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.58■■■□□ 2.17
CXorf40A-202ENST00000393985 AKNAQ7Z591 1439 aa28.55■■■□□ 2.16
CXorf40A-202ENST00000393985 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CXorf40A-202ENST00000393985 RICTORQ6R327 1708 aa28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms