RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393190.4

NME2-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME2, Length 866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2-202ENST00000393190 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
NME2-202ENST00000393190 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
NME2-202ENST00000393190 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.1■■■■■ 4.81
NME2-202ENST00000393190 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.04■■■■■ 4.8
NME2-202ENST00000393190 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.74■■■■■ 4.75
NME2-202ENST00000393190 IQGAP2Q13576 1575 aa44.68■■■■■ 4.74
NME2-202ENST00000393190 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.6■■■■■ 4.73
NME2-202ENST00000393190 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.52■■■■■ 4.72
NME2-202ENST00000393190 PTPRGP23470 1445 aa44.51■■■■■ 4.72
NME2-202ENST00000393190 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.48■■■■■ 4.71
NME2-202ENST00000393190 DISP1Q96F81 1524 aa44.47■■■■■ 4.71
NME2-202ENST00000393190 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
NME2-202ENST00000393190 PRXQ9BXM0 1461 aa44.46■■■■■ 4.71
NME2-202ENST00000393190 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.45■■■■■ 4.71
NME2-202ENST00000393190 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.44■■■■■ 4.7
NME2-202ENST00000393190 KIF13AQ9H1H9 1805 aa44.44■■■■■ 4.7
NME2-202ENST00000393190 MAPKBP1O60336 1514 aa44.39■■■■■ 4.7
NME2-202ENST00000393190 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.35■■■■■ 4.69
NME2-202ENST00000393190 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.29■■■■■ 4.68
NME2-202ENST00000393190 KIAA0556O60303 1618 aa44.28■■■■■ 4.68
NME2-202ENST00000393190 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.24■■■■■ 4.67
NME2-202ENST00000393190 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.23■■■■■ 4.67
NME2-202ENST00000393190 DIP2BQ9P265 1576 aa44.21■■■■■ 4.67
NME2-202ENST00000393190 ABCC2Q92887 1545 aa44.2■■■■■ 4.67
NME2-202ENST00000393190 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.2■■■■■ 4.67
NME2-202ENST00000393190 UACAQ9BZF9 1416 aa44.19■■■■■ 4.66
NME2-202ENST00000393190 EEA1Q15075 1411 aa44.08■■■■■ 4.65
NME2-202ENST00000393190 GOLGA3Q08378 1498 aa44.06■■■■■ 4.64
NME2-202ENST00000393190 ASXL2Q76L83 1435 aa44.01■■■■■ 4.64
NME2-202ENST00000393190 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.99■■■■■ 4.63
NME2-202ENST00000393190 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
NME2-202ENST00000393190 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.96■■■■■ 4.63
NME2-202ENST00000393190 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.96■■■■■ 4.63
NME2-202ENST00000393190 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
NME2-202ENST00000393190 TSPOAP1O95153 1857 aa43.91■■■■■ 4.62
NME2-202ENST00000393190 ABCA8O94911 1581 aa43.87■■■■■ 4.61
NME2-202ENST00000393190 P3H3Q8IVL6 736 aa43.83■■■■■ 4.61
NME2-202ENST00000393190 GLI2P10070 1586 aa43.82■■■■■ 4.61
NME2-202ENST00000393190 SAMD9Q5K651 1589 aa43.78■■■■■ 4.6
NME2-202ENST00000393190 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
NME2-202ENST00000393190 KIF21BO75037 1637 aa43.75■■■■■ 4.59
NME2-202ENST00000393190 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.7■■■■■ 4.59
NME2-202ENST00000393190 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.65■■■■■ 4.58
NME2-202ENST00000393190 KDM6BO15054 1643 aa43.65■■■■■ 4.58
NME2-202ENST00000393190 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
NME2-202ENST00000393190 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.61■■■■■ 4.57
NME2-202ENST00000393190 ARID3CA6NKF2 412 aa43.54■■■■■ 4.56
NME2-202ENST00000393190 ATP10BO94823 1461 aa43.52■■■■■ 4.56
NME2-202ENST00000393190 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.52■■■■■ 4.56
NME2-202ENST00000393190 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.51■■■■■ 4.56
NME2-202ENST00000393190 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.48■■■■■ 4.55
NME2-202ENST00000393190 KCNH8Q96L42 1107 aa43.47■■■■■ 4.55
NME2-202ENST00000393190 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.39■■■■■ 4.54
NME2-202ENST00000393190 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
NME2-202ENST00000393190 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.38■■■■■ 4.53
NME2-202ENST00000393190 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
NME2-202ENST00000393190 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
NME2-202ENST00000393190 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
NME2-202ENST00000393190 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.35■■■■■ 4.53
NME2-202ENST00000393190 CD109Q6YHK3 1445 aa43.33■■■■■ 4.53
NME2-202ENST00000393190 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa43.28■■■■■ 4.52
NME2-202ENST00000393190 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
NME2-202ENST00000393190 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
NME2-202ENST00000393190 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.17■■■■■ 4.5
NME2-202ENST00000393190 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.15■■■■■ 4.5
NME2-202ENST00000393190 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.06■■■■■ 4.48
NME2-202ENST00000393190 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.01■■■■■ 4.48
NME2-202ENST00000393190 FMN1Q68DA7 1419 aa42.99■■■■■ 4.47
NME2-202ENST00000393190 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
NME2-202ENST00000393190 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.93■■■■■ 4.46
NME2-202ENST00000393190 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
NME2-202ENST00000393190 HECW1Q76N89 1606 aa42.88■■■■■ 4.45
NME2-202ENST00000393190 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.85■■■■■ 4.453e-8■□□□□ 10.1
NME2-202ENST00000393190 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.84■■■■■ 4.45
NME2-202ENST00000393190 NEO1Q92859 1461 aa42.83■■■■■ 4.45
NME2-202ENST00000393190 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.79■■■■■ 4.44
NME2-202ENST00000393190 ADGRL1O94910 1474 aa42.79■■■■■ 4.44
NME2-202ENST00000393190 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.75■■■■■ 4.43
NME2-202ENST00000393190 RAPGEF3O95398 923 aa42.73■■■■■ 4.43
NME2-202ENST00000393190 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.66■■■■■ 4.42
NME2-202ENST00000393190 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
NME2-202ENST00000393190 FANCAO15360 1455 aa42.65■■■■■ 4.42
NME2-202ENST00000393190 CLIP1P30622 1438 aa42.63■■■■■ 4.42
NME2-202ENST00000393190 AKNAQ7Z591 1439 aa42.63■■■■■ 4.42
NME2-202ENST00000393190 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.63■■■■■ 4.42
NME2-202ENST00000393190 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
NME2-202ENST00000393190 KIF14Q15058 1648 aa42.6■■■■■ 4.41
NME2-202ENST00000393190 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.59■■■■■ 4.41
NME2-202ENST00000393190 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
NME2-202ENST00000393190 PLCH2O75038 1416 aa42.57■■■■■ 4.41
NME2-202ENST00000393190 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
NME2-202ENST00000393190 RICTORQ6R327 1708 aa42.54■■■■■ 4.4
NME2-202ENST00000393190 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.49■■■■■ 4.39
NME2-202ENST00000393190 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.49■■■■■ 4.39
NME2-202ENST00000393190 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.47■■■■■ 4.39
NME2-202ENST00000393190 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.37■■■■■ 4.37
NME2-202ENST00000393190 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.37■■■■■ 4.37
NME2-202ENST00000393190 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.35■■■■■ 4.37
NME2-202ENST00000393190 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.35■■■■■ 4.37
NME2-202ENST00000393190 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.3■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms