RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378858.4

LRRN4-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN4, Length 2,692 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4-201ENST00000378858 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 WDR97A6NE52 1622 aa23.95■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.95■■□□□ 1.42
LRRN4-201ENST00000378858 MAP3K1Q13233 1512 aa23.94■■□□□ 1.42
LRRN4-201ENST00000378858 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.93■■□□□ 1.42
LRRN4-201ENST00000378858 FKBP8Q14318 412 aa23.93■■□□□ 1.42
LRRN4-201ENST00000378858 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.9■■□□□ 1.42
LRRN4-201ENST00000378858 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
LRRN4-201ENST00000378858 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.88■■□□□ 1.41
LRRN4-201ENST00000378858 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
LRRN4-201ENST00000378858 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
LRRN4-201ENST00000378858 P3H3Q8IVL6 736 aa23.84■■□□□ 1.41
LRRN4-201ENST00000378858 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.83■■□□□ 1.4
LRRN4-201ENST00000378858 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.8■■□□□ 1.4
LRRN4-201ENST00000378858 TRIM52Q96A61 297 aa23.78■■□□□ 1.4
LRRN4-201ENST00000378858 NEFLP07196 543 aa23.77■■□□□ 1.39
LRRN4-201ENST00000378858 ANP32CO43423 234 aa23.76■■□□□ 1.39
LRRN4-201ENST00000378858 CCER2I3L3R5 266 aa23.75■■□□□ 1.39
LRRN4-201ENST00000378858 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.74■■□□□ 1.39
LRRN4-201ENST00000378858 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
LRRN4-201ENST00000378858 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.71■■□□□ 1.39
LRRN4-201ENST00000378858 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.67■■□□□ 1.38
LRRN4-201ENST00000378858 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.67■■□□□ 1.38
LRRN4-201ENST00000378858 PRDM2Q13029 1718 aa23.66■■□□□ 1.38
LRRN4-201ENST00000378858 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
LRRN4-201ENST00000378858 TONSLQ96HA7 1378 aa23.63■■□□□ 1.37
LRRN4-201ENST00000378858 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
LRRN4-201ENST00000378858 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.6■■□□□ 1.37
LRRN4-201ENST00000378858 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.58■■□□□ 1.37
LRRN4-201ENST00000378858 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.55■■□□□ 1.36
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.54■■□□□ 1.36
LRRN4-201ENST00000378858 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.5■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 PTPRKQ15262 1439 aa23.5■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 UACAQ9BZF9 1416 aa23.49■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.49■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 HFM1A2PYH4 1435 aa23.48■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.47■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
LRRN4-201ENST00000378858 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.45■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 FMN1Q68DA7 1419 aa23.45■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.42■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.41■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 NAIPQ13075 1403 aa23.41■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.4■■□□□ 1.34
LRRN4-201ENST00000378858 BCL11AQ9H165 835 aa23.38■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 MSH5O43196 834 aa23.36■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.35■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.35■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.35■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 NCOA2Q15596 1464 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRN4-201ENST00000378858 TOPBP1Q92547 1522 aa23.33■■□□□ 1.32
LRRN4-201ENST00000378858 CUL7Q14999 1698 aa23.33■■□□□ 1.32
LRRN4-201ENST00000378858 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
LRRN4-201ENST00000378858 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.3■■□□□ 1.32
LRRN4-201ENST00000378858 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.28■■□□□ 1.32
LRRN4-201ENST00000378858 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.25■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.25■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC184Q52MB2 194 aa23.25■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 GRIN2BQ13224 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 SAMD9Q5K651 1589 aa23.21■■□□□ 1.31
LRRN4-201ENST00000378858 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 NESP48681 1621 aa23.19■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.19■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.17■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.17■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.16■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.15■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LRRN4-201ENST00000378858 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.14■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 FOXD1Q16676 465 aa23.13■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 ARHGEF11O15085 1522 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 MRS2Q9HD23 443 aa23.12■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 KDM6BO15054 1643 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC7Q96M83 1385 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 HECW1Q76N89 1606 aa23.1■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 NCOA1Q15788 1441 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.08■■□□□ 1.29
LRRN4-201ENST00000378858 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
LRRN4-201ENST00000378858 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.07■■□□□ 1.28
LRRN4-201ENST00000378858 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.06■■□□□ 1.28
LRRN4-201ENST00000378858 AKNAQ7Z591 1439 aa23.05■■□□□ 1.28
LRRN4-201ENST00000378858 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.04■■□□□ 1.28
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