RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378858.4

LRRN4-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN4, Length 2,692 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4-201ENST00000378858 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.45■■■□□ 2.94
LRRN4-201ENST00000378858 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.08■■■□□ 2.25
LRRN4-201ENST00000378858 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
LRRN4-201ENST00000378858 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
LRRN4-201ENST00000378858 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.11■■■□□ 2.09
LRRN4-201ENST00000378858 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.11■■■□□ 2.09
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.07■■■□□ 2.08
LRRN4-201ENST00000378858 HRCP23327 699 aa28.05■■■□□ 2.08
LRRN4-201ENST00000378858 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.87■■■□□ 2.05
LRRN4-201ENST00000378858 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.8■■■□□ 2.04
LRRN4-201ENST00000378858 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
LRRN4-201ENST00000378858 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.39■■□□□ 1.97
LRRN4-201ENST00000378858 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.38■■□□□ 1.97
LRRN4-201ENST00000378858 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
LRRN4-201ENST00000378858 ABCC9O60706 1549 aa26.83■■□□□ 1.89
LRRN4-201ENST00000378858 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
LRRN4-201ENST00000378858 TRIM41Q8WV44 630 aa26.69■■□□□ 1.86
LRRN4-201ENST00000378858 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
LRRN4-201ENST00000378858 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
LRRN4-201ENST00000378858 SCRIBQ14160 1630 aa26.57■■□□□ 1.84
LRRN4-201ENST00000378858 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.48■■□□□ 1.83
LRRN4-201ENST00000378858 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.42■■□□□ 1.82
LRRN4-201ENST00000378858 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
LRRN4-201ENST00000378858 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.15■■□□□ 1.78
LRRN4-201ENST00000378858 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
LRRN4-201ENST00000378858 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.08■■□□□ 1.76
LRRN4-201ENST00000378858 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
LRRN4-201ENST00000378858 WIZO95785 1651 aa25.95■■□□□ 1.74
LRRN4-201ENST00000378858 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
LRRN4-201ENST00000378858 NACADO15069 1562 aa25.91■■□□□ 1.74
LRRN4-201ENST00000378858 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
LRRN4-201ENST00000378858 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
LRRN4-201ENST00000378858 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
LRRN4-201ENST00000378858 NEUROD1Q13562 356 aa25.71■■□□□ 1.71
LRRN4-201ENST00000378858 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
LRRN4-201ENST00000378858 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
LRRN4-201ENST00000378858 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRN4-201ENST00000378858 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
LRRN4-201ENST00000378858 ABCC8Q09428 1581 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRN4-201ENST00000378858 CEP162Q5TB80 1403 aa25.55■■□□□ 1.68
LRRN4-201ENST00000378858 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
LRRN4-201ENST00000378858 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRN4-201ENST00000378858 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
LRRN4-201ENST00000378858 SOGA1O94964 1423 aa25.48■■□□□ 1.67
LRRN4-201ENST00000378858 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.45■■□□□ 1.66
LRRN4-201ENST00000378858 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
LRRN4-201ENST00000378858 SMARCA2P51531 1590 aa25.38■■□□□ 1.65
LRRN4-201ENST00000378858 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.38■■□□□ 1.65
LRRN4-201ENST00000378858 SMARCA4P51532 1647 aa25.35■■□□□ 1.65
LRRN4-201ENST00000378858 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.33■■□□□ 1.65
LRRN4-201ENST00000378858 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
LRRN4-201ENST00000378858 EEA1Q15075 1411 aa25.3■■□□□ 1.64
LRRN4-201ENST00000378858 GOLGA3Q08378 1498 aa25.2■■□□□ 1.62
LRRN4-201ENST00000378858 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LRRN4-201ENST00000378858 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
LRRN4-201ENST00000378858 MIER1Q8N108 512 aa25.07■■□□□ 1.6
LRRN4-201ENST00000378858 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.03■■□□□ 1.6
LRRN4-201ENST00000378858 MYT1Q01538 1121 aa25.02■■□□□ 1.6
LRRN4-201ENST00000378858 CEP164Q9UPV0 1460 aa25■■□□□ 1.59
LRRN4-201ENST00000378858 CLIP1P30622 1438 aa24.97■■□□□ 1.59
LRRN4-201ENST00000378858 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
LRRN4-201ENST00000378858 KIF21BO75037 1637 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRN4-201ENST00000378858 SYNJ1O43426 1573 aa24.91■■□□□ 1.58
LRRN4-201ENST00000378858 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRN4-201ENST00000378858 APLP2Q06481 763 aa24.9■■□□□ 1.58
LRRN4-201ENST00000378858 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
LRRN4-201ENST00000378858 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.8■■□□□ 1.56
LRRN4-201ENST00000378858 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.78■■□□□ 1.56
LRRN4-201ENST00000378858 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
LRRN4-201ENST00000378858 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.74■■□□□ 1.55
LRRN4-201ENST00000378858 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.63■■□□□ 1.53
LRRN4-201ENST00000378858 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.61■■□□□ 1.53
LRRN4-201ENST00000378858 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
LRRN4-201ENST00000378858 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
LRRN4-201ENST00000378858 TOP2BQ02880 1626 aa24.51■■□□□ 1.51
LRRN4-201ENST00000378858 ARAP1Q96P48 1450 aa24.48■■□□□ 1.51
LRRN4-201ENST00000378858 PRXQ9BXM0 1461 aa24.45■■□□□ 1.5
LRRN4-201ENST00000378858 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
LRRN4-201ENST00000378858 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.43■■□□□ 1.5
LRRN4-201ENST00000378858 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.38■■□□□ 1.49
LRRN4-201ENST00000378858 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
LRRN4-201ENST00000378858 ITGAEP38570 1179 aa24.31■■□□□ 1.48
LRRN4-201ENST00000378858 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.3■■□□□ 1.48
LRRN4-201ENST00000378858 CUX2O14529 1486 aa24.27■■□□□ 1.48
LRRN4-201ENST00000378858 KIF27Q86VH2 1401 aa24.25■■□□□ 1.47
LRRN4-201ENST00000378858 CUX1P39880 1505 aa24.22■■□□□ 1.47
LRRN4-201ENST00000378858 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.21■■□□□ 1.47
LRRN4-201ENST00000378858 KCNH8Q96L42 1107 aa24.2■■□□□ 1.46
LRRN4-201ENST00000378858 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.16■■□□□ 1.46
LRRN4-201ENST00000378858 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.16■■□□□ 1.46
LRRN4-201ENST00000378858 MAPKBP1O60336 1514 aa24.1■■□□□ 1.45
LRRN4-201ENST00000378858 NCAPD3P42695 1498 aa24.04■■□□□ 1.44
LRRN4-201ENST00000378858 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LRRN4-201ENST00000378858 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.02■■□□□ 1.44
LRRN4-201ENST00000378858 HMGXB3Q12766 1538 aa24.01■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 SIN3AQ96ST3 1273 aa24■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 CFTRP13569 1480 aa24■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 BCANQ96GW7 911 aa23.99■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 TIAM1Q13009 1591 aa23.99■■□□□ 1.43
LRRN4-201ENST00000378858 IGF1RP08069 1367 aa23.98■■□□□ 1.43
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