RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 JPH4Q96JJ6 628 aa40.54■■■■■ 4.08
FAAP20-201ENST00000378543 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
FAAP20-201ENST00000378543 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.44■■■■■ 4.06
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.4■■■■■ 4.06
FAAP20-201ENST00000378543 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.12■■■■■ 4.01
FAAP20-201ENST00000378543 IQGAP2Q13576 1575 aa40.09■■■■■ 4.01
FAAP20-201ENST00000378543 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.02■■■■■ 4
FAAP20-201ENST00000378543 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.97■■■■□ 3.99
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRGP23470 1445 aa39.93■■■■□ 3.98
FAAP20-201ENST00000378543 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.98
FAAP20-201ENST00000378543 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.92■■■■□ 3.98
FAAP20-201ENST00000378543 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-201ENST00000378543 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
FAAP20-201ENST00000378543 DISP1Q96F81 1524 aa39.88■■■■□ 3.97
FAAP20-201ENST00000378543 MAPKBP1O60336 1514 aa39.85■■■■□ 3.97
FAAP20-201ENST00000378543 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.85■■■■□ 3.97
FAAP20-201ENST00000378543 PRXQ9BXM0 1461 aa39.83■■■■□ 3.97
FAAP20-201ENST00000378543 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.81■■■■□ 3.96
FAAP20-201ENST00000378543 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.76■■■■□ 3.96
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA0556O60303 1618 aa39.73■■■■□ 3.95
FAAP20-201ENST00000378543 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.71■■■■□ 3.95
FAAP20-201ENST00000378543 DIP2BQ9P265 1576 aa39.7■■■■□ 3.95
FAAP20-201ENST00000378543 ABCC2Q92887 1545 aa39.66■■■■□ 3.94
FAAP20-201ENST00000378543 UACAQ9BZF9 1416 aa39.65■■■■□ 3.94
FAAP20-201ENST00000378543 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.64■■■■□ 3.94
FAAP20-201ENST00000378543 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.63■■■■□ 3.93
FAAP20-201ENST00000378543 GOLGA3Q08378 1498 aa39.54■■■■□ 3.92
FAAP20-201ENST00000378543 EEA1Q15075 1411 aa39.52■■■■□ 3.92
FAAP20-201ENST00000378543 ASXL2Q76L83 1435 aa39.49■■■■□ 3.91
FAAP20-201ENST00000378543 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.48■■■■□ 3.91
FAAP20-201ENST00000378543 TSPOAP1O95153 1857 aa39.45■■■■□ 3.91
FAAP20-201ENST00000378543 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.45■■■■□ 3.91
FAAP20-201ENST00000378543 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
FAAP20-201ENST00000378543 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
FAAP20-201ENST00000378543 ABCA8O94911 1581 aa39.34■■■■□ 3.89
FAAP20-201ENST00000378543 GLI2P10070 1586 aa39.33■■■■□ 3.89
FAAP20-201ENST00000378543 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.32■■■■□ 3.89
FAAP20-201ENST00000378543 P3H3Q8IVL6 736 aa39.3■■■■□ 3.88
FAAP20-201ENST00000378543 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
FAAP20-201ENST00000378543 SAMD9Q5K651 1589 aa39.25■■■■□ 3.87
FAAP20-201ENST00000378543 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
FAAP20-201ENST00000378543 KDM6BO15054 1643 aa39.22■■■■□ 3.87
FAAP20-201ENST00000378543 KIF21BO75037 1637 aa39.21■■■■□ 3.87
FAAP20-201ENST00000378543 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.17■■■■□ 3.86
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.14■■■■□ 3.86
FAAP20-201ENST00000378543 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
FAAP20-201ENST00000378543 ARID3CA6NKF2 412 aa39.03■■■■□ 3.84
FAAP20-201ENST00000378543 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
FAAP20-201ENST00000378543 ATP10BO94823 1461 aa39.02■■■■□ 3.84
FAAP20-201ENST00000378543 KCNH8Q96L42 1107 aa39.01■■■■□ 3.84
FAAP20-201ENST00000378543 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39■■■■□ 3.83
FAAP20-201ENST00000378543 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39■■■■□ 3.83
FAAP20-201ENST00000378543 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.97■■■■□ 3.83
FAAP20-201ENST00000378543 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.97■■■■□ 3.83
FAAP20-201ENST00000378543 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.94■■■■□ 3.82
FAAP20-201ENST00000378543 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.92■■■■□ 3.82
FAAP20-201ENST00000378543 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
FAAP20-201ENST00000378543 CD109Q6YHK3 1445 aa38.89■■■■□ 3.82
FAAP20-201ENST00000378543 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
FAAP20-201ENST00000378543 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
FAAP20-201ENST00000378543 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.84■■■■□ 3.81
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.79■■■■□ 3.8
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
FAAP20-201ENST00000378543 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.72■■■■□ 3.79
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.67■■■■□ 3.78
FAAP20-201ENST00000378543 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.65■■■■□ 3.78
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.59■■■■□ 3.77
FAAP20-201ENST00000378543 FMN1Q68DA7 1419 aa38.55■■■■□ 3.76
FAAP20-201ENST00000378543 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
FAAP20-201ENST00000378543 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.53■■■■□ 3.76
FAAP20-201ENST00000378543 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
FAAP20-201ENST00000378543 HECW1Q76N89 1606 aa38.47■■■■□ 3.75
FAAP20-201ENST00000378543 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.46■■■■□ 3.75
FAAP20-201ENST00000378543 NEO1Q92859 1461 aa38.44■■■■□ 3.74
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRL1O94910 1474 aa38.43■■■■□ 3.74
FAAP20-201ENST00000378543 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.43■■■■□ 3.745e-8■■■□□ 16
FAAP20-201ENST00000378543 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.38■■■■□ 3.73
FAAP20-201ENST00000378543 RAPGEF3O95398 923 aa38.33■■■■□ 3.73
FAAP20-201ENST00000378543 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa38.32■■■■□ 3.73
FAAP20-201ENST00000378543 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.27■■■■□ 3.72
FAAP20-201ENST00000378543 FANCAO15360 1455 aa38.27■■■■□ 3.72
FAAP20-201ENST00000378543 AKNAQ7Z591 1439 aa38.25■■■■□ 3.71
FAAP20-201ENST00000378543 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.25■■■■□ 3.71
FAAP20-201ENST00000378543 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
FAAP20-201ENST00000378543 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
FAAP20-201ENST00000378543 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.21■■■■□ 3.71
FAAP20-201ENST00000378543 CLIP1P30622 1438 aa38.2■■■■□ 3.71
FAAP20-201ENST00000378543 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
FAAP20-201ENST00000378543 KIF14Q15058 1648 aa38.19■■■■□ 3.7
FAAP20-201ENST00000378543 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
FAAP20-201ENST00000378543 RICTORQ6R327 1708 aa38.18■■■■□ 3.7
FAAP20-201ENST00000378543 PLCH2O75038 1416 aa38.17■■■■□ 3.7
FAAP20-201ENST00000378543 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.14■■■■□ 3.7
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC18Q5T9S5 1454 aa38.1■■■■□ 3.69
FAAP20-201ENST00000378543 FYCO1Q9BQS8 1478 aa38.07■■■■□ 3.68
FAAP20-201ENST00000378543 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.02■■■■□ 3.68
FAAP20-201ENST00000378543 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.02■■■■□ 3.68
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.02■■■■□ 3.68
FAAP20-201ENST00000378543 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38■■■■□ 3.67
FAAP20-201ENST00000378543 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms