RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.48■■■■■ 4.39
GKAP1-202ENST00000376365 IQGAP2Q13576 1575 aa42.43■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 SHROOM2Q13796 1616 aa42.43■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 JPH4Q96JJ6 628 aa42.4■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF11O15085 1522 aa42.39■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 GOLGA3Q08378 1498 aa42.39■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.38■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
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GKAP1-202ENST00000376365 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.2■■■■■ 4.35
GKAP1-202ENST00000376365 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.18■■■■■ 4.34
GKAP1-202ENST00000376365 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.13■■■■■ 4.33
GKAP1-202ENST00000376365 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
GKAP1-202ENST00000376365 DISP1Q96F81 1524 aa42.03■■■■■ 4.32
GKAP1-202ENST00000376365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0556O60303 1618 aa42■■■■■ 4.31
GKAP1-202ENST00000376365 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42■■■■■ 4.31
GKAP1-202ENST00000376365 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.92■■■■■ 4.3
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GKAP1-202ENST00000376365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.87■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 PTPRGP23470 1445 aa41.85■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.84■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 P3H3Q8IVL6 736 aa41.82■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.67■■■■■ 4.26
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.67■■■■■ 4.26
GKAP1-202ENST00000376365 CLIP1P30622 1438 aa41.64■■■■■ 4.26
GKAP1-202ENST00000376365 CEP162Q5TB80 1403 aa41.58■■■■■ 4.25
GKAP1-202ENST00000376365 UACAQ9BZF9 1416 aa41.58■■■■■ 4.25
GKAP1-202ENST00000376365 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.56■■■■■ 4.24
GKAP1-202ENST00000376365 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.52■■■■■ 4.24
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC2Q92887 1545 aa41.5■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.49■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA8O94911 1581 aa41.49■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 FMN1Q68DA7 1419 aa41.45■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.42■■■■■ 4.22
GKAP1-202ENST00000376365 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.29■■■■■ 4.2
GKAP1-202ENST00000376365 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
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GKAP1-202ENST00000376365 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 ARID3CA6NKF2 412 aa41.21■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 HECW1Q76N89 1606 aa41.21■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 MAPKBP1O60336 1514 aa41.19■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.16■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 ATP10BO94823 1461 aa41.14■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
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GKAP1-202ENST00000376365 ASXL2Q76L83 1435 aa41.08■■■■■ 4.17
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GKAP1-202ENST00000376365 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.92■■■■■ 4.14
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GKAP1-202ENST00000376365 NCOA2Q15596 1464 aa40.28■■■■■ 4.04
GKAP1-202ENST00000376365 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.27■■■■■ 4.04
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GKAP1-202ENST00000376365 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.25■■■■■ 4.03
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GKAP1-202ENST00000376365 FANCAO15360 1455 aa40.23■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.23■■■■■ 4.03
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