RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.48■■■■■ 4.39
GKAP1-202ENST00000376365 IQGAP2Q13576 1575 aa42.43■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 SHROOM2Q13796 1616 aa42.43■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 JPH4Q96JJ6 628 aa42.4■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF11O15085 1522 aa42.39■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 GOLGA3Q08378 1498 aa42.39■■■■■ 4.38
GKAP1-202ENST00000376365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.38■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.36■■■■■ 4.37
GKAP1-202ENST00000376365 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
GKAP1-202ENST00000376365 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
GKAP1-202ENST00000376365 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.2■■■■■ 4.35
GKAP1-202ENST00000376365 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.18■■■■■ 4.34
GKAP1-202ENST00000376365 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.13■■■■■ 4.33
GKAP1-202ENST00000376365 ARAP1Q96P48 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
GKAP1-202ENST00000376365 DISP1Q96F81 1524 aa42.03■■■■■ 4.32
GKAP1-202ENST00000376365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA0556O60303 1618 aa42■■■■■ 4.31
GKAP1-202ENST00000376365 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42■■■■■ 4.31
GKAP1-202ENST00000376365 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.92■■■■■ 4.3
GKAP1-202ENST00000376365 SAMD9Q5K651 1589 aa41.89■■■■■ 4.3
GKAP1-202ENST00000376365 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.87■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 PTPRGP23470 1445 aa41.85■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.84■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 P3H3Q8IVL6 736 aa41.82■■■■■ 4.29
GKAP1-202ENST00000376365 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.67■■■■■ 4.26
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.67■■■■■ 4.26
GKAP1-202ENST00000376365 CLIP1P30622 1438 aa41.64■■■■■ 4.26
GKAP1-202ENST00000376365 CEP162Q5TB80 1403 aa41.58■■■■■ 4.25
GKAP1-202ENST00000376365 UACAQ9BZF9 1416 aa41.58■■■■■ 4.25
GKAP1-202ENST00000376365 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.56■■■■■ 4.24
GKAP1-202ENST00000376365 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.52■■■■■ 4.24
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC2Q92887 1545 aa41.5■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.49■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA8O94911 1581 aa41.49■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 FMN1Q68DA7 1419 aa41.45■■■■■ 4.23
GKAP1-202ENST00000376365 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.42■■■■■ 4.22
GKAP1-202ENST00000376365 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.29■■■■■ 4.2
GKAP1-202ENST00000376365 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
GKAP1-202ENST00000376365 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 ARID3CA6NKF2 412 aa41.21■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 HECW1Q76N89 1606 aa41.21■■■■■ 4.19
GKAP1-202ENST00000376365 MAPKBP1O60336 1514 aa41.19■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.16■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 ATP10BO94823 1461 aa41.14■■■■■ 4.18
GKAP1-202ENST00000376365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
GKAP1-202ENST00000376365 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
GKAP1-202ENST00000376365 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.11■■■■■ 4.17
GKAP1-202ENST00000376365 ASXL2Q76L83 1435 aa41.08■■■■■ 4.17
GKAP1-202ENST00000376365 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
GKAP1-202ENST00000376365 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.04■■■■■ 4.16
GKAP1-202ENST00000376365 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
GKAP1-202ENST00000376365 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
GKAP1-202ENST00000376365 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41■■■■■ 4.15
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.98■■■■■ 4.15
GKAP1-202ENST00000376365 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.98■■■■■ 4.15
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.92■■■■■ 4.14
GKAP1-202ENST00000376365 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.9■■■■■ 4.14
GKAP1-202ENST00000376365 DIP2BQ9P265 1576 aa40.89■■■■■ 4.14
GKAP1-202ENST00000376365 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
GKAP1-202ENST00000376365 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.88■■■■■ 4.13
GKAP1-202ENST00000376365 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.85■■■■■ 4.13
GKAP1-202ENST00000376365 KCNH8Q96L42 1107 aa40.84■■■■■ 4.13
GKAP1-202ENST00000376365 GLI2P10070 1586 aa40.76■■■■■ 4.12
GKAP1-202ENST00000376365 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.7■■■■■ 4.11
GKAP1-202ENST00000376365 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
GKAP1-202ENST00000376365 APLP2Q06481 763 aa40.67■■■■■ 4.1
GKAP1-202ENST00000376365 TIAM1Q13009 1591 aa40.66■■■■■ 4.1
GKAP1-202ENST00000376365 TSPOAP1O95153 1857 aa40.63■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.63■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 KIF14Q15058 1648 aa40.62■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.62■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.62■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.61■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 MAP3K1Q13233 1512 aa40.6■■■■■ 4.09
GKAP1-202ENST00000376365 CD109Q6YHK3 1445 aa40.54■■■■■ 4.08
GKAP1-202ENST00000376365 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.54■■■■■ 4.08
GKAP1-202ENST00000376365 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
GKAP1-202ENST00000376365 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.5■■■■■ 4.07
GKAP1-202ENST00000376365 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.46■■■■■ 4.07
GKAP1-202ENST00000376365 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
GKAP1-202ENST00000376365 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.42■■■■■ 4.06
GKAP1-202ENST00000376365 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.4■■■■■ 4.06
GKAP1-202ENST00000376365 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
GKAP1-202ENST00000376365 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.06
GKAP1-202ENST00000376365 PLCH2O75038 1416 aa40.3■■■■■ 4.04
GKAP1-202ENST00000376365 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.28■■■■■ 4.04
GKAP1-202ENST00000376365 NCOA2Q15596 1464 aa40.28■■■■■ 4.04
GKAP1-202ENST00000376365 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.27■■■■■ 4.04
GKAP1-202ENST00000376365 PREX2Q70Z35 1606 aa40.26■■■■■ 4.04
GKAP1-202ENST00000376365 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.25■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.23■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 FANCAO15360 1455 aa40.23■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms