RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 CHD1O14646 1710 aa30.34■■■□□ 2.45
PRRT1-202ENST00000375150 CEP170Q5SW79 1584 aa30.25■■■□□ 2.43
PRRT1-202ENST00000375150 CLIP1P30622 1438 aa30.24■■■□□ 2.43
PRRT1-202ENST00000375150 NUP160Q12769 1436 aa30.24■■■□□ 2.43
PRRT1-202ENST00000375150 IQGAP2Q13576 1575 aa30.22■■■□□ 2.43
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.21■■■□□ 2.43
PRRT1-202ENST00000375150 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PRRT1-202ENST00000375150 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.11■■■□□ 2.41
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.08■■■□□ 2.41
PRRT1-202ENST00000375150 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.06■■■□□ 2.4
PRRT1-202ENST00000375150 SAMD9Q5K651 1589 aa30.04■■■□□ 2.4
PRRT1-202ENST00000375150 ARAP1Q96P48 1450 aa29.99■■■□□ 2.39
PRRT1-202ENST00000375150 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.98■■■□□ 2.39
PRRT1-202ENST00000375150 JPH4Q96JJ6 628 aa29.94■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 SHROOM2Q13796 1616 aa29.92■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA0556O60303 1618 aa29.91■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.91■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.91■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 P3H3Q8IVL6 736 aa29.9■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 OSCARQ8IYS5 282 aa29.9■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 DISP1Q96F81 1524 aa29.9■■■□□ 2.38
PRRT1-202ENST00000375150 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.88■■■□□ 2.37
PRRT1-202ENST00000375150 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
PRRT1-202ENST00000375150 FMN1Q68DA7 1419 aa29.81■■■□□ 2.36
PRRT1-202ENST00000375150 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
PRRT1-202ENST00000375150 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.68■■■□□ 2.34
PRRT1-202ENST00000375150 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.67■■■□□ 2.34
PRRT1-202ENST00000375150 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.66■■■□□ 2.34
PRRT1-202ENST00000375150 APLP2Q06481 763 aa29.61■■■□□ 2.33
PRRT1-202ENST00000375150 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PRRT1-202ENST00000375150 PTPRGP23470 1445 aa29.59■■■□□ 2.33
PRRT1-202ENST00000375150 HECW1Q76N89 1606 aa29.58■■■□□ 2.33
PRRT1-202ENST00000375150 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.57■■■□□ 2.32
PRRT1-202ENST00000375150 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PRRT1-202ENST00000375150 MAP3K1Q13233 1512 aa29.51■■■□□ 2.32
PRRT1-202ENST00000375150 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.5■■■□□ 2.31
PRRT1-202ENST00000375150 ABCA8O94911 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
PRRT1-202ENST00000375150 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.49■■■□□ 2.31
PRRT1-202ENST00000375150 TIAM1Q13009 1591 aa29.49■■■□□ 2.31
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.47■■■□□ 2.31
PRRT1-202ENST00000375150 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.46■■■□□ 2.31
PRRT1-202ENST00000375150 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGEF11O15085 1522 aa29.43■■■□□ 2.3
PRRT1-202ENST00000375150 UACAQ9BZF9 1416 aa29.42■■■□□ 2.3
PRRT1-202ENST00000375150 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PRRT1-202ENST00000375150 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 ABCC2Q92887 1545 aa29.37■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.33■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.33■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.33■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.33■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.33■■■□□ 2.29
PRRT1-202ENST00000375150 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PRRT1-202ENST00000375150 ARID3CA6NKF2 412 aa29.3■■■□□ 2.28
PRRT1-202ENST00000375150 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.26■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 ATP10BO94823 1461 aa29.26■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.25■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PRRT1-202ENST00000375150 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.19■■■□□ 2.26
PRRT1-202ENST00000375150 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.19■■■□□ 2.26
PRRT1-202ENST00000375150 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
PRRT1-202ENST00000375150 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
PRRT1-202ENST00000375150 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.11■■■□□ 2.25
PRRT1-202ENST00000375150 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.08■■■□□ 2.25
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
PRRT1-202ENST00000375150 NCOA2Q15596 1464 aa29.06■■■□□ 2.24
PRRT1-202ENST00000375150 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.24
PRRT1-202ENST00000375150 KIF14Q15058 1648 aa29.03■■■□□ 2.24
PRRT1-202ENST00000375150 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29■■■□□ 2.23
PRRT1-202ENST00000375150 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.94■■■□□ 2.22
PRRT1-202ENST00000375150 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.93■■■□□ 2.22
PRRT1-202ENST00000375150 ASXL2Q76L83 1435 aa28.92■■■□□ 2.22
PRRT1-202ENST00000375150 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PRRT1-202ENST00000375150 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.9■■■□□ 2.22
PRRT1-202ENST00000375150 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.88■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.88■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.87■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.87■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 MAPKBP1O60336 1514 aa28.87■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 KCNH8Q96L42 1107 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
PRRT1-202ENST00000375150 MIA2Q96PC5 1412 aa28.82■■■□□ 2.2
PRRT1-202ENST00000375150 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.82■■■□□ 2.2
PRRT1-202ENST00000375150 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.81■■■□□ 2.2
PRRT1-202ENST00000375150 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
PRRT1-202ENST00000375150 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.78■■■□□ 2.2
PRRT1-202ENST00000375150 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.77■■■□□ 2.2
PRRT1-202ENST00000375150 PREX2Q70Z35 1606 aa28.76■■■□□ 2.19
PRRT1-202ENST00000375150 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
PRRT1-202ENST00000375150 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.75■■■□□ 2.19
PRRT1-202ENST00000375150 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PRRT1-202ENST00000375150 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PRRT1-202ENST00000375150 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PRRT1-202ENST00000375150 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.7■■■□□ 2.19
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