RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368494.3

NUS1-201, Transcript of NUS1, dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NUS1, Length 4,676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1-201ENST00000368494 TSPY10P0CW01 314 aa22.65■■□□□ 1.22
NUS1-201ENST00000368494 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NUS1-201ENST00000368494 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
NUS1-201ENST00000368494 MIER1Q8N108 512 aa22.63■■□□□ 1.21
NUS1-201ENST00000368494 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.62■■□□□ 1.21
NUS1-201ENST00000368494 TONSLQ96HA7 1378 aa22.61■■□□□ 1.21
NUS1-201ENST00000368494 NESP48681 1621 aa22.58■■□□□ 1.21
NUS1-201ENST00000368494 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
NUS1-201ENST00000368494 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 FKBP8Q14318 412 aa22.49■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.49■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 HMGXB3Q12766 1538 aa22.48■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.47■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.47■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.46■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 CFTRP13569 1480 aa22.46■■□□□ 1.19
NUS1-201ENST00000368494 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.45■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.44■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.43■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.43■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.41■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 JPH4Q96JJ6 628 aa22.4■■□□□ 1.18
NUS1-201ENST00000368494 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NUS1-201ENST00000368494 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
NUS1-201ENST00000368494 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.176e-7■■■■□ 21.5
NUS1-201ENST00000368494 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.33■■□□□ 1.16
NUS1-201ENST00000368494 IGF1RP08069 1367 aa22.3■■□□□ 1.16
NUS1-201ENST00000368494 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.29■■□□□ 1.16
NUS1-201ENST00000368494 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.28■■□□□ 1.16
NUS1-201ENST00000368494 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.27■■□□□ 1.16
NUS1-201ENST00000368494 OSCARQ8IYS5 282 aa22.27■■□□□ 1.16
NUS1-201ENST00000368494 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NUS1-201ENST00000368494 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NUS1-201ENST00000368494 FMN1Q68DA7 1419 aa22.24■■□□□ 1.15
NUS1-201ENST00000368494 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.23■■□□□ 1.15
NUS1-201ENST00000368494 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.18■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.17■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 TOPBP1Q92547 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 MRS2Q9HD23 443 aa22.16■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.15■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 SYNJ1O43426 1573 aa22.14■■□□□ 1.14
NUS1-201ENST00000368494 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 TMC1Q8TDI8 760 aa22.1■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 PTPRGP23470 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 CUX1P39880 1505 aa22.09■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 GRIN2BQ13224 1484 aa22.08■■□□□ 1.13
NUS1-201ENST00000368494 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.06■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 RGL3Q3MIN7 710 aa22.06■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.05■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 IFT140Q96RY7 1462 aa22.04■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.03■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.03■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 MLECQ14165 292 aa22.02■■□□□ 1.12
NUS1-201ENST00000368494 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.97■■□□□ 1.11
NUS1-201ENST00000368494 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.97■■□□□ 1.11
NUS1-201ENST00000368494 TOP2BQ02880 1626 aa21.97■■□□□ 1.11
NUS1-201ENST00000368494 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NUS1-201ENST00000368494 GGT6Q6P531 493 aa21.92■■□□□ 1.1
NUS1-201ENST00000368494 BCL11AQ9H165 835 aa21.92■■□□□ 1.1
NUS1-201ENST00000368494 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
NUS1-201ENST00000368494 NEFMP07197 916 aa21.88■■□□□ 1.09
NUS1-201ENST00000368494 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.88■■□□□ 1.09
NUS1-201ENST00000368494 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.87■■□□□ 1.09
NUS1-201ENST00000368494 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NUS1-201ENST00000368494 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.86■■□□□ 1.09
NUS1-201ENST00000368494 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NUS1-201ENST00000368494 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.82■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.79■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 KANK1Q14678 1352 aa21.78■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.77■■□□□ 1.08
NUS1-201ENST00000368494 PRXQ9BXM0 1461 aa21.76■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.76■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 KIF3BO15066 747 aa21.75■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 FOXD1Q16676 465 aa21.75■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.74■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.74■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 SLC24A1O60721 1099 aa21.73■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 PKD2Q13563 968 aa21.73■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.72■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.72■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 C14orf37Q86TY3 774 aa21.71■■□□□ 1.07
NUS1-201ENST00000368494 NBR1Q14596 966 aa21.7■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NUS1-201ENST00000368494 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms