RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367616.4

NPHS2-202, Transcript of NPHS2, podocin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHS2, Length 1,670 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2-202ENST00000367616 CEP162Q5TB80 1403 aa37.96■■■■□ 3.67
NPHS2-202ENST00000367616 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.94■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.94■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 GRIN2AQ12879 1464 aa37.93■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.93■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.93■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.93■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 ARHGEF11O15085 1522 aa37.91■■■■□ 3.66
NPHS2-202ENST00000367616 CLIP1P30622 1438 aa37.78■■■■□ 3.64
NPHS2-202ENST00000367616 CEP170Q5SW79 1584 aa37.76■■■■□ 3.64
NPHS2-202ENST00000367616 NUP160Q12769 1436 aa37.75■■■■□ 3.63
NPHS2-202ENST00000367616 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
NPHS2-202ENST00000367616 IQGAP2Q13576 1575 aa37.64■■■■□ 3.62
NPHS2-202ENST00000367616 ARAP1Q96P48 1450 aa37.6■■■■□ 3.61
NPHS2-202ENST00000367616 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.58■■■■□ 3.61
NPHS2-202ENST00000367616 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.56■■■■□ 3.6
NPHS2-202ENST00000367616 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.52■■■■□ 3.6
NPHS2-202ENST00000367616 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.5■■■■□ 3.59
NPHS2-202ENST00000367616 SHROOM2Q13796 1616 aa37.5■■■■□ 3.59
NPHS2-202ENST00000367616 SAMD9Q5K651 1589 aa37.46■■■■□ 3.59
NPHS2-202ENST00000367616 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.43■■■■□ 3.58
NPHS2-202ENST00000367616 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.42■■■■□ 3.58
NPHS2-202ENST00000367616 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.38■■■■□ 3.57
NPHS2-202ENST00000367616 P3H3Q8IVL6 736 aa37.34■■■■□ 3.57
NPHS2-202ENST00000367616 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.32■■■■□ 3.57
NPHS2-202ENST00000367616 JPH4Q96JJ6 628 aa37.31■■■■□ 3.56
NPHS2-202ENST00000367616 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
NPHS2-202ENST00000367616 KIAA0556O60303 1618 aa37.27■■■■□ 3.56
NPHS2-202ENST00000367616 DISP1Q96F81 1524 aa37.26■■■■□ 3.55
NPHS2-202ENST00000367616 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.14■■■■□ 3.54
NPHS2-202ENST00000367616 FMN1Q68DA7 1419 aa37.13■■■■□ 3.53
NPHS2-202ENST00000367616 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
NPHS2-202ENST00000367616 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37■■■■□ 3.51
NPHS2-202ENST00000367616 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37■■■■□ 3.51
NPHS2-202ENST00000367616 APLP2Q06481 763 aa36.94■■■■□ 3.5
NPHS2-202ENST00000367616 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
NPHS2-202ENST00000367616 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
NPHS2-202ENST00000367616 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
NPHS2-202ENST00000367616 HECW1Q76N89 1606 aa36.87■■■■□ 3.49
NPHS2-202ENST00000367616 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.86■■■■□ 3.49
NPHS2-202ENST00000367616 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.85■■■■□ 3.49
NPHS2-202ENST00000367616 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.85■■■■□ 3.49
NPHS2-202ENST00000367616 TIAM1Q13009 1591 aa36.84■■■■□ 3.49
NPHS2-202ENST00000367616 PTPRGP23470 1445 aa36.81■■■■□ 3.48
NPHS2-202ENST00000367616 MAP3K1Q13233 1512 aa36.81■■■■□ 3.48
NPHS2-202ENST00000367616 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.78■■■■□ 3.48
NPHS2-202ENST00000367616 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
NPHS2-202ENST00000367616 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.77■■■■□ 3.48
NPHS2-202ENST00000367616 ABCA8O94911 1581 aa36.74■■■■□ 3.47
NPHS2-202ENST00000367616 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.71■■■■□ 3.47
NPHS2-202ENST00000367616 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.46
NPHS2-202ENST00000367616 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
NPHS2-202ENST00000367616 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
NPHS2-202ENST00000367616 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
NPHS2-202ENST00000367616 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.63■■■■□ 3.45
NPHS2-202ENST00000367616 UACAQ9BZF9 1416 aa36.59■■■■□ 3.45
NPHS2-202ENST00000367616 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
NPHS2-202ENST00000367616 ARID3CA6NKF2 412 aa36.58■■■■□ 3.45
NPHS2-202ENST00000367616 MAPKBP1O60336 1514 aa36.56■■■■□ 3.44
NPHS2-202ENST00000367616 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.56■■■■□ 3.44
NPHS2-202ENST00000367616 ABCC2Q92887 1545 aa36.55■■■■□ 3.44
NPHS2-202ENST00000367616 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.49■■■■□ 3.43
NPHS2-202ENST00000367616 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.48■■■■□ 3.43
NPHS2-202ENST00000367616 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.48■■■■□ 3.43
NPHS2-202ENST00000367616 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
NPHS2-202ENST00000367616 ATP10BO94823 1461 aa36.44■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.43■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.39■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.39■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.42
NPHS2-202ENST00000367616 DIP2BQ9P265 1576 aa36.36■■■■□ 3.41
NPHS2-202ENST00000367616 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
NPHS2-202ENST00000367616 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
NPHS2-202ENST00000367616 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.32■■■■□ 3.4
NPHS2-202ENST00000367616 ASXL2Q76L83 1435 aa36.31■■■■□ 3.4
NPHS2-202ENST00000367616 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
NPHS2-202ENST00000367616 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.28■■■■□ 3.4
NPHS2-202ENST00000367616 NCOA2Q15596 1464 aa36.27■■■■□ 3.4
NPHS2-202ENST00000367616 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.24■■■■□ 3.39
NPHS2-202ENST00000367616 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.21■■■■□ 3.39
NPHS2-202ENST00000367616 KIF14Q15058 1648 aa36.19■■■■□ 3.38
NPHS2-202ENST00000367616 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
NPHS2-202ENST00000367616 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.12■■■■□ 3.37
NPHS2-202ENST00000367616 GLI2P10070 1586 aa36.1■■■■□ 3.37
NPHS2-202ENST00000367616 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.1■■■■□ 3.37
NPHS2-202ENST00000367616 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.08■■■■□ 3.37
NPHS2-202ENST00000367616 TSPOAP1O95153 1857 aa36.05■■■■□ 3.36
NPHS2-202ENST00000367616 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.05■■■■□ 3.36
NPHS2-202ENST00000367616 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.01■■■■□ 3.36
NPHS2-202ENST00000367616 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.97■■■■□ 3.35
NPHS2-202ENST00000367616 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.96■■■■□ 3.35
NPHS2-202ENST00000367616 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.95■■■■□ 3.35
NPHS2-202ENST00000367616 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.94■■■■□ 3.34
NPHS2-202ENST00000367616 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
NPHS2-202ENST00000367616 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
NPHS2-202ENST00000367616 MIA2Q96PC5 1412 aa35.92■■■■□ 3.34
NPHS2-202ENST00000367616 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
NPHS2-202ENST00000367616 KCNH8Q96L42 1107 aa35.91■■■■□ 3.34
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