RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366988.4

NENF-201, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NENF, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-201ENST00000366988 JPH4Q96JJ6 628 aa34.43■■■■□ 3.1
NENF-201ENST00000366988 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
NENF-201ENST00000366988 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.41■■■■□ 3.1
NENF-201ENST00000366988 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.32■■■■□ 3.08
NENF-201ENST00000366988 IQGAP2Q13576 1575 aa34.23■■■■□ 3.07
NENF-201ENST00000366988 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
NENF-201ENST00000366988 PRXQ9BXM0 1461 aa34.09■■■■□ 3.05
NENF-201ENST00000366988 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.09■■■■□ 3.05
NENF-201ENST00000366988 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.09■■■■□ 3.05
NENF-201ENST00000366988 EEA1Q15075 1411 aa34.03■■■■□ 3.04
NENF-201ENST00000366988 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.99■■■■□ 3.03
NENF-201ENST00000366988 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.99■■■■□ 3.03
NENF-201ENST00000366988 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.97■■■■□ 3.03
NENF-201ENST00000366988 PTPRGP23470 1445 aa33.96■■■■□ 3.03
NENF-201ENST00000366988 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.96■■■■□ 3.03
NENF-201ENST00000366988 DISP1Q96F81 1524 aa33.94■■■■□ 3.02
NENF-201ENST00000366988 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
NENF-201ENST00000366988 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.92■■■■□ 3.02
NENF-201ENST00000366988 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.91■■■■□ 3.02
NENF-201ENST00000366988 KIAA0556O60303 1618 aa33.9■■■■□ 3.02
NENF-201ENST00000366988 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
NENF-201ENST00000366988 GOLGA3Q08378 1498 aa33.82■■■■□ 3
NENF-201ENST00000366988 MAPKBP1O60336 1514 aa33.79■■■■□ 3
NENF-201ENST00000366988 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.74■■■□□ 2.99
NENF-201ENST00000366988 UACAQ9BZF9 1416 aa33.74■■■□□ 2.99
NENF-201ENST00000366988 KIF21BO75037 1637 aa33.71■■■□□ 2.99
NENF-201ENST00000366988 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.71■■■□□ 2.99
NENF-201ENST00000366988 ABCC2Q92887 1545 aa33.71■■■□□ 2.99
NENF-201ENST00000366988 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.65■■■□□ 2.98
NENF-201ENST00000366988 DIP2BQ9P265 1576 aa33.62■■■□□ 2.97
NENF-201ENST00000366988 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.6■■■□□ 2.97
NENF-201ENST00000366988 SAMD9Q5K651 1589 aa33.56■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.56■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.55■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 P3H3Q8IVL6 736 aa33.53■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 ABCA8O94911 1581 aa33.52■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 ASXL2Q76L83 1435 aa33.52■■■□□ 2.96
NENF-201ENST00000366988 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
NENF-201ENST00000366988 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.46■■■□□ 2.95
NENF-201ENST00000366988 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
NENF-201ENST00000366988 TSPOAP1O95153 1857 aa33.42■■■□□ 2.94
NENF-201ENST00000366988 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.38■■■□□ 2.93
NENF-201ENST00000366988 GLI2P10070 1586 aa33.37■■■□□ 2.93
NENF-201ENST00000366988 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.35■■■□□ 2.93
NENF-201ENST00000366988 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.33■■■□□ 2.93
NENF-201ENST00000366988 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
NENF-201ENST00000366988 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.32■■■□□ 2.92
NENF-201ENST00000366988 ARID3CA6NKF2 412 aa33.25■■■□□ 2.91
NENF-201ENST00000366988 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.23■■■□□ 2.91
NENF-201ENST00000366988 ATP10BO94823 1461 aa33.21■■■□□ 2.91
NENF-201ENST00000366988 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
NENF-201ENST00000366988 KDM6BO15054 1643 aa33.2■■■□□ 2.9
NENF-201ENST00000366988 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
NENF-201ENST00000366988 KCNH8Q96L42 1107 aa33.15■■■□□ 2.9
NENF-201ENST00000366988 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.12■■■□□ 2.89
NENF-201ENST00000366988 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
NENF-201ENST00000366988 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
NENF-201ENST00000366988 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.11■■■□□ 2.89
NENF-201ENST00000366988 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.11■■■□□ 2.89
NENF-201ENST00000366988 FMN1Q68DA7 1419 aa33.06■■■□□ 2.88
NENF-201ENST00000366988 CD109Q6YHK3 1445 aa33.03■■■□□ 2.88
NENF-201ENST00000366988 HECW1Q76N89 1606 aa32.99■■■□□ 2.87
NENF-201ENST00000366988 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.98■■■□□ 2.87
NENF-201ENST00000366988 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.96■■■□□ 2.87
NENF-201ENST00000366988 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.93■■■□□ 2.86
NENF-201ENST00000366988 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
NENF-201ENST00000366988 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
NENF-201ENST00000366988 CLIP1P30622 1438 aa32.85■■■□□ 2.85
NENF-201ENST00000366988 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
NENF-201ENST00000366988 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
NENF-201ENST00000366988 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.77■■■□□ 2.84
NENF-201ENST00000366988 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.75■■■□□ 2.834e-7■■■■□ 21.4
NENF-201ENST00000366988 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.75■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.72■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.7■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 NEO1Q92859 1461 aa32.7■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.7■■■□□ 2.83
NENF-201ENST00000366988 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.69■■■□□ 2.82
NENF-201ENST00000366988 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.68■■■□□ 2.82
NENF-201ENST00000366988 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.66■■■□□ 2.82
NENF-201ENST00000366988 CEP162Q5TB80 1403 aa32.65■■■□□ 2.82
NENF-201ENST00000366988 KIF14Q15058 1648 aa32.65■■■□□ 2.82
NENF-201ENST00000366988 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
NENF-201ENST00000366988 FANCAO15360 1455 aa32.61■■■□□ 2.81
NENF-201ENST00000366988 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.59■■■□□ 2.81
NENF-201ENST00000366988 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.55■■■□□ 2.8
NENF-201ENST00000366988 AKNAQ7Z591 1439 aa32.53■■■□□ 2.8
NENF-201ENST00000366988 PLCH2O75038 1416 aa32.52■■■□□ 2.8
NENF-201ENST00000366988 RAPGEF3O95398 923 aa32.5■■■□□ 2.79
NENF-201ENST00000366988 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.49■■■□□ 2.79
NENF-201ENST00000366988 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
NENF-201ENST00000366988 RICTORQ6R327 1708 aa32.46■■■□□ 2.79
NENF-201ENST00000366988 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.45■■■□□ 2.79
NENF-201ENST00000366988 ADGRL1O94910 1474 aa32.43■■■□□ 2.78
NENF-201ENST00000366988 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.42■■■□□ 2.78
NENF-201ENST00000366988 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.41■■■□□ 2.78
NENF-201ENST00000366988 PREX2Q70Z35 1606 aa32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms