RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361757.7

SBNO2-201, Transcript of strawberry notch homolog 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO2, Length 4,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2-201ENST00000361757 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.07■■□□□ 1.92
SBNO2-201ENST00000361757 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.07■■□□□ 1.92
SBNO2-201ENST00000361757 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
SBNO2-201ENST00000361757 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.02■■□□□ 1.92
SBNO2-201ENST00000361757 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27■■□□□ 1.91
SBNO2-201ENST00000361757 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27■■□□□ 1.91
SBNO2-201ENST00000361757 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.98■■□□□ 1.91
SBNO2-201ENST00000361757 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SBNO2-201ENST00000361757 KCNH8Q96L42 1107 aa26.96■■□□□ 1.91
SBNO2-201ENST00000361757 IGF1RP08069 1367 aa26.95■■□□□ 1.91
SBNO2-201ENST00000361757 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.94■■□□□ 1.9
SBNO2-201ENST00000361757 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SBNO2-201ENST00000361757 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.91■■□□□ 1.9
SBNO2-201ENST00000361757 SYNJ1O43426 1573 aa26.9■■□□□ 1.9
SBNO2-201ENST00000361757 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.893e-6■■□□□ 11.9
SBNO2-201ENST00000361757 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.87■■□□□ 1.89
SBNO2-201ENST00000361757 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.85■■□□□ 1.89
SBNO2-201ENST00000361757 TOP2BQ02880 1626 aa26.84■■□□□ 1.89
SBNO2-201ENST00000361757 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.83■■□□□ 1.89
SBNO2-201ENST00000361757 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SBNO2-201ENST00000361757 KIF21BO75037 1637 aa26.79■■□□□ 1.88
SBNO2-201ENST00000361757 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.75■■□□□ 1.87
SBNO2-201ENST00000361757 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.75■■□□□ 1.87
SBNO2-201ENST00000361757 NESP48681 1621 aa26.74■■□□□ 1.87
SBNO2-201ENST00000361757 CUX1P39880 1505 aa26.73■■□□□ 1.87
SBNO2-201ENST00000361757 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.7■■□□□ 1.87
SBNO2-201ENST00000361757 JPH4Q96JJ6 628 aa26.69■■□□□ 1.86
SBNO2-201ENST00000361757 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SBNO2-201ENST00000361757 TOPBP1Q92547 1522 aa26.67■■□□□ 1.86
SBNO2-201ENST00000361757 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SBNO2-201ENST00000361757 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.65■■□□□ 1.86
SBNO2-201ENST00000361757 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.62■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.62■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.61■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 34.1
SBNO2-201ENST00000361757 BCANQ96GW7 911 aa26.61■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 PRXQ9BXM0 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.6■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.59■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.58■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 GRIN2BQ13224 1484 aa26.58■■□□□ 1.85
SBNO2-201ENST00000361757 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
SBNO2-201ENST00000361757 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.848e-7■■■■□ 22.4
SBNO2-201ENST00000361757 IFT140Q96RY7 1462 aa26.53■■□□□ 1.84
SBNO2-201ENST00000361757 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.5■■□□□ 1.83
SBNO2-201ENST00000361757 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.49■■□□□ 1.83
SBNO2-201ENST00000361757 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.48■■□□□ 1.83
SBNO2-201ENST00000361757 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.42■■□□□ 1.82
SBNO2-201ENST00000361757 PTPRGP23470 1445 aa26.42■■□□□ 1.82
SBNO2-201ENST00000361757 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.41■■□□□ 1.82
SBNO2-201ENST00000361757 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.4■■□□□ 1.82
SBNO2-201ENST00000361757 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.39■■□□□ 1.82
SBNO2-201ENST00000361757 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.37■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 MIER1Q8N108 512 aa26.37■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 RGL3Q3MIN7 710 aa26.36■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.36■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 ARAP1Q96P48 1450 aa26.34■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 KANK1Q14678 1352 aa26.33■■□□□ 1.81
SBNO2-201ENST00000361757 NEFMP07197 916 aa26.31■■□□□ 1.8
SBNO2-201ENST00000361757 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.3■■□□□ 1.8
SBNO2-201ENST00000361757 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.28■■□□□ 1.8
SBNO2-201ENST00000361757 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.28■■□□□ 1.8
SBNO2-201ENST00000361757 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.27■■□□□ 1.8
SBNO2-201ENST00000361757 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.27■■□□□ 1.8
SBNO2-201ENST00000361757 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 TMC1Q8TDI8 760 aa26.25■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 PKD2Q13563 968 aa26.23■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.22■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.22■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 CDCA8Q53HL2 280 aa26.21■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 MRS2Q9HD23 443 aa26.21■■□□□ 1.79
SBNO2-201ENST00000361757 OSCARQ8IYS5 282 aa26.19■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 NUP155O75694 1391 aa26.19■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.19■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.782e-12■■■■■ 41.4
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SBNO2-201ENST00000361757 CUL7Q14999 1698 aa26.17■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.17■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.16■■□□□ 1.78
SBNO2-201ENST00000361757 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
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SBNO2-201ENST00000361757 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.12■■□□□ 1.77
SBNO2-201ENST00000361757 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SBNO2-201ENST00000361757 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SBNO2-201ENST00000361757 NCOA2Q15596 1464 aa26.08■■□□□ 1.77
SBNO2-201ENST00000361757 SLC24A1O60721 1099 aa26.08■■□□□ 1.77
SBNO2-201ENST00000361757 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.07■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 FOXD1Q16676 465 aa26.07■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 PRDM2Q13029 1718 aa26.07■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SBNO2-201ENST00000361757 TIAM1Q13009 1591 aa26■■□□□ 1.75
SBNO2-201ENST00000361757 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.99■■□□□ 1.75
SBNO2-201ENST00000361757 SYNJ2O15056 1496 aa25.99■■□□□ 1.75
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