RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356545.6

RSPO1-201, Transcript of R-spondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RSPO1, Length 2,621 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO1-201ENST00000356545 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
RSPO1-201ENST00000356545 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.04■■■□□ 2.4
RSPO1-201ENST00000356545 WDR97A6NE52 1622 aa30.03■■■□□ 2.4
RSPO1-201ENST00000356545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RSPO1-201ENST00000356545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.98■■■□□ 2.39
RSPO1-201ENST00000356545 BCANQ96GW7 911 aa29.95■■■□□ 2.39
RSPO1-201ENST00000356545 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
RSPO1-201ENST00000356545 FKBP8Q14318 412 aa29.89■■■□□ 2.38
RSPO1-201ENST00000356545 P3H3Q8IVL6 736 aa29.88■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.84■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.83■■■□□ 2.37
RSPO1-201ENST00000356545 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.82■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.82■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.77■■■□□ 2.36
RSPO1-201ENST00000356545 PRDM2Q13029 1718 aa29.76■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.76■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 TRIM52Q96A61 297 aa29.74■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.72■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 CCER2I3L3R5 266 aa29.72■■■□□ 2.35
RSPO1-201ENST00000356545 ANP32CO43423 234 aa29.68■■■□□ 2.34
RSPO1-201ENST00000356545 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
RSPO1-201ENST00000356545 NEFLP07196 543 aa29.62■■■□□ 2.33
RSPO1-201ENST00000356545 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.62■■■□□ 2.33
RSPO1-201ENST00000356545 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.6■■■□□ 2.33
RSPO1-201ENST00000356545 TONSLQ96HA7 1378 aa29.56■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.55■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.53■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 PTPRKQ15262 1439 aa29.53■■■□□ 2.32
RSPO1-201ENST00000356545 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.51■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.51■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.47■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 HFM1A2PYH4 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 UACAQ9BZF9 1416 aa29.46■■■□□ 2.31
RSPO1-201ENST00000356545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.44■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.42■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.41■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 FMN1Q68DA7 1419 aa29.4■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.39■■■□□ 2.3
RSPO1-201ENST00000356545 NAIPQ13075 1403 aa29.38■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.37■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.35■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 TOPBP1Q92547 1522 aa29.34■■■□□ 2.29
RSPO1-201ENST00000356545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.32■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.32■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 NCOA2Q15596 1464 aa29.3■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 CUL7Q14999 1698 aa29.3■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.29■■■□□ 2.28
RSPO1-201ENST00000356545 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.26■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 MSH5O43196 834 aa29.24■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.24■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 GRIN2BQ13224 1484 aa29.21■■■□□ 2.27
RSPO1-201ENST00000356545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.2■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 SAMD9Q5K651 1589 aa29.18■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 NESP48681 1621 aa29.18■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 BCL11AQ9H165 835 aa29.16■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.16■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 CCDC184Q52MB2 194 aa29.14■■■□□ 2.26
RSPO1-201ENST00000356545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.1■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.1■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.1■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 ARHGEF11O15085 1522 aa29.08■■■□□ 2.25
RSPO1-201ENST00000356545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.05■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.03■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 KDM6BO15054 1643 aa29.03■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.03■■■□□ 2.24
RSPO1-201ENST00000356545 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.01■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 GAPVD1Q14C86 1478 aa29■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 FOXD1Q16676 465 aa29■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.99■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 HECW1Q76N89 1606 aa28.99■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.97■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.97■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.96■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 CCDC7Q96M83 1385 aa28.95■■■□□ 2.23
RSPO1-201ENST00000356545 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.95■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 NCOA1Q15788 1441 aa28.95■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 AKNAQ7Z591 1439 aa28.94■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.9■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 MRS2Q9HD23 443 aa28.9■■■□□ 2.22
RSPO1-201ENST00000356545 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.86■■■□□ 2.21
RSPO1-201ENST00000356545 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms