RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349062.6

TRIM4-201, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 3,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-201ENST00000349062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.47■□□□□ 0.87
TRIM4-201ENST00000349062 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TRIM4-201ENST00000349062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.869e-7■■■■□ 26.7
TRIM4-201ENST00000349062 PRDM2Q13029 1718 aa20.43■□□□□ 0.86
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRIM4-201ENST00000349062 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.42■□□□□ 0.86
TRIM4-201ENST00000349062 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.4■□□□□ 0.86
TRIM4-201ENST00000349062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.38■□□□□ 0.85
TRIM4-201ENST00000349062 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRIM4-201ENST00000349062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.36■□□□□ 0.85
TRIM4-201ENST00000349062 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.33■□□□□ 0.85
TRIM4-201ENST00000349062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.33■□□□□ 0.85
TRIM4-201ENST00000349062 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.33■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 ERCC6Q03468 1493 aa20.33■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.32■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.29■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.29■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRIM4-201ENST00000349062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 MIER1Q8N108 512 aa20.24■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.24■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.23■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRIM4-201ENST00000349062 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.2■□□□□ 0.82
TRIM4-201ENST00000349062 TIAM1Q13009 1591 aa20.2■□□□□ 0.82
TRIM4-201ENST00000349062 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRIM4-201ENST00000349062 TRIM52Q96A61 297 aa20.15■□□□□ 0.82
TRIM4-201ENST00000349062 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.14■□□□□ 0.81
TRIM4-201ENST00000349062 FMN1Q68DA7 1419 aa20.13■□□□□ 0.81
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TRIM4-201ENST00000349062 CUL7Q14999 1698 aa20.09■□□□□ 0.81
TRIM4-201ENST00000349062 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.08■□□□□ 0.81
TRIM4-201ENST00000349062 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.08■□□□□ 0.81
TRIM4-201ENST00000349062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.04■□□□□ 0.8
TRIM4-201ENST00000349062 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.02■□□□□ 0.8
TRIM4-201ENST00000349062 GRIN2BQ13224 1484 aa20.02■□□□□ 0.8
TRIM4-201ENST00000349062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.01■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.01■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 FOXD1Q16676 465 aa20■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.99■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.97■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 WDR97A6NE52 1622 aa19.96■□□□□ 0.79
TRIM4-201ENST00000349062 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 NCOA2Q15596 1464 aa19.95■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 JPH4Q96JJ6 628 aa19.94■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 IFT140Q96RY7 1462 aa19.93■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.92■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 MYT1Q01538 1121 aa19.91■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 PTPRKQ15262 1439 aa19.91■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 IQGAP2Q13576 1575 aa19.9■□□□□ 0.78
TRIM4-201ENST00000349062 PBRM1Q86U86 1689 aa19.89■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 MAP3K1Q13233 1512 aa19.87■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 TONSLQ96HA7 1378 aa19.86■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.86■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.85■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 ADAMTS12P58397 1594 aa19.84■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 KCNH8Q96L42 1107 aa19.84■□□□□ 0.77
TRIM4-201ENST00000349062 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.82■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 GRIN2AQ12879 1464 aa19.81■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.81■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 MAPKBP1O60336 1514 aa19.81■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 SAMD9Q5K651 1589 aa19.8■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.79■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 WDR62O43379 1518 aa19.78■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TRIM4-201ENST00000349062 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.77■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.76■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.76■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.76■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 NAIPQ13075 1403 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 DISP1Q96F81 1524 aa19.71■□□□□ 0.75
TRIM4-201ENST00000349062 HECW1Q76N89 1606 aa19.69■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.68■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.68■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 SYNJ2O15056 1496 aa19.67■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.67■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 HFM1A2PYH4 1435 aa19.66■□□□□ 0.74
TRIM4-201ENST00000349062 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.64■□□□□ 0.73
TRIM4-201ENST00000349062 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.731e-7■■■■□ 20.2
TRIM4-201ENST00000349062 CEP170Q5SW79 1584 aa19.62■□□□□ 0.73
TRIM4-201ENST00000349062 KIAA0556O60303 1618 aa19.62■□□□□ 0.73
TRIM4-201ENST00000349062 UACAQ9BZF9 1416 aa19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms