RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345957.8

SNX16-201, Transcript of sorting nexin 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX16, Length 1,853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16-201ENST00000345957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.59■■□□□ 1.85
SNX16-201ENST00000345957 MAP3K1Q13233 1512 aa26.57■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 GRIN2BQ13224 1484 aa26.54■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
SNX16-201ENST00000345957 ADAMTS12P58397 1594 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 TIAM1Q13009 1591 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX16-201ENST00000345957 SAMD9Q5K651 1589 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 FMN1Q68DA7 1419 aa26.41■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 P3H3Q8IVL6 736 aa26.4■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.82
SNX16-201ENST00000345957 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.39■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.35■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
SNX16-201ENST00000345957 IQGAP2Q13576 1575 aa26.32■■□□□ 1.8
SNX16-201ENST00000345957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.3■■□□□ 1.8
SNX16-201ENST00000345957 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SNX16-201ENST00000345957 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.25■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 GRIN2AQ12879 1464 aa26.22■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.21■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SNX16-201ENST00000345957 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.2■■□□□ 1.78
SNX16-201ENST00000345957 SYNJ2O15056 1496 aa26.16■■□□□ 1.78
SNX16-201ENST00000345957 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.12■■□□□ 1.77
SNX16-201ENST00000345957 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
SNX16-201ENST00000345957 HECW1Q76N89 1606 aa26.07■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.06■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.05■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 KIAA0556O60303 1618 aa26.04■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 DISP1Q96F81 1524 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 CEP170Q5SW79 1584 aa26.02■■□□□ 1.76
SNX16-201ENST00000345957 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
SNX16-201ENST00000345957 NUP160Q12769 1436 aa26■■□□□ 1.75
SNX16-201ENST00000345957 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.96■■□□□ 1.75
SNX16-201ENST00000345957 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 FBLN2P98095 1184 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 NCOA2Q15596 1464 aa25.92■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 ITGAEP38570 1179 aa25.9■■□□□ 1.74
SNX16-201ENST00000345957 ARHGEF11O15085 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.87■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.87■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.87■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.85■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.83■■□□□ 1.73
SNX16-201ENST00000345957 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.81■■□□□ 1.72
SNX16-201ENST00000345957 JPH4Q96JJ6 628 aa25.81■■□□□ 1.72
SNX16-201ENST00000345957 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SNX16-201ENST00000345957 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.73■■□□□ 1.71
SNX16-201ENST00000345957 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SNX16-201ENST00000345957 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SNX16-201ENST00000345957 MIA2Q96PC5 1412 aa25.7■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.68■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 ARID3CA6NKF2 412 aa25.64■■□□□ 1.7
SNX16-201ENST00000345957 ABCA8O94911 1581 aa25.63■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 HFM1A2PYH4 1435 aa25.63■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 PTPRKQ15262 1439 aa25.61■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 MAPKBP1O60336 1514 aa25.58■■□□□ 1.69
SNX16-201ENST00000345957 SHROOM2Q13796 1616 aa25.57■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.55■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 AKNAQ7Z591 1439 aa25.54■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 NAIPQ13075 1403 aa25.53■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 PTPRGP23470 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
SNX16-201ENST00000345957 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 ATP10BO94823 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 UACAQ9BZF9 1416 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.46■■□□□ 1.67
SNX16-201ENST00000345957 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 KIF14Q15058 1648 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 OSCARQ8IYS5 282 aa25.43■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.42■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 DAPK1P53355 1430 aa25.41■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 ROCK1Q13464 1354 aa25.4■■□□□ 1.66
SNX16-201ENST00000345957 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 ABCC5O15440 1437 aa25.37■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SNX16-201ENST00000345957 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.36■■□□□ 1.65
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