RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343245.7

ATG5-201, Transcript of autophagy related 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG5, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5-201ENST00000343245 ERCC6Q03468 1493 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG5-201ENST00000343245 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG5-201ENST00000343245 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG5-201ENST00000343245 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
ATG5-201ENST00000343245 TIAM1Q13009 1591 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG5-201ENST00000343245 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ATG5-201ENST00000343245 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ATG5-201ENST00000343245 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG5-201ENST00000343245 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ATG5-201ENST00000343245 IQGAP2Q13576 1575 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG5-201ENST00000343245 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ATG5-201ENST00000343245 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.89■■□□□ 1.26
ATG5-201ENST00000343245 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 FMN1Q68DA7 1419 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 APLP2Q06481 763 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 GRIN2AQ12879 1464 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ATG5-201ENST00000343245 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG5-201ENST00000343245 SYNJ2O15056 1496 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG5-201ENST00000343245 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ATG5-201ENST00000343245 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG5-201ENST00000343245 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG5-201ENST00000343245 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ATG5-201ENST00000343245 CEP170Q5SW79 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG5-201ENST00000343245 KIAA0556O60303 1618 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG5-201ENST00000343245 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ATG5-201ENST00000343245 HECW1Q76N89 1606 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG5-201ENST00000343245 NUP160Q12769 1436 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG5-201ENST00000343245 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG5-201ENST00000343245 DISP1Q96F81 1524 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG5-201ENST00000343245 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG5-201ENST00000343245 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
ATG5-201ENST00000343245 ARHGEF11O15085 1522 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG5-201ENST00000343245 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
ATG5-201ENST00000343245 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ATG5-201ENST00000343245 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG5-201ENST00000343245 CHD1O14646 1710 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG5-201ENST00000343245 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG5-201ENST00000343245 P3H3Q8IVL6 736 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG5-201ENST00000343245 SHROOM2Q13796 1616 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG5-201ENST00000343245 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG5-201ENST00000343245 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ATG5-201ENST00000343245 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.48■■□□□ 1.19
ATG5-201ENST00000343245 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 NCOA2Q15596 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 ABCA8O94911 1581 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG5-201ENST00000343245 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.34■■□□□ 1.17
ATG5-201ENST00000343245 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG5-201ENST00000343245 MIA2Q96PC5 1412 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG5-201ENST00000343245 JPH4Q96JJ6 628 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG5-201ENST00000343245 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG5-201ENST00000343245 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG5-201ENST00000343245 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG5-201ENST00000343245 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG5-201ENST00000343245 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG5-201ENST00000343245 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG5-201ENST00000343245 AKNAQ7Z591 1439 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 FBLN2P98095 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 HFM1A2PYH4 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG5-201ENST00000343245 KIF14Q15058 1648 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 MAPKBP1O60336 1514 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 PTPRKQ15262 1439 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 ATP10BO94823 1461 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 ABCC2Q92887 1545 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG5-201ENST00000343245 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.08■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 PTPRGP23470 1445 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 NAIPQ13075 1403 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 UACAQ9BZF9 1416 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 ROCK1Q13464 1354 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG5-201ENST00000343245 PREX2Q70Z35 1606 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG5-201ENST00000343245 DAPK1P53355 1430 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG5-201ENST00000343245 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG5-201ENST00000343245 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ATG5-201ENST00000343245 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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