RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341028.8

CDK11B-202, Transcript of cyclin dependent kinase 11B, humanhuman

TSL 2

Gene CDK11B, Length 881 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11B-202ENST00000341028 JPH4Q96JJ6 628 aa38.05■■■■□ 3.68
CDK11B-202ENST00000341028 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.02■■■■□ 3.68
CDK11B-202ENST00000341028 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
CDK11B-202ENST00000341028 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.96■■■■□ 3.67
CDK11B-202ENST00000341028 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.85■■■■□ 3.65
CDK11B-202ENST00000341028 PRXQ9BXM0 1461 aa37.82■■■■□ 3.64
CDK11B-202ENST00000341028 IQGAP2Q13576 1575 aa37.76■■■■□ 3.63
CDK11B-202ENST00000341028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.74■■■■□ 3.63
CDK11B-202ENST00000341028 EEA1Q15075 1411 aa37.71■■■■□ 3.63
CDK11B-202ENST00000341028 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.59■■■■□ 3.61
CDK11B-202ENST00000341028 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.58■■■■□ 3.61
CDK11B-202ENST00000341028 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.57■■■■□ 3.61
CDK11B-202ENST00000341028 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
CDK11B-202ENST00000341028 DISP1Q96F81 1524 aa37.55■■■■□ 3.6
CDK11B-202ENST00000341028 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
CDK11B-202ENST00000341028 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.5■■■■□ 3.59
CDK11B-202ENST00000341028 PTPRGP23470 1445 aa37.49■■■■□ 3.59
CDK11B-202ENST00000341028 KIAA0556O60303 1618 aa37.41■■■■□ 3.58
CDK11B-202ENST00000341028 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.41■■■■□ 3.58
CDK11B-202ENST00000341028 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
CDK11B-202ENST00000341028 KIF21BO75037 1637 aa37.35■■■■□ 3.57
CDK11B-202ENST00000341028 GOLGA3Q08378 1498 aa37.32■■■■□ 3.56
CDK11B-202ENST00000341028 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
CDK11B-202ENST00000341028 UACAQ9BZF9 1416 aa37.24■■■■□ 3.55
CDK11B-202ENST00000341028 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.22■■■■□ 3.55
CDK11B-202ENST00000341028 MAPKBP1O60336 1514 aa37.2■■■■□ 3.55
CDK11B-202ENST00000341028 ABCC2Q92887 1545 aa37.17■■■■□ 3.54
CDK11B-202ENST00000341028 SAMD9Q5K651 1589 aa37.12■■■■□ 3.53
CDK11B-202ENST00000341028 P3H3Q8IVL6 736 aa37.11■■■■□ 3.53
CDK11B-202ENST00000341028 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.09■■■■□ 3.53
CDK11B-202ENST00000341028 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.08■■■■□ 3.53
CDK11B-202ENST00000341028 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.07■■■■□ 3.52
CDK11B-202ENST00000341028 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.06■■■■□ 3.52
CDK11B-202ENST00000341028 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.05■■■■□ 3.52
CDK11B-202ENST00000341028 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CDK11B-202ENST00000341028 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
CDK11B-202ENST00000341028 ABCA8O94911 1581 aa37.04■■■■□ 3.52
CDK11B-202ENST00000341028 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.99■■■■□ 3.51
CDK11B-202ENST00000341028 DIP2BQ9P265 1576 aa36.98■■■■□ 3.51
CDK11B-202ENST00000341028 ASXL2Q76L83 1435 aa36.96■■■■□ 3.51
CDK11B-202ENST00000341028 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CDK11B-202ENST00000341028 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.9■■■■□ 3.5
CDK11B-202ENST00000341028 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.9■■■■□ 3.5
CDK11B-202ENST00000341028 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.79■■■■□ 3.48
CDK11B-202ENST00000341028 GLI2P10070 1586 aa36.76■■■■□ 3.48
CDK11B-202ENST00000341028 ATP10BO94823 1461 aa36.75■■■■□ 3.47
CDK11B-202ENST00000341028 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
CDK11B-202ENST00000341028 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.74■■■■□ 3.47
CDK11B-202ENST00000341028 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.73■■■■□ 3.47
CDK11B-202ENST00000341028 ARID3CA6NKF2 412 aa36.72■■■■□ 3.47
CDK11B-202ENST00000341028 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
CDK11B-202ENST00000341028 TSPOAP1O95153 1857 aa36.67■■■■□ 3.46
CDK11B-202ENST00000341028 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.59■■■■□ 3.45
CDK11B-202ENST00000341028 KCNH8Q96L42 1107 aa36.58■■■■□ 3.45
CDK11B-202ENST00000341028 FMN1Q68DA7 1419 aa36.57■■■■□ 3.44
CDK11B-202ENST00000341028 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CDK11B-202ENST00000341028 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CDK11B-202ENST00000341028 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
CDK11B-202ENST00000341028 CLIP1P30622 1438 aa36.44■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.44■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 CD109Q6YHK3 1445 aa36.42■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 KDM6BO15054 1643 aa36.41■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 HECW1Q76N89 1606 aa36.4■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.39■■■■□ 3.42
CDK11B-202ENST00000341028 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.38■■■■□ 3.41
CDK11B-202ENST00000341028 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
CDK11B-202ENST00000341028 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.36■■■■□ 3.41
CDK11B-202ENST00000341028 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.34■■■■□ 3.41
CDK11B-202ENST00000341028 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.32■■■■□ 3.4
CDK11B-202ENST00000341028 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.29■■■■□ 3.4
CDK11B-202ENST00000341028 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CDK11B-202ENST00000341028 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CDK11B-202ENST00000341028 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.25■■■■□ 3.39
CDK11B-202ENST00000341028 CEP162Q5TB80 1403 aa36.25■■■■□ 3.39
CDK11B-202ENST00000341028 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CDK11B-202ENST00000341028 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
CDK11B-202ENST00000341028 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.17■■■■□ 3.38
CDK11B-202ENST00000341028 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.13■■■■□ 3.37
CDK11B-202ENST00000341028 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.11■■■■□ 3.37
CDK11B-202ENST00000341028 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CDK11B-202ENST00000341028 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.07■■■■□ 3.36
CDK11B-202ENST00000341028 NEO1Q92859 1461 aa36.06■■■■□ 3.36
CDK11B-202ENST00000341028 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.06■■■■□ 3.36
CDK11B-202ENST00000341028 KIF14Q15058 1648 aa36.02■■■■□ 3.36
CDK11B-202ENST00000341028 PLCH2O75038 1416 aa35.97■■■■□ 3.35
CDK11B-202ENST00000341028 FANCAO15360 1455 aa35.96■■■■□ 3.35
CDK11B-202ENST00000341028 AKNAQ7Z591 1439 aa35.91■■■■□ 3.34
CDK11B-202ENST00000341028 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.9■■■■□ 3.34
CDK11B-202ENST00000341028 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.89■■■■□ 3.34
CDK11B-202ENST00000341028 RAPGEF3O95398 923 aa35.88■■■■□ 3.33
CDK11B-202ENST00000341028 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.83■■■■□ 3.33
CDK11B-202ENST00000341028 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.82■■■■□ 3.32
CDK11B-202ENST00000341028 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.81■■■■□ 3.32
CDK11B-202ENST00000341028 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CDK11B-202ENST00000341028 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.76■■■■□ 3.31
CDK11B-202ENST00000341028 ADGRL1O94910 1474 aa35.75■■■■□ 3.31
CDK11B-202ENST00000341028 RICTORQ6R327 1708 aa35.75■■■■□ 3.31
CDK11B-202ENST00000341028 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.75■■■■□ 3.31
CDK11B-202ENST00000341028 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.75■■■■□ 3.31
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