RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339083.11

RHOC-202, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOC, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOC-202ENST00000339083 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.56■■■■■ 4.56
RHOC-202ENST00000339083 JPH4Q96JJ6 628 aa43.52■■■■■ 4.56
RHOC-202ENST00000339083 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
RHOC-202ENST00000339083 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.49■■■■■ 4.55
RHOC-202ENST00000339083 PRXQ9BXM0 1461 aa43.35■■■■■ 4.53
RHOC-202ENST00000339083 IQGAP2Q13576 1575 aa43.33■■■■■ 4.53
RHOC-202ENST00000339083 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.31■■■■■ 4.52
RHOC-202ENST00000339083 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.19■■■■■ 4.51
RHOC-202ENST00000339083 EEA1Q15075 1411 aa43.18■■■■■ 4.5
RHOC-202ENST00000339083 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.15■■■■■ 4.5
RHOC-202ENST00000339083 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.1■■■■■ 4.49
RHOC-202ENST00000339083 DISP1Q96F81 1524 aa43.07■■■■■ 4.48
RHOC-202ENST00000339083 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.02■■■■■ 4.48
RHOC-202ENST00000339083 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
RHOC-202ENST00000339083 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.96■■■■■ 4.47
RHOC-202ENST00000339083 KIAA0556O60303 1618 aa42.95■■■■■ 4.47
RHOC-202ENST00000339083 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.94■■■■■ 4.46
RHOC-202ENST00000339083 PTPRGP23470 1445 aa42.92■■■■■ 4.46
RHOC-202ENST00000339083 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
RHOC-202ENST00000339083 KIF21BO75037 1637 aa42.87■■■■■ 4.45
RHOC-202ENST00000339083 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
RHOC-202ENST00000339083 GOLGA3Q08378 1498 aa42.75■■■■■ 4.43
RHOC-202ENST00000339083 MAPKBP1O60336 1514 aa42.68■■■■■ 4.42
RHOC-202ENST00000339083 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.67■■■■■ 4.42
RHOC-202ENST00000339083 UACAQ9BZF9 1416 aa42.65■■■■■ 4.42
RHOC-202ENST00000339083 ABCC2Q92887 1545 aa42.63■■■■■ 4.42
RHOC-202ENST00000339083 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.63■■■■■ 4.42
RHOC-202ENST00000339083 SAMD9Q5K651 1589 aa42.63■■■■■ 4.41
RHOC-202ENST00000339083 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.41
RHOC-202ENST00000339083 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.51■■■■■ 4.4
RHOC-202ENST00000339083 ABCA8O94911 1581 aa42.5■■■■■ 4.39
RHOC-202ENST00000339083 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.48■■■■■ 4.39
RHOC-202ENST00000339083 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.47■■■■■ 4.39
RHOC-202ENST00000339083 DIP2BQ9P265 1576 aa42.47■■■■■ 4.39
RHOC-202ENST00000339083 P3H3Q8IVL6 736 aa42.45■■■■■ 4.39
RHOC-202ENST00000339083 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.44■■■■■ 4.38
RHOC-202ENST00000339083 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
RHOC-202ENST00000339083 ASXL2Q76L83 1435 aa42.36■■■■■ 4.37
RHOC-202ENST00000339083 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
RHOC-202ENST00000339083 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
RHOC-202ENST00000339083 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.33■■■■■ 4.37
RHOC-202ENST00000339083 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.31■■■■■ 4.36
RHOC-202ENST00000339083 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.3■■■■■ 4.36
RHOC-202ENST00000339083 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.21■■■■■ 4.35
RHOC-202ENST00000339083 GLI2P10070 1586 aa42.17■■■■■ 4.34
RHOC-202ENST00000339083 TSPOAP1O95153 1857 aa42.13■■■■■ 4.34
RHOC-202ENST00000339083 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
RHOC-202ENST00000339083 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.13■■■■■ 4.33
RHOC-202ENST00000339083 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.11■■■■■ 4.33
RHOC-202ENST00000339083 ATP10BO94823 1461 aa42.1■■■■■ 4.33
RHOC-202ENST00000339083 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.32
RHOC-202ENST00000339083 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
RHOC-202ENST00000339083 ARID3CA6NKF2 412 aa42.03■■■■■ 4.32
RHOC-202ENST00000339083 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.01■■■■■ 4.32
RHOC-202ENST00000339083 FMN1Q68DA7 1419 aa41.88■■■■■ 4.29
RHOC-202ENST00000339083 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.84■■■■■ 4.29
RHOC-202ENST00000339083 KCNH8Q96L42 1107 aa41.83■■■■■ 4.29
RHOC-202ENST00000339083 KDM6BO15054 1643 aa41.78■■■■■ 4.28
RHOC-202ENST00000339083 HECW1Q76N89 1606 aa41.77■■■■■ 4.28
RHOC-202ENST00000339083 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
RHOC-202ENST00000339083 CLIP1P30622 1438 aa41.74■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.72■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 CD109Q6YHK3 1445 aa41.71■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.7■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.69■■■■■ 4.27
RHOC-202ENST00000339083 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.69■■■■■ 4.26
RHOC-202ENST00000339083 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
RHOC-202ENST00000339083 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
RHOC-202ENST00000339083 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.59■■■■■ 4.25
RHOC-202ENST00000339083 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.58■■■■■ 4.25
RHOC-202ENST00000339083 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
RHOC-202ENST00000339083 CEP162Q5TB80 1403 aa41.54■■■■■ 4.24
RHOC-202ENST00000339083 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.53■■■■■ 4.24
RHOC-202ENST00000339083 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.49■■■■■ 4.233e-6■■■■□ 24.1
RHOC-202ENST00000339083 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.47■■■■■ 4.23
RHOC-202ENST00000339083 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
RHOC-202ENST00000339083 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.41■■■■■ 4.22
RHOC-202ENST00000339083 KIF14Q15058 1648 aa41.37■■■■■ 4.21
RHOC-202ENST00000339083 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
RHOC-202ENST00000339083 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.34■■■■■ 4.21
RHOC-202ENST00000339083 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
RHOC-202ENST00000339083 NEO1Q92859 1461 aa41.32■■■■■ 4.21
RHOC-202ENST00000339083 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.26■■■■■ 4.2
RHOC-202ENST00000339083 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.23■■■■■ 4.19
RHOC-202ENST00000339083 FANCAO15360 1455 aa41.21■■■■■ 4.19
RHOC-202ENST00000339083 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.21■■■■■ 4.19
RHOC-202ENST00000339083 PLCH2O75038 1416 aa41.19■■■■■ 4.18
RHOC-202ENST00000339083 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.16■■■■■ 4.18
RHOC-202ENST00000339083 AKNAQ7Z591 1439 aa41.14■■■■■ 4.18
RHOC-202ENST00000339083 RICTORQ6R327 1708 aa41.08■■■■■ 4.17
RHOC-202ENST00000339083 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.07■■■■■ 4.16
RHOC-202ENST00000339083 RAPGEF3O95398 923 aa41.06■■■■■ 4.16
RHOC-202ENST00000339083 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.04■■■■■ 4.16
RHOC-202ENST00000339083 PREX2Q70Z35 1606 aa41.03■■■■■ 4.16
RHOC-202ENST00000339083 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
RHOC-202ENST00000339083 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.01■■■■■ 4.16
RHOC-202ENST00000339083 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.99■■■■■ 4.15
RHOC-202ENST00000339083 ADGRL1O94910 1474 aa40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms