RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337006.8

AGTPBP1-201, Transcript of ATP/GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AGTPBP1, Length 4,473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1-201ENST00000337006 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.62■■□□□ 1.21
AGTPBP1-201ENST00000337006 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.61■■□□□ 1.21
AGTPBP1-201ENST00000337006 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.6■■□□□ 1.21
AGTPBP1-201ENST00000337006 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
AGTPBP1-201ENST00000337006 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.58■■□□□ 1.21
AGTPBP1-201ENST00000337006 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1-201ENST00000337006 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1-201ENST00000337006 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1-201ENST00000337006 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1-201ENST00000337006 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
AGTPBP1-201ENST00000337006 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.47■■□□□ 1.19
AGTPBP1-201ENST00000337006 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
AGTPBP1-201ENST00000337006 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1-201ENST00000337006 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.42■■□□□ 1.18
AGTPBP1-201ENST00000337006 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.39■■□□□ 1.17
AGTPBP1-201ENST00000337006 NCAPD3P42695 1498 aa22.38■■□□□ 1.17
AGTPBP1-201ENST00000337006 FKBP8Q14318 412 aa22.37■■□□□ 1.17
AGTPBP1-201ENST00000337006 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AGTPBP1-201ENST00000337006 RGL3Q3MIN7 710 aa22.36■■□□□ 1.17
AGTPBP1-201ENST00000337006 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.35■■□□□ 1.17
AGTPBP1-201ENST00000337006 MRS2Q9HD23 443 aa22.32■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 FMN1Q68DA7 1419 aa22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.3■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 TMC1Q8TDI8 760 aa22.29■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 IGF1RP08069 1367 aa22.28■■□□□ 1.16
AGTPBP1-201ENST00000337006 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1-201ENST00000337006 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1-201ENST00000337006 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.22■■□□□ 1.15
AGTPBP1-201ENST00000337006 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1-201ENST00000337006 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
AGTPBP1-201ENST00000337006 FOXD1Q16676 465 aa22.18■■□□□ 1.14
AGTPBP1-201ENST00000337006 MYT1Q01538 1121 aa22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1-201ENST00000337006 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1-201ENST00000337006 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1-201ENST00000337006 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 SYNJ1O43426 1573 aa22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 CFTRP13569 1480 aa22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 JPH4Q96JJ6 628 aa22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 NEFMP07197 916 aa22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1-201ENST00000337006 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.04■■□□□ 1.12
AGTPBP1-201ENST00000337006 PKD2Q13563 968 aa22.04■■□□□ 1.12
AGTPBP1-201ENST00000337006 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.04■■□□□ 1.12
AGTPBP1-201ENST00000337006 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1-201ENST00000337006 KIF21BO75037 1637 aa22.02■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 NESP48681 1621 aa22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 BCL11AQ9H165 835 aa22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 SLC24A1O60721 1099 aa22■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
AGTPBP1-201ENST00000337006 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 HMGXB3Q12766 1538 aa21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 CUX1P39880 1505 aa21.92■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.92■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 NUP155O75694 1391 aa21.92■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 ARAP1Q96P48 1450 aa21.91■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.91■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.9■■□□□ 1.1
AGTPBP1-201ENST00000337006 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.89■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 PRXQ9BXM0 1461 aa21.89■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 TOP2BQ02880 1626 aa21.88■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.88■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.87■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.86■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.85■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.85■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.84■■□□□ 1.09
AGTPBP1-201ENST00000337006 CDCA8Q53HL2 280 aa21.83■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 GGT6Q6P531 493 aa21.8■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 TOPBP1Q92547 1522 aa21.78■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 PTPRGP23470 1445 aa21.78■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.77■■□□□ 1.08
AGTPBP1-201ENST00000337006 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
AGTPBP1-201ENST00000337006 CCER2I3L3R5 266 aa21.75■■□□□ 1.07
AGTPBP1-201ENST00000337006 KANK1Q14678 1352 aa21.75■■□□□ 1.07
AGTPBP1-201ENST00000337006 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.73■■□□□ 1.07
AGTPBP1-201ENST00000337006 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
AGTPBP1-201ENST00000337006 TMF1P82094 1093 aa21.72■■□□□ 1.07
AGTPBP1-201ENST00000337006 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.7■■□□□ 1.06
AGTPBP1-201ENST00000337006 KIF3BO15066 747 aa21.7■■□□□ 1.06
AGTPBP1-201ENST00000337006 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.7■■□□□ 1.06
AGTPBP1-201ENST00000337006 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.7■■□□□ 1.06
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