RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6-201ENST00000329970 JPH4Q96JJ6 628 aa23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6-201ENST00000329970 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.5■■□□□ 1.35
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.4■■□□□ 1.34
GTF3C6-201ENST00000329970 IQGAP2Q13576 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
GTF3C6-201ENST00000329970 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.37■■□□□ 1.33
GTF3C6-201ENST00000329970 MAPKBP1O60336 1514 aa23.36■■□□□ 1.33
GTF3C6-201ENST00000329970 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.35■■□□□ 1.33
GTF3C6-201ENST00000329970 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
GTF3C6-201ENST00000329970 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.27■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.26■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 PTPRGP23470 1445 aa23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.25■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 DISP1Q96F81 1524 aa23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 DIP2BQ9P265 1576 aa23.23■■□□□ 1.31
GTF3C6-201ENST00000329970 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6-201ENST00000329970 KIAA0556O60303 1618 aa23.18■■□□□ 1.3
GTF3C6-201ENST00000329970 PRXQ9BXM0 1461 aa23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC2Q92887 1545 aa23.17■■□□□ 1.3
GTF3C6-201ENST00000329970 UACAQ9BZF9 1416 aa23.12■■□□□ 1.29
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.11■■□□□ 1.29
GTF3C6-201ENST00000329970 GOLGA3Q08378 1498 aa23.07■■□□□ 1.28
GTF3C6-201ENST00000329970 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6-201ENST00000329970 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.06■■□□□ 1.28
GTF3C6-201ENST00000329970 GLI2P10070 1586 aa23.05■■□□□ 1.28
GTF3C6-201ENST00000329970 TSPOAP1O95153 1857 aa23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6-201ENST00000329970 ASXL2Q76L83 1435 aa23.02■■□□□ 1.28
GTF3C6-201ENST00000329970 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6-201ENST00000329970 EEA1Q15075 1411 aa23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6-201ENST00000329970 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCA8O94911 1581 aa22.96■■□□□ 1.27
GTF3C6-201ENST00000329970 KDM6BO15054 1643 aa22.96■■□□□ 1.27
GTF3C6-201ENST00000329970 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GTF3C6-201ENST00000329970 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.95■■□□□ 1.26
GTF3C6-201ENST00000329970 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6-201ENST00000329970 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GTF3C6-201ENST00000329970 SAMD9Q5K651 1589 aa22.89■■□□□ 1.26
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF21BO75037 1637 aa22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6-201ENST00000329970 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6-201ENST00000329970 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6-201ENST00000329970 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6-201ENST00000329970 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GTF3C6-201ENST00000329970 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.75■■□□□ 1.23
GTF3C6-201ENST00000329970 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.72■■□□□ 1.23
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP10BO94823 1461 aa22.71■■□□□ 1.23
GTF3C6-201ENST00000329970 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.7■■□□□ 1.22
GTF3C6-201ENST00000329970 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6-201ENST00000329970 P3H3Q8IVL6 736 aa22.67■■□□□ 1.22
GTF3C6-201ENST00000329970 CD109Q6YHK3 1445 aa22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6-201ENST00000329970 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.66■■□□□ 1.22
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.64■■□□□ 1.22
GTF3C6-201ENST00000329970 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6-201ENST00000329970 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.61■■□□□ 1.21
GTF3C6-201ENST00000329970 KCNH8Q96L42 1107 aa22.6■■□□□ 1.21
GTF3C6-201ENST00000329970 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6-201ENST00000329970 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6-201ENST00000329970 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6-201ENST00000329970 ARID3CA6NKF2 412 aa22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6-201ENST00000329970 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6-201ENST00000329970 NEO1Q92859 1461 aa22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6-201ENST00000329970 ADGRL1O94910 1474 aa22.47■■□□□ 1.19
GTF3C6-201ENST00000329970 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 FMN1Q68DA7 1419 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 HECW1Q76N89 1606 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6-201ENST00000329970 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6-201ENST00000329970 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GTF3C6-201ENST00000329970 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.36■■□□□ 1.17
GTF3C6-201ENST00000329970 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.35■■□□□ 1.17
GTF3C6-201ENST00000329970 RICTORQ6R327 1708 aa22.33■■□□□ 1.17
GTF3C6-201ENST00000329970 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.31■■□□□ 1.16
GTF3C6-201ENST00000329970 FANCAO15360 1455 aa22.3■■□□□ 1.16
GTF3C6-201ENST00000329970 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.29■■□□□ 1.16
GTF3C6-201ENST00000329970 AKNAQ7Z591 1439 aa22.28■■□□□ 1.16
GTF3C6-201ENST00000329970 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.27■■□□□ 1.16
GTF3C6-201ENST00000329970 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 RAPGEF3O95398 923 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.25■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 PLCH2O75038 1416 aa22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF14Q15058 1648 aa22.24■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.22■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6-201ENST00000329970 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6-201ENST00000329970 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6-201ENST00000329970 CLIP1P30622 1438 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6-201ENST00000329970 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6-201ENST00000329970 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms