RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327359.7

BRF1-201, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

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Gene BRF1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-201ENST00000327359 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
BRF1-201ENST00000327359 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.5■■□□□ 1.35
BRF1-201ENST00000327359 BCL11AQ9H165 835 aa23.44■■□□□ 1.34
BRF1-201ENST00000327359 WDR97A6NE52 1622 aa23.43■■□□□ 1.34
BRF1-201ENST00000327359 P3H3Q8IVL6 736 aa23.42■■□□□ 1.34
BRF1-201ENST00000327359 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
BRF1-201ENST00000327359 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.39■■□□□ 1.33
BRF1-201ENST00000327359 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
BRF1-201ENST00000327359 CUL7Q14999 1698 aa23.37■■□□□ 1.33
BRF1-201ENST00000327359 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.36■■□□□ 1.33
BRF1-201ENST00000327359 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.35■■□□□ 1.33
BRF1-201ENST00000327359 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.34■■□□□ 1.33
BRF1-201ENST00000327359 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
BRF1-201ENST00000327359 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
BRF1-201ENST00000327359 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
BRF1-201ENST00000327359 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.318e-7■■■■■ 27.9
BRF1-201ENST00000327359 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.24■■□□□ 1.31
BRF1-201ENST00000327359 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.23■■□□□ 1.31
BRF1-201ENST00000327359 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.23■■□□□ 1.31
BRF1-201ENST00000327359 ERCC6Q03468 1493 aa23.22■■□□□ 1.31
BRF1-201ENST00000327359 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.18■■□□□ 1.3
BRF1-201ENST00000327359 PBRM1Q86U86 1689 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-201ENST00000327359 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-201ENST00000327359 WDR62O43379 1518 aa23.16■■□□□ 1.3
BRF1-201ENST00000327359 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
BRF1-201ENST00000327359 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.12■■□□□ 1.29
BRF1-201ENST00000327359 IFT140Q96RY7 1462 aa23.12■■□□□ 1.29
BRF1-201ENST00000327359 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
BRF1-201ENST00000327359 TIAM1Q13009 1591 aa23.12■■□□□ 1.29
BRF1-201ENST00000327359 GRIN2BQ13224 1484 aa23.09■■□□□ 1.29
BRF1-201ENST00000327359 ITGAEP38570 1179 aa23.05■■□□□ 1.28
BRF1-201ENST00000327359 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.05■■□□□ 1.28
BRF1-201ENST00000327359 MAP3K1Q13233 1512 aa23.04■■□□□ 1.28
BRF1-201ENST00000327359 ADAMTS12P58397 1594 aa23.04■■□□□ 1.28
BRF1-201ENST00000327359 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
BRF1-201ENST00000327359 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-201ENST00000327359 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.01■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 FMN1Q68DA7 1419 aa23■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 SAMD9Q5K651 1589 aa22.99■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 KCNH8Q96L42 1107 aa22.98■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.97■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.96■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-201ENST00000327359 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-201ENST00000327359 IQGAP2Q13576 1575 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-201ENST00000327359 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BRF1-201ENST00000327359 FBLN2P98095 1184 aa22.89■■□□□ 1.26
BRF1-201ENST00000327359 BCANQ96GW7 911 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-201ENST00000327359 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
BRF1-201ENST00000327359 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-201ENST00000327359 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-201ENST00000327359 GRIN2AQ12879 1464 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-201ENST00000327359 ARID3CA6NKF2 412 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-201ENST00000327359 MAPKBP1O60336 1514 aa22.81■■□□□ 1.24
BRF1-201ENST00000327359 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
BRF1-201ENST00000327359 FKBP8Q14318 412 aa22.79■■□□□ 1.24
BRF1-201ENST00000327359 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.79■■□□□ 1.24
BRF1-201ENST00000327359 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
BRF1-201ENST00000327359 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-201ENST00000327359 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-201ENST00000327359 SYNJ2O15056 1496 aa22.74■■□□□ 1.23
BRF1-201ENST00000327359 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 DISP1Q96F81 1524 aa22.7■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 CEP170Q5SW79 1584 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 HECW1Q76N89 1606 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 NCOA2Q15596 1464 aa22.68■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 KIAA0556O60303 1618 aa22.68■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.68■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.67■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.67■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.66■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-201ENST00000327359 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 JPH4Q96JJ6 628 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 NEFLP07196 543 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 37.9
BRF1-201ENST00000327359 NUP160Q12769 1436 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-201ENST00000327359 TRIM52Q96A61 297 aa22.55■■□□□ 1.2
BRF1-201ENST00000327359 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-201ENST00000327359 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
BRF1-201ENST00000327359 PTPRKQ15262 1439 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-201ENST00000327359 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.52■■□□□ 1.2
BRF1-201ENST00000327359 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
BRF1-201ENST00000327359 ARHGEF11O15085 1522 aa22.51■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 CCER2I3L3R5 266 aa22.51■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.51■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.5■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.48■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.47■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 ANP32CO43423 234 aa22.46■■□□□ 1.19
BRF1-201ENST00000327359 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
BRF1-201ENST00000327359 MSH5O43196 834 aa22.44■■□□□ 1.18
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