RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327359.7

BRF1-201, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

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Gene BRF1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-201ENST00000327359 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.46■■■□□ 2.95
BRF1-201ENST00000327359 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.77■■■□□ 2.2
BRF1-201ENST00000327359 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
BRF1-201ENST00000327359 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.06■■■□□ 2.08
BRF1-201ENST00000327359 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.99■■■□□ 2.07
BRF1-201ENST00000327359 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.45■■□□□ 1.98
BRF1-201ENST00000327359 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
BRF1-201ENST00000327359 ABCC9O60706 1549 aa27.21■■□□□ 1.95
BRF1-201ENST00000327359 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.9■■□□□ 1.9
BRF1-201ENST00000327359 SCRIBQ14160 1630 aa26.85■■□□□ 1.89
BRF1-201ENST00000327359 HRCP23327 699 aa26.83■■□□□ 1.89
BRF1-201ENST00000327359 NACADO15069 1562 aa26.75■■□□□ 1.87
BRF1-201ENST00000327359 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.5■■□□□ 1.83
BRF1-201ENST00000327359 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.47■■□□□ 1.83
BRF1-201ENST00000327359 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.41■■□□□ 1.82
BRF1-201ENST00000327359 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
BRF1-201ENST00000327359 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
BRF1-201ENST00000327359 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
BRF1-201ENST00000327359 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.14■■□□□ 1.77
BRF1-201ENST00000327359 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.03■■□□□ 1.76
BRF1-201ENST00000327359 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.97■■□□□ 1.75
BRF1-201ENST00000327359 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
BRF1-201ENST00000327359 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.83■■□□□ 1.72
BRF1-201ENST00000327359 WIZO95785 1651 aa25.81■■□□□ 1.72
BRF1-201ENST00000327359 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
BRF1-201ENST00000327359 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.72■■□□□ 1.71
BRF1-201ENST00000327359 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
BRF1-201ENST00000327359 SMARCA4P51532 1647 aa25.62■■□□□ 1.69
BRF1-201ENST00000327359 TRIM41Q8WV44 630 aa25.43■■□□□ 1.66
BRF1-201ENST00000327359 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
BRF1-201ENST00000327359 MYT1Q01538 1121 aa25.4■■□□□ 1.66
BRF1-201ENST00000327359 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
BRF1-201ENST00000327359 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.28■■□□□ 1.64
BRF1-201ENST00000327359 SMARCA2P51531 1590 aa25.23■■□□□ 1.63
BRF1-201ENST00000327359 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
BRF1-201ENST00000327359 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
BRF1-201ENST00000327359 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.14■■□□□ 1.61
BRF1-201ENST00000327359 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-201ENST00000327359 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-201ENST00000327359 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
BRF1-201ENST00000327359 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.01■■□□□ 1.59
BRF1-201ENST00000327359 ABCC8Q09428 1581 aa24.99■■□□□ 1.59
BRF1-201ENST00000327359 NCAPD3P42695 1498 aa24.75■■□□□ 1.55
BRF1-201ENST00000327359 HMGXB3Q12766 1538 aa24.68■■□□□ 1.54
BRF1-201ENST00000327359 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
BRF1-201ENST00000327359 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
BRF1-201ENST00000327359 SOGA1O94964 1423 aa24.63■■□□□ 1.53
BRF1-201ENST00000327359 NEUROD1Q13562 356 aa24.62■■□□□ 1.53
BRF1-201ENST00000327359 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
BRF1-201ENST00000327359 SYNJ1O43426 1573 aa24.55■■□□□ 1.52
BRF1-201ENST00000327359 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.54■■□□□ 1.52
BRF1-201ENST00000327359 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
BRF1-201ENST00000327359 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.49■■□□□ 1.51
BRF1-201ENST00000327359 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.46■■□□□ 1.51
BRF1-201ENST00000327359 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.44■■□□□ 1.5
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BRF1-201ENST00000327359 EEA1Q15075 1411 aa24.4■■□□□ 1.5
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BRF1-201ENST00000327359 CFTRP13569 1480 aa24.36■■□□□ 1.49
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BRF1-201ENST00000327359 TOP2BQ02880 1626 aa24.31■■□□□ 1.48
BRF1-201ENST00000327359 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.24■■□□□ 1.47
BRF1-201ENST00000327359 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.23■■□□□ 1.47
BRF1-201ENST00000327359 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.23■■□□□ 1.47
BRF1-201ENST00000327359 CUX1P39880 1505 aa24.22■■□□□ 1.47
BRF1-201ENST00000327359 CEP162Q5TB80 1403 aa24.2■■□□□ 1.47
BRF1-201ENST00000327359 GOLGA3Q08378 1498 aa24.2■■□□□ 1.47
BRF1-201ENST00000327359 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
BRF1-201ENST00000327359 PRDM2Q13029 1718 aa24.14■■□□□ 1.46
BRF1-201ENST00000327359 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.14■■□□□ 1.45
BRF1-201ENST00000327359 KIF21BO75037 1637 aa24.09■■□□□ 1.45
BRF1-201ENST00000327359 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.06■■□□□ 1.44
BRF1-201ENST00000327359 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.04■■□□□ 1.44
BRF1-201ENST00000327359 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
BRF1-201ENST00000327359 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
BRF1-201ENST00000327359 NESP48681 1621 aa24.03■■□□□ 1.44
BRF1-201ENST00000327359 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24■■□□□ 1.43
BRF1-201ENST00000327359 KIF27Q86VH2 1401 aa23.97■■□□□ 1.43
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BRF1-201ENST00000327359 CUX2O14529 1486 aa23.88■■□□□ 1.41
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BRF1-201ENST00000327359 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.82■■□□□ 1.4
BRF1-201ENST00000327359 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.8■■□□□ 1.4
BRF1-201ENST00000327359 TOPBP1Q92547 1522 aa23.77■■□□□ 1.4
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BRF1-201ENST00000327359 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.75■■□□□ 1.39
BRF1-201ENST00000327359 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
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BRF1-201ENST00000327359 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.69■■□□□ 1.38
BRF1-201ENST00000327359 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
BRF1-201ENST00000327359 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.67■■□□□ 1.38
BRF1-201ENST00000327359 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
BRF1-201ENST00000327359 APLP2Q06481 763 aa23.65■■□□□ 1.38
BRF1-201ENST00000327359 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.62■■□□□ 1.37
BRF1-201ENST00000327359 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.61■■□□□ 1.37
BRF1-201ENST00000327359 ARAP1Q96P48 1450 aa23.59■■□□□ 1.37
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